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"Des chercheurs affirment que les modifications CRISPR apportées à un embryon humain ont fonctionné." par Tina Hesman Saey

Traduction et compléments de Jacques Hallard

dimanche 4 novembre 2018, par Hesman Saey Tina


ISIAS Génétique
Des chercheurs affirment que les modifications CRISPR apportées à un embryon humain ont fonctionné. Des critiques en doutent encore et des rapports indiquent qu’une version d’un gène causant une maladie cardiaque aurait été corrigée mais reste contestée
L’article d’origine de Tina Hesman Saey a été publié le 08 août 2018 par Science News Genetics, Science & Society sous le titre « Researchers say CRISPR edits to a human embryo worked. But critics still doubt it » : il est accessible sur ce site : https://www.sciencenews.org/article/researchers-confirm-crispr-edits-human-embryo-worked?utm_source=email&utm_medium=email&utm_campaign=latest-newsletter-v2

human embryos

Altérés ou non ? – Des embryons humains ont été édités avec CRISPR / Cas9 pour réparer un gène pouvant provoquer une insuffisance cardiaque. Une étude de suivi prétend confirmer le résultat, mais d’autres scientifiques affirment que les embryons n’auraient peut-être pas été fixés. Salk Institute.

[Rappel selon Wikipédia, « Edition du génome - La correction de séquence génomique (Genome Editing pour les anglophones) ou « correction du génome avec des nucléases modifiées », (aussi désigné par l’acronyme GEEN, pour « genome editing with engineered nucleases »), ou souvent improprement appelée édition génomique ou édition du génome (expressions à éviter car le mot anglais ’editing’ ne correspond pas à édition), ou encore parfois dite édition génétique (mais cette expression est aussi à éviter car ayant d’autres sens1) regroupe un ensemble de techniques de manipulations du génome via la « réécriture du matériel génétique » 2. Ces techniques peuvent être appliquées aux plantes, aux animaux3, aux champignons et aux microbes. Certains laboratoires proposent d’aussi de les appliquer au génome humain… » Lire tous les détails sur ce site : https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89dition_g%C3%A9nomique].

Lorsque des chercheurs ont annoncé l’an dernier qu’ils avaient édité des embryons humains pour réparer un gène endommagé pouvant conduire à une insuffisance cardiaque, les critiques ont remis en question le rapport.

Maintenant, de nouvelles preuves confirment que la modification génétique a été un succès, le biologiste de la reproduction et du développement Shoukhrat Mitalipov et ses collègues rapportent le 8 août 2018 dans le revue ‘Nature’ : ’Toutes nos conclusions étaient fondamentalement correctes’, a déclaré Mitalipov, de l’Oregon Health & Science University à Portland, lors d’une conférence de presse le 6 août 2018.

Mais les auteurs de deux critiques publiées dans le même numéro de ‘Nature’ affirment qu’ils ne sont toujours pas convaincus.

[Voir la VIDEO - Comment fonctionnent les ciseaux moléculaires  ? Audrey Dufour, le 10/05/2017. A propos de ‘CRISPR / Cas9’ cité ci-après].


La manière dont le gène a été réparé est en cause. Mitalipov et ses collègues ont utilisé les ciseaux moléculaires CRISPR / Cas9 pour couper une version défectueuse d’un gène appelé MYBPC3 dans le sperme (SN : 9/2/17, p. 6). Les personnes qui héritent de cette version du gène développent souvent une insuffisance cardiaque. Couper le gène permet aux cellules de résoudre le problème en remplaçant les instructions erronées dans le gène par des informations correctes.

[Selon Wikipédia, « Le MYBPC3 (pour « Myosin binding protein C3 ») est une protéine musculaire exprimée dans le myocarde. Son gène est MYBPC3 situé sur le chromosome 11 humain. Rôle : il se fixe sur la myosine. Il intervient également dans le système ubiquitine-protéasome1. En médecine : des mutations du gène sont responsables d’une cardiomyopathie hypertrophique2 ou d’une cardiomyopathie dilatée3. Il peut être dosé dans le sang et son taux serait indicateur d’une lésion du muscle cardiaque de manière plus précoce que le dosage de la troponine4. Il pourrait ainsi être utilisé dans le diagnostic précoce d’un infarctus du myocarde5… Article complet sur https://fr.wikipedia.org/wiki/MYBPC3].

Les chercheurs ont fourni les informations correctes sous la forme de petites pièces d’ADN étrangères, mais les embryons ont ignoré ce modèle de réparation. Au lieu de cela, Mitalipov et ses collègues disent que les embryons ont utilisé une version saine du gène sur le chromosome de la mère pour corriger l’erreur. Cette action s’appelle la conversion de gène.

[D’après Wikipédia, « La conversion génique est le transfert non réciproque d’une information de séquence. L’échange peut se faire entre une paire de séquence non allélique (on parle dans ce cas de conversion génique), ou entre une paire de séquence allélique (dans ce cas on parle d’une conversion génique interallélique). Voir aussi sur les autres projets Wikimedia : conversion génique, sur le Wiktionnaire, Conversion génique biaisée. Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Conversion_g%C3%A9nique ].

La conversion des gènes se produit généralement lorsque des cellules reproductrices ou germinales s’échangent de l’ADN avant de fabriquer des oeufs et du sperme. Il était donc tout à fait inattendu de trouver ce type de réparation dans les embryons, explique le généticien Paul Thomas de l’Institut australien de recherche médicale d’Acton.

Si les embryons humains ne tiennent pas compte des fragments d’ADN étrangers, cela pourrait poser un problème pour réparer les maladies génétiques qui surviennent lorsque les deux parents transmettent des versions endommagées d’un gène. Dans ce scénario, il n’y aurait pas de version saine du gène à copier et à coller.

Mais Thomas et ses collègues proposent que le groupe de Mitalipov n’ait pas du tout détecté de conversion génétique. Au lieu de cela, de gros morceaux peuvent avoir été découpés dans le chromosome contenant la version défectueuse du gène et non remplacés. Cela ne résoudrait pas le gène défectueux, mais pourrait donner l’impression que la conversion génique avait eu lieu, trompant les chercheurs en leur faisant croire qu’ils avaient réparé.

Le groupe de Mitalipov a utilisé une technique appelée réaction en chaîne par polymérase, ou PCR, pour confirmer qu’il avait réparé la copie défectueuse du gène. La PCR a essentiellement photocopié des segments du gène réparé pour analyse. L’équipe a constaté que seule la version du gène de la mère était dans les embryons édités. Ce résultat a conduit les chercheurs à conclure que la conversion génétique avait copié la version maternelle du gène sur le chromosome du père.

Mais parce que les chercheurs n’ont pas été en mesure d’examiner de plus près le gène, ils ne peuvent pas être sûrs qu’il s’agit d’une conversion de gènes, dit Thomas. Couper une partie du gène du père ne laisserait que la version de la mère à copier lors de la PCR. Cela pourrait donner l’impression que le gène du père a été converti en la forme maternelle, lorsque ce fragment d’ADN est absent du gène du père.

Thomas et ses collègues ont déclaré dans une critique que ces grandes délétions d’ADN étaient courantes dans les expériences sur les souris. Environ 45 à 57% des embryons de souris testés manquaient de gros morceaux de matériel génétique. Mais Mitalipov et ses collègues n’ont pas signalé avoir trouvé de preuve que des portions d’ADN avaient été supprimées des embryons humains.

’Je trouve cela surprenant’, dit Thomas. Il doute que les données présentées dans le nouveau rapport résolvent complètement le problème.

Maria Jasin, biologiste du développement au Memorial Sloan Kettering Cancer Center de New York, voir The Maria Jasin Lab , reconnaît que le rapport original de Mitalipov manquait de preuves solides de correction génique. Le nouveau rapport présente des données plus convaincantes, ’mais je reste encore avec ce doute’, déclare Jasin, coauteur de l’autre critique. ’Je n’exclurais pas que la conversion de gènes puisse se produire’ dans de tels cas, dit-elle. Mais dans les expériences sur les souris, ce type de réparation est rare, dit-elle, et il n’y a aucune raison de supposer que les embryons humains le font plus fréquemment.

Bien que les scientifiques soient convaincus que les chercheurs seront en mesure de réparer les gènes brisés dans les embryons humains, ils n’en sont pas encore là, selon Jasin et Thomas.

Compte tenu de toutes les choses qui pourraient mal tourner avec l’édition de gènes, comme la réalisation accidentelle de mutations, il n’y a pas de place pour l’incertitude quant à savoir si la technique fonctionne. ’Vous devez être sûr à 100%,’ dit Thomas, ’et nous sommes sur un long chemin depuis notre prise de position’ .

Citations

H. Ma et al. Ma et al. reply. Nature. August 8, 2018. doi:10.1038/s41586-018-0381-y.

D. Egli et al. Inter-homologue repair in fertilized human eggs ? Nature. August 8, 2018. doi:10.1038/s41586-018-0379-5.

F. Adikusuma et al. Large deletions induced by Cas9 cleavage. Nature. August 8, 2018. doi:10.1038/s41586-018-0380-z.

Further Reading – Lectures complémentaires

T.H. Saey. CRISPR gene editing moved into new territory in 2017. Science News. Vol. 192, December 23, 2017, p. 21.

T.H. Saey. Gene editing of human embryos gets rid of a mutation that causes heart failure. Science News. Vol. 192, September 2, 2017, p. 6.

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Traduction, compléments entre […] et liens hypertextes : Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 02/11
/2018

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Fichier : ISIAS Génétique Researchers say CRISPR edits to a human embryo worked. But critics still doubt it French version.2

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