ISIAS

"Changements drastiques des caractéristiques particulières à l'espèce chez le peuplier génétiquement modifié (OGM) fabriqué par la technique CRISPR et mise à jour des techniques du ‘Nouveau génie génétique'" Par GMWatch

GMWatch — 2024-02-01T12:23:52Z

ISIAS OGM CRISPR Peuplier

Changements drastiques des caractéristiques particulières à l'espèce chez le peuplier génétiquement modifié (OGM) fabriqué par la technique CRISPR et mise à jour des techniques du ‘Nouveau génie génétique'

Traduction du 28 février 2024 – et ajout d'informations sur une mise à jour des techniques du Nouveau génie génétique (NGT ou New GE) - par Jacques Hallard d'un article publié le 22 janvier 2024 par ‘gmwatch.org' sous le titre Drastic changes in species-specific characteristics in CRISPR GMO poplar ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20361-drastic-changes-in-species-specific-characteristics-in-crispr-gmo-poplar

[Addenda - CRISPR-Cas9, ou plus simplement CRISPR, est une technique d'ingénierie de l'ADN qui permet d'ajouter, de modifier ou de supprimer une séquence spécifique du génome d'un être vivant, bactérie, plante ou animal. Contrairement aux techniques précédentes complexes à mettre en œuvre, CRISPR-Cas9 est facile à utiliser].

Les nouveaux OGM peuvent être radicalement différents de leurs homologues naturels sans modification génétique (OGM), même lorsque les modifications apportées sont apparemment mineures, écrit Testbiotech

Un examen des données dans les publications actuelles montre que la culture de plantes obtenues à partir d'un nouveau génie génétique (NGT ou New GE) peut être utilisée pour modifier radicalement les caractéristiques spécifiques à l'espèce des peupliers.

Aucun gène supplémentaire n'a besoin d'être inséré et les arbres n'ont pas à produire de protéines nouvelles ou modifiées. Les peupliers ne commencent à fleurir dans la nature qu'après sept à dix ans, mais dans les expériences, après des interventions basées sur des ciseaux génétiques CRISPR, ils ont fleuri après seulement quatre mois. Seuls des changements mineurs dans les gènes régulateurs ont été nécessaires pour obtenir de tels résultats.

Le but de l'intervention : à l'instar des plantes cultivées, des peupliers génétiquement modifiés à floraison précoce pourraient être multipliés, croisés et sélectionnés, accélérant ainsi éventuellement l'introduction sur le marché de nouveaux peupliers génétiquement modifiés.

Un peuplier peut produire des milliards de graines et d'énormes quantités de pollen au cours de sa vie, que le vent peut disperser sur plusieurs kilomètres. L'ADN génétiquement modifié ne se propage pas seulement par le pollen et les graines, mais aussi par les repousses ou drageons.

Les arbres ont des interactions complexes avec leur environnement, y compris d'autres espèces végétales, des mycorhizes (champignons du sol), des insectes et des espèces sauvages. Le peuplier est une source de nourriture importante pour de nombreux insectes, tels que les coléoptères, les papillons et les espèces d'abeilles.

Si les arbres génétiquement modifiés se croisent avec des arbres de populations indigènes de peupliers, les gènes modifiés peuvent se propager rapidement. Par exemple, cela peut entraîner l'effondrement de la population naturelle de peupliers, car ses nouvelles caractéristiques ne sont pas adaptées à l'environnement.

Par conséquent, entre autres, les nouveaux arbres GM peuvent mettre en danger la survie des espèces de peupliers noirs protégées. Les dommages peuvent très bien être irréversibles, car les gènes génétiquement modifiés ne peuvent pas être rappelés de l'environnement.

La Commission de l'environnement du Parlement européen votera mercredi cette semaine sur la future réglementation des plantes obtenues à partir de nouvelles techniques de génie génétique (NGTS). Si la rapporteure responsable, Jessica Polfjärd (PPE), réussit à faire adopter le vote, alors les arbres et arbustes génétiquement modifiés ainsi que les plantes cultivées, les herbes et les fleurs pourraient tous être libérés dans l'environnement sans subir d'évaluation des risques.

En revanche, des membres du Parlement européen, tels que Christoph Clergeau (S & D) ou Martin Häusling (Verts / ALE), exigent une évaluation obligatoire des risques pour toutes les usines de NGT.

[Addenda

À propos - Christophe Clergeau, né le 1ᵉʳ septembre 1968 à Nantes, est un homme politique français, membre du Parti socialiste. Le 2 juin 2023, il devient député européen, en remplacement d'Éric Andrieu, démissionnaire. Il est conseiller régional des Pays de la Loire depuis 2004… Wikipédia

À propos - Martin Häusling, né le 26 mars 1961 à Bad Wildungen, est un homme politique allemand, membre de l'Alliance 90/Les Verts. Wikipédia ]

Cette position, par exemple, s'appuie sur l'analyse de l'Agence Française de Sécurité Sanitaire de l'Alimentation, de l'Environnement et du Travail (ANSES, 2023) ou de la Société Écologique d'Allemagne, d'Autriche et de Suisse (GFOE) qui met particulièrement en garde contre les risques des espèces sauvages.

Dans ce contexte, la professeure écologiste Katja Tielbörger a averti qu'environ 300.000 espèces de plantes sauvages pourraient être touchées par la déréglementation prévue, avec des conséquences imprévisibles et néfastes pour l'écologie et la biodiversité.

Testbiotech demande instamment le rejet de la déréglementation prévue et la poursuite de l'évaluation obligatoire des risques de toutes les plantes issues du nouveau génie génétique (NGT ou New GE) au cas par cas.

Informations complémentaires :

Project Genetic Engineering and the Environment : background on NGT poplar

The GfOE opinion

Background : '10 questions and answers : What do we really know about NGT plants ?'

Background : 'New genetic engineering (NGT) : EU Parliament in the maze'

Source : Testbiotech

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Source de l'article traduit : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20361-drastic-changes-in-species-specific-characteristics-in-crispr-gmo-poplar

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Annexe sur Nouveau génie génétique (NGT ou New GE)

Les organismes génétiquement modifiés (OGM) - Le Jeudi 22 septembre 2022 - Accueil - Ministère de la Transition Écologique et de la Cohésion des Territoires

Les organismes génétiquement modifiés (OGM) : retrouvez des informations concernant leur définition, les différents domaines d'utilisation et leurs réglementations.

Qu'est-ce qu'un organisme génétiquement modifié (OGM) ?

Définition

L'acronyme OGM signifie « Organisme Génétiquement Modifié ».

Sur le plan scientifique, il n'en existe pas de définition unique, mais le terme est généralement associé à un organisme (animal, végétal, bactérie) qui a été modifié par des techniques de génie génétique. Ces techniques, réalisées en laboratoire, permettent d'ajouter de nouveaux gènes, ou de supprimer ou modifier des gènes déjà présents dans l'organisme, afin, généralement, de lui faire acquérir de nouvelles caractéristiques.

D'un point de vue règlementaire, les textes européens (et en particulier la directive européenne 2001/18/CE) définissent un OGM comme un « organisme, à l'exception des êtres humains, dont le matériel génétique a été modifié d'une manière qui ne s'effectue pas naturellement par multiplication et/ou par recombinaison naturelle ».

Le champ d'application des techniques OGM est large, allant de l'agriculture à l'industrie, en passant par le domaine médical.

Transgenèse et nouvelles techniques de sélection

La technique historique qui a longtemps été utilisée pour créer des OGM est la transgenèse. Elle consiste à ajouter un ou plusieurs gènes d'une autre espèce dans le génome de l'organisme, dans le but d'en modifier les caractéristiques.

Contrairement à la technique de croisement traditionnelle qui ne s'applique qu'à des espèces proches parentes ou identiques, la transgenèse peut être réalisée à partir d'espèces différentes.

Le maïs MON810, seul OGM autorisé à la culture dans l'Union Européenne, est issu de transgenèse : il a été conçu par l'ajout d'un gène provenant d'une bactérie du sol Bacillus thuringiensis qui permet à la plante de produire une molécule insecticide.

Plus récemment, et en particulier depuis le début des années 2000, de nouvelles techniques de génie génétique se sont développées pour modifier le génome de manière ciblée, de moduler l'expression des gènes ou d'appliquer la transgenèse dans des situations particulières. Ce sont les nouvelles techniques de sélection (ou « NBT » pour New Breeding Techniques). Contrairement à la transgenèse, ces techniques n'impliquent pas nécessairement l'ajout de gènes entier issus d'autres espèces dans l'organisme final. En revanche, les différentes étapes de génie génétique menées pour obtenir ces organismes peuvent impliquer de recourir à de la transgenèse, même si aucun gène extérieur n'est censé être présent dans l'organisme final (hors effets indésirables).

Ces techniques comprennent par exemple :

– la mutagenèse dirigée : induction de mutations aléatoires ou non au niveau d'un site précis du génome ; cette famille de technique, la plus utilisée à ce jour, fait souvent appel aux « ciseaux génétiques » CRISPR-Cas9.

– la cisgenèse ou intragenèse : transgenèse réalisée à partir de gènes issus soit de la même espèce soit d'espèces compatibles sexuellement.

– l'agro-infiltration : mise en contact des cellules des tissus des plantes avec des bactéries OGM contenant le ou les gènes d'intérêt, ce qui permet transitoirement leur expression par la plante.

La question du statut réglementaire de ces nouvelles techniques a été tranchée le 25 juillet 2018 par un arrêt de la Cour de justice de l'Union européenne, en réponse à des questions préjudicielles adressées par le Conseil d'État français. L'arrêt de la Cour confirme que les produits de ces nouvelles techniques doivent être encadrés par les mêmes règles que celles appliquées aux OGM issus de transgenèse, car seuls peuvent être exclus du champ d'application de la directive 2001/18/CE sur les OGM « les organismes obtenus au moyen de techniques/méthodes de mutagenèse qui ont été traditionnellement utilisées pour diverses applications et dont la sécurité est avérée depuis longtemps ».

A la suite de cet arrêt, la Commission européenne a annoncé, fin avril 2021, souhaiter lancer une initiative législative pour faire évoluer la réglementation applicable aux plantes dérivées de certaines NBT uniquement (celles issues de mutagenèse ciblée et de cisgenèse). Une potentielle évolution de la réglementation sur ce point n'est pas attendue avant 2023.

Les différentes utilisations des OGM

L'utilisation la plus connue des OGM est dans le domaine agricole, avec en particulier l'utilisation de plantes ou d'animaux génétiquement modifiés. Cependant, les OGM sont également largement utilisés pour :

La recherche fondamentale pour mieux comprendre certains mécanismes biologiques ;
L'industrie, afin par exemple de produire certaines molécules d'intérêt ;
La santé, où des micro-organismes OGM sont utilisés pour la production de vaccins ou de médicaments (insuline par exemple) ou encore comme vecteur pour des thérapies géniques.
Etat des lieux de l'utilisation des OGM

Pour les plantes génétiquement modifiées

Dans le monde

La surface mondiale cultivée d'OGM correspond en 2019 à 190 millions d'hectares soit environ 10% des surfaces totales cultivées selon l'ISAAA.

Les plus gros producteurs mondiaux sont les Etats-Unis, le Brésil, l'Argentine, le Canada et l'Inde. À eux cinq, ils totalisent 91% des surfaces d'OGM cultivées en 2019.

Les quatre plantes OGM les plus cultivées sont le coton, le soja, le maïs et le colza. En surface, elles correspondent à 99% des cultures OGM. Le reste se partage principalement entre la luzerne et les betteraves sucrières, mais il existe également quelques autres fruits et légumes. Les techniques OGM sont également utilisées pour la création de fleurs d'ornement.

Dans le domaine agricole, les deux caractéristiques les plus répandues parmi les OGM sont, à ce jour :

– la tolérance à certains herbicides, par l'introduction d'un trait dit « TH », pour « tolérant aux herbicides ». L'introduction de ce trait permet, dans certains cas, une gestion facilitée du désherbage pour les agriculteurs, mais s'accompagne de problèmes environnementaux significatifs, notamment en terme de surconsommation d'herbicides.

– la résistance aux insectes ravageurs, grâce à la production par la plante d'un insecticide ciblé, par l'introduction d'un trait dit « Bt », pour « Bacillus thuringiensis ».

99% des surfaces cultivées de plantes OGM correspondent à des variétés possédant l'une, l'autre ou les deux caractéristiques combinées. La diversité des plantes OGM produites est donc particulièrement faible.

Dans l'Union Européenne

Seule une variété d'OGM est autorisée à la culture au sein de l'Union européenne : le maïs MON810, modifié pour acquérir une résistance à certaines insectes ravageurs (trait Bt).

Il n'est cultivé que dans deux pays : en Espagne (107 000 hectares en 2019) et au Portugal (5 000 hectares en 2019). Ces surfaces sont inférieures à 0,1% de la totalité des surfaces européennes cultivées.

En outre, de nombreux OGM sont autorisés à l'importation au sein de l'Union Européenne. 78 variétés végétales sont, en 2021, autorisées à l'importation. Elles sont essentiellement destinées à l'alimentation animale (tourteaux de soja par exemple) : ainsi, selon l'ISAAA, 70% des importations destinées à l'alimentation animale dans l'Union Européenne sont issues de plantes génétiquement modifiées en 2019.

La liste des produits autorisés pour l'importation et l'utilisation en alimentation humaine et animale et les informations relatives aux autorisations sont accessibles dans le registre de la Commission européenne.

En France

La culture d'OGM à des fins commerciales est interdite en France depuis 2008.

La France a d'abord fait usage des clauses de sauvegarde et mesures d'urgence prévues par la directive 2001/18/CE et le règlement 1829/2003 pour interdire la culture, sur son territoire, du maïs MON810. Ainsi, la loi n°2015-567 du 2 juin 2014 interdit la mise en culture des variétés de maïs génétiquement modifié.

Depuis 2015, la France utilise les nouvelles dispositions introduites par la directive 2015/412 sur la mise en culture des OGM. Elle a ainsi demandé à être exclue de la portée géographique des autorisations et des demandes d'autorisation pour la mise en culture. L'interdiction de culture concerne le maïs MON810, seul OGM autorisé à la culture au niveau européen.

Les OGM autorisés à l'importation et à la mise sur le marché dans l'Union européenne sont également autorisés en France pour les mêmes usages. Leur commercialisation est soumise aux exigences prévues dans la réglementation européenne, notamment aux règles de traçabilité et d'étiquetage.

Pour les autres utilisations d'OGM

Animaux

Des millions d'animaux transgéniques sont, chaque année, utilisés en laboratoire à des fins de recherche : ce sont principalement des rats, mais aussi des lapins, des chèvres, des vaches… Ils sont utilisés pour étudier les mécanismes génétiques, mimer des maladies humaines, tester ou synthétiser des molécules. Selon les rapports de la commission européenne, 2,59 millions d'animaux génétiquement modifiés ont été utilisés à des fins de recherche en 2017 dans l'Union Européenne.

Cependant, peu d'animaux transgéniques ont été autorisés à la commercialisation au niveau mondial, et aucun au niveau européen. Au Canada, des saumons transgéniques ont été commercialisés.

Par ailleurs, des poissons génétiquement modifiés ont été créés à des fins décoratives.

Enfin, des moustiques génétiquement modifiés sont utilisés dans le cadre de la lutte anti-vectorielle. Ainsi, des moustiques Aedes aegypti transgénique ont été disséminés, notamment au Brésil et aux Etats-Unis. Ce moustique transgénique doit permettre de lutter contre plusieurs maladies vectorielles.

Les nouvelles techniques de modification génétique, en particulier Crispr-Cas9, ont accéléré la recherche afin de développer de nouveaux animaux OGM à des fins d'élevage et de consommation. Des projets ont par exemple été menés pour obtenir des moutons avec un système musculaire hypertrophié ou des poissons avec une plus grande efficience alimentaire.

Industrie

Certaines industries ont recours aux OGM. C'est le cas de l'industrie des plastiques biodégradables, de l'industrie de la pâte à papier ou de l'industrie textile.

Par ailleurs, certains biocarburants sont produits à partir de colza transgénique.

Santé

De nombreux médicaments peuvent contenir des protéines produites par le biais de bactéries, levures ou cellules génétiquement modifiées. On peut citer l'insuline, utilisée dans le traitement du diabète, produite par une bactérie Escherichia coli modifiées, certaines hormones de croissance, ou encore des protéines utilisées dans le traitement de certains cancers.

Certains vaccins relèvent de la réglementation OGM. Ainsi, parmi les vaccins contre la Covid-19, c'est le cas de ceux à adénovirus recombinants (développés par exemple par les sociétés AstraZeneca ou Johnson & Johnson).

Enfin, la thérapie génique est utilisée pour soigner certaines maladies génétiques. Son administration est également encadrée par la réglementation OGM.

Le forçage génétique

La technique du forçage génétique (« Gene drive ») consiste à introduire dans des organismes vivants une modification génétique qui se transmet de manière quasi-certaine à la descendance. Ceci permet de modifier génétiquement ou d'éradiquer l'ensemble d'une population, voire d'une espèce, à partir de la dissémination de quelques individus.

Les applications potentielles n'en sont qu'au stade de la recherche, voire du concept. Cependant la recherche progresse rapidement sur le forçage génétique appliqué aux insectes, notamment aux moustiques, et de premières utilisations pourraient émerger avant la fin de cette décennie.

Les principales applications envisagées à ce stade sont la lutte anti-vectorielle (par la dissémination de moustiques pour lutter contre la malaria par exemple), l'agronomie (transmission d'un caractère de stérilité ou létalité à des nuisibles), ou encore la lutte contre les espèces nuisibles ou invasives (éradication par transmission d'un caractère létal).

Les implications écologiques, sociales et éthiques de cette technologie sont majeures. Les risques environnementaux potentiels sont significatifs, tout comme les incertitudes restant à lever, aussi bien en ce qui concerne la technique en elle-même que les méthodes d'évaluation et de maîtrise des risques.

En raison de la capacité des gènes forcés à rester à long terme, voir indéfiniment, dans l'environnement, et de leur capacité de dispersion, l'étape d'évaluation des risques est cruciale, et la dissémination de tels organismes ne peut être envisagée avant que toutes les incertitudes ne soient levées.

Risques associés

Risques sanitaires

À ce jour, la consommation d'OGM n'a pas provoqué d'effets indésirables connus sur la santé. Ceci est notamment lié au fait que les OGM commercialisés sont soumis à des évaluations des risques stricts, afin d'assurer qu'ils n'ont pas d'effets négatifs sur la santé et l'environnement.

Il est donc nécessaire de poursuivre les évaluations sanitaires avant toute commercialisation, afin de prévenir tout risque pour la santé, et en vertu du principe de précaution. En effet, tout organisme génétiquement modifié peut potentiellement présenter un risque lié à la manipulation génétique elle-même (conséquences non anticipées dues au caractère aléatoire de la manipulation génétique), mais également des traits introduits et de leur interaction avec l'environnement. En particulier, certains gènes introduits peuvent ne jamais avoir été présents dans un organisme ou un produit auparavant.

Il est également nécessaire d'exercer une surveillance à long terme pour détecter rapidement tout effet indésirable éventuel.

Ces risques potentiels, communs à l'ensemble des OGM, peuvent se retrouver amplifiés dans le cas de recours à une nouvelle technique de sélection (NBT) du fait des effets hors-cible et du ‘multiplexing'. Les effets hors cibles sont les effets non intentionnels liés à l'étape de modification génétique en elle-même tandis que le ‘multiplexing' consiste à modifier simultanément plusieurs sites du génome par une seule manipulation.

Risques environnementaux

La culture d'OGM de manière non contrôlée comporte des risques environnementaux significatifs.

Les plantes génétiquement modifiées (GM) peuvent se croiser avec des variétés sauvages et disséminer leurs gènes de manière incontrôlée dans la nature. A titre d'exemple, une plante génétiquement modifiée pour être tolérante à un herbicide risque de transmettre cette tolérance à des plantes sauvages de la même famille.

Les plantes GM qui produisent une protéine insecticide peuvent ne pas être nocives uniquement pour les insectes cibles mais peuvent aussi affecter d'autres espèces d'insectes (dits non cibles), qui jouent un rôle dans l'équilibre écologique global en étant, par exemple, prédateur de parasites. Enfin, l'utilisation en continu de ces plantes génétiquement modifiées pour sécréter des insecticides favorise l'apparition, chez les insectes cibles, de la résistance à la molécule insecticide.

Les surfaces d'OGM cultivées en 2019 correspondent à 89% à des variétés rendues tolérantes aux herbicides (VrTH). La culture de VrTH est susceptible d'entrainer une augmentation de l'utilisation d'herbicide et donc une pollution accrue des milieux (air, sol, eaux) ainsi que l'apparition de résistance aux herbicides parmi les adventices (« mauvaises herbes »).

Plus spécifiquement concernant les nouvelles techniques de sélection (NBT), il existe un risque de déstabilisation des écosystèmes en raison de la rapidité accrue de sélection des plantes. En effet, une plante avec un trait favorable peut se comporter comme une plante invasive dans les écosystèmes, et la dissémination trop rapide dans la nature de plantes génétiquement modifiées peut remettre en cause les équilibres naturels existants.

Enfin, la très faible diversité de traits aujourd'hui obtenus par les techniques de génie génétique et la nature de ces traits encourage le développement de systèmes agricoles non durables (monocultures, rotations courtes) avec des impacts sur la biodiversité et la résilience des écosystèmes.

Risques socio-économiques

L'un des principaux risques socio-économiques est lié à la question des brevets et de la propriété industrielle.

En effet, au niveau européen comme français, les plantes et variétés obtenues par des méthodes de sélection « essentiellement biologiques » sont exclues du principe de brevetabilité. Ce principe de non-brevetabilité du vivant a été réaffirmé par la loi pour la reconquête de la biodiversité de 2016.

A l'inverse des plantes obtenues par sélection classique (procédé « essentiellement biologique »), les plantes génétiquement modifiées peuvent être brevetées, leur processus d'obtention ayant recours à des techniques de génie génétique, ne pouvant être considérées comme des techniques « essentiellement biologiques ». Ceci constitue alors une exception importante au principe de non-brevetabilité du vivant.

Si une plante est brevetée, cela signifie qu'il est interdit de garder une partie de la récolte pour la réutiliser en tant que semence de l'année suivante, et qu'il est impossible de s'échanger des semences. Autrement dit, le brevet entraîne une 'stérilité juridique' des plantes agricoles, de laquelle découle un appauvrissement de la diversité des cultures.

A cela s'ajoute :

le fait que le coût de la semence est augmenté par les redevances dues aux semenciers ;
la dépendance importante des agricultures utilisant ces semences à un même semencier, souvent avec des systèmes de ventes liées « semences + herbicides » pour les variétés tolérances aux herbicides ;
un rôle majeur dans la concentration du secteur des semences. L'introduction de traits protégés par des brevets dans les OGM issus de transgénèse a en effet conduit à la constitution d'oligopoles, alors qu'il s'agit justement jusque-là d'un système constitué de beaucoup d'acteurs de taille faible ou moyenne. Ainsi, une étude de 2013 du Commissariat général à la stratégie et à la prospective en France a montré que seulement dix grandes firmes multinationales contrôlent 60 % du marché mondial formel des semences, la majorité de ces groupes étant issue de l'industrie chimique. Selon l'étude, cette récente concentration est en partie liée aux recours aux traits protégés par les brevets et cette concentration croissante et accélérée a été identifiée en 2013 comme préoccupante par le Haut Conseil des biotechnologies car elle met en péril la diversité des systèmes d'innovation et, in fine, la diversité des variétés cultivées.
enfin, certaines craintes portent sur le fait qu'un brevet portant sur une plante obtenue par une technique de modification génétique puisse être étendu à la même plante, obtenue cette fois par une technique de sélection conventionnelle.
Un autre risque socio-économique porte sur les possibles contaminations de cultures non-OGM par des cultures génétiquement modifiées des champs environnants. Ces contaminations peuvent engendrer des pertes importantes, lorsque, par exemple, un agriculteur en agriculture biologique ou labellisée « sans OGM » subit une contamination par des plantes génétiquement modifiés sur ses parcelles. Sa récolte sera alors déclassée.

Questionnement et risques éthiques

La modification du génome, ciblée ou non, est un outil utilisé depuis des décennies, notamment en médecine ou en agronomie. Cependant, ces dernières années, les technologies utilisées ont connu des avancées scientifiques majeures, et l'utilisation qui peut en être faite amène à des questions d'ordre éthique. Dans son avis 133, le Comité consultatif national d'éthique (CCNE) en soulève notamment deux :

– la transmission des modifications génétiques à la descendance,

– la maîtrise incomplète des techniques, ce qui entraîne une incertitude quant à leurs effets à court et à long terme sur les individus et la biodiversité.

Plus généralement, l'enjeu éthique repose sur le fait d'utiliser ou non ces techniques. Serait-il éthiquement acceptable de se priver de ces techniques ? En effet, la facilité d'utilisation des nouvelles techniques d'édition du génome, notamment avec la technologie de Crispr-Cas9 et le flou réglementaire qui les encadre, peut rendre leur application à court-terme intéressante. Cependant, avec la facilité et la rapidité avec lesquelles les modifications génétiques peuvent être réalisées, il est souvent omis le fait que la ressource génétique présente sur Terre résulte de plusieurs milliards d'années d'évolution. Il est donc nécessaire de replacer l'utilisation de ces techniques, ainsi que leurs risques associés, dans cette temporalité.

Par ailleurs, outre l'enjeu éthique autour de l'utilisation même de ces techniques, il existe un enjeu autour des conséquences de l'utilisation de ces techniques dans certains domaines, ou autour de certaines applications possibles.

En effet, dans le domaine végétal, l'enjeu de la propriété intellectuelle peut être soulevé. Deux systèmes permettant de protéger la propriété intellectuelle relative à la création de variétés végétale existent. L'un est le Certificat d'Obtention Végétale (COV) et l'autre est le brevet. Le COV garantit un droit d'auteur au créateur d'une nouvelle variété végétale en lui attribuant un droit d'exploitation exclusif, mais permet aussi aux acteurs du secteur végétal (les sélectionneurs) d'avoir accès à l'ensemble de la ressource génétique pour créer de nouvelles variétés, sans avoir à solliciter l'autorisation du titulaire du COV portant sur les variétés utilisées. Il s'agit du principe de l'exemption du sélectionneur, prévue par l'article 15 de la convention internationale pour la protection des obtentions végétales. Le brevet, à la différence du COV, ne porte pas sur une variété végétale, mais sur une invention contenue dans la variété (par exemple un nouveau trait). Il protège l'invention, mais aussi le produit obtenu grâce à l'invention, d'après la directive 98/44/CE du parlement européen et du conseil du 6 juillet 1998 relative à la protection juridique des inventions biotechnologiques. Ainsi, un sélectionneur ne peut utiliser une variété qui fait l'objet d'un brevet qu'après accord du titulaire du brevet et la nouvelle variété obtenue ne peut être commercialisée que si le trait qui fait l'objet du brevet n'est plus présent ou ne s'exprime plus. L'enjeu autour de la propriété intellectuelle est donc la possibilité d'une privatisation de la ressource génétique avec le dépôt de brevets sur certains gènes ou ensemble de gènes.

En élevage, l'application des nouvelles techniques de sélection génétique permettent d'accélérer les démarches traditionnelles de sélection, parfois au détriment du bien-être animal.

L'utilisation des nouvelles techniques génétiques, notamment avec CRISPR-Cas9, peut aussi amener à des dérives, en fonction des applications visées.

La possibilité d'utilisation de ces techniques, en particulier sur des bactéries ou des virus, dans un objectif de bioterrorisme n'est pas à négliger. Certaines expériences ont déjà été réalisées, avant même le développement de l'utilisation de CRISPR-Cas9. Cela a par exemple été le cas en 2011, avec un virus H5N1, qui a été génétiquement modifié pour être plus virulent et contagieux car transmissible aussi par les mammifères.

La facilité d'utilisation des techniques, mais aussi la possibilité de transmission de la modification à la descendance peut entraîner des conséquences plus que controversées, notamment dans une utilisation sur l'être humain. Le protocole de Belmont établit les principes liés aux recherches et applications médicales sur des sujets humains. Il préconise que les actions menées doivent :

– impérativement ne pas être susceptibles de nuire à l'individu ou à la collectivité humaine ;

– être pertinentes, en rapport avec l'état de l'art, minimisant les risques encourus ;

– respecter l'autonomie de la personne qui doit être partie prenante de la décision médicale ou scientifique dans le cadre d'un consentement éclairé ;

– avoir comme but essentiel d'amener de la bienfaisance individuelle et /ou collective ;

– relever enfin tout à la fois de la justice, de l'équité et de la solidarité.

Cependant, dans l'objectif de préserver l'humain contre des handicaps ou des affections graves, la frontière de l'eugénisme peut très vite être franchie. Cette ligne a d'ailleurs été franchie en 2018, avec l'annonce de la naissance de jumelles après implantation d'embryons génétiquement modifiés, en absence de toute pathologie. Cette annonce a été unanimement condamnée par la communauté scientifique, d'une part pour le fait qu'une telle pratique est à l'opposé de toute déontologie de recherche et qu'aucune réflexion éthique n'a été menée, et d'autre part pour l'utilisation d'une méthode non maitrisée, qui peut entraîner des modifications génétiques annexes dont les effets restent inconnus. Cela a notamment rouvert le débat sur la nécessité d'un moratoire internationale.

En France, même si le Conseil d' Etat prônait, dans son rapport de 2018, une ouverture de la recherche « pour éviter que la faisabilité technique ne préempte le nécessaire débat de principe », toute expérimentation sur le génome humain est interdite, par l'article 13 de la convention d'Oviedo, ainsi que par l'article 16-4 du code civil.

Ainsi, l'utilisation de ces techniques peut être prometteuse dans certains domaines, mais il est à considérer que d'autres solutions existent, moins imprévisibles et éthiquement questionnables. Les techniques de modifications du génome, souvent présentées comme révolutionnaires, ne devraient être envisagées qu'en dernier recours, après une évaluation exhaustive des risques. En ce sens, d'après l'avis du CCNE, il apparaît nécessaire d'analyser en tant que plante génétiquement modifiée toute plante ou champignon comportant un transfert génétique interspécifique ainsi que toute modification génétique ciblée. Ainsi, cela permettra de considérer leur potentiel impact sur la santé humaine et les écosystèmes, du fait des incertitudes subsistant quant aux effets indirects susceptibles d'être engendrés.

Avis 133 du CCNE

La réglementation européenne et française

La réglementation européenne distingue les utilisations confinées des utilisations disséminées.

Les utilisations confinées sont encadrées par la directive 2009/41/CE relative à l'utilisation en milieu confiné de micro-organismes.

Les utilisations disséminées sont encadrées par :

la directive 2001/18/CE relative à la dissémination volontaire d'OGM dans l'environnement (concerne les expérimentations et la mise en marché des semences) ;
les règlements (CE) n°1829/2003 concernant les denrées alimentaires et les aliments génétiquement modifiés et n°1830/2003 concernant la traçabilité et l'étiquetage des OGM (concerne la mise en marché des produits).
Au niveau national, ces règlementations sont principalement transcrites dans le code de l'environnement (titre III du livre V).

L'utilisation confinée d'OGM

L'utilisation confinée d'OGM est encadrée au niveau européen par la directive 2009/41/CE, transposée au niveau national dans le code de l'environnement. Celui-ci prévoit que toute utilisation d'OGM qui peut présenter des risques potentiels pour la santé publique ou l'environnement est réalisée de manière confinée, dans des conditions définies par l'autorité administrative.

Les OGM sont classés en quatre groupes selon leur dangerosité pour l'environnement et la santé humaine. Une classe de confinement est ensuite associée en fonction du groupe de l'organisme et des caractéristiques de l'opération.

La réglementation introduit la notion de déclaration ou d'autorisation des utilisations, ainsi qu'une notion d'agrément des installations :

les utilisations confinées d'OGM rangés dans la classe de confinement 1 (risque nul ou négligeable) sont soumises à déclaration.
les utilisations confinées d'OGM rangés dans les classes de confinement 2 à 4 (risque faible à élevé) sont soumises à autorisation.
Les installations dans lesquelles sont mises en œuvre les utilisations confinées doivent être agréées
Toutefois, lorsqu'une utilisation confinée rangée dans la classe de confinement 1 est mise en œuvre dans une installation déjà agréée pour une classe 1 ou supérieure, cette utilisation se déroule sans nouvelle déclaration. Un dossier d'évaluation des risques est tenu à disposition de l'autorité compétente.

De même, lorsqu'une utilisation confinée rangée dans la classe de confinement 2 est mise en œuvre dans une installation déjà agréée pour une classe 2 ou supérieure, cette utilisation est soumise à simple déclaration.

Dans le cas de l'utilisation confinée d'OGM à des fins de recherche, de développement et d'enseignement, les déclarations d'utilisation et les demandes d'autorisation d'utilisation sont adressées au ministre chargé de la recherche. Celui-ci transmet les demandes d'autorisation au comité d'expertise des utilisations confinées d'organismes génétiquement modifiés (CEUCOGM) pour avis.

Dans le cas de l'utilisation confinée d'OGM à des fins de production industrielle, l'autorité compétente est le préfet du département où se situe l'installation. Celui-ci saisit le CEUCOGM du dossier reçu. Cette utilisation confinée d'OGM est également soumise aux dispositions réglementaires sur les installations classées pour la protection de l'environnement (ICPE), au titre de la rubrique 2680 de la nomenclature ICPE.

Le récépissé de déclaration d'utilisation tout comme l'autorisation d'utilisation sont délivrés pour une durée qui ne peut pas excéder 5 ans et ne valent que pour l'utilisation confinée prévue.

Une procédure spécifique s'applique pour les essais cliniques de médicaments OGM (voir le site de l'ANSM).

https://www.ecologie.gouv.fr/sites/default/files/styles/standard/public/graphique%20comp%C3%A9tences%20utilisation%20confin%C3%A9e.jpg?itok=MceIsRwd

Site Internet de l'ANSM

Manuel du confiné (PDF - 3.52 Mo)

L'utilisation disséminée d'OGM

Dissémination volontaire à toute autre fin qu la mise sur le marché (expérimentation)

La procédure d'autorisation pour des expérimentations d'OGM (utilisation disséminée à tout autre fin que la mise sur le marché) est une procédure nationale. Ces expérimentations, qui regroupent toutes les disséminations d'OGM à d'autres fins que la mise sur le marché, concernent tout type d'OGM (plantes, animaux, médicament vétérinaires, produits de thérapies géniques…) et ont pour but la recherche ou l'évaluation d'un OGM en vue d'une mise sur le marché. Cette procédure d'autorisation est encadrée par la directive européenne 2001/18/CE, transcrite dans le code de l'environnement.

Le demandeur dépose un dossier à l'autorité compétente de l'État membre. Celle-ci s'assure de la recevabilité du dossier et peut délivrer ou non l'autorisation après consultation du public sur Internet, évaluation par l'Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (Anses) et accord du ministère de la transition écologique (dans le cas où celui-ci n'est pas l'autorité compétente).

La réglementation prévoit également une information du public une fois l'autorisation accordée avec, notamment, la mise à disposition d'une fiche d'information au public accessible en mairie. La Commission européenne est également informée.

Dissémination volontaire dans le cadre d'une autorisation de mise sur le marché (AMM)

Si l'OGM est destiné à l'alimentation humaine ou animale, cette procédure est fixée par le règlement (CE) n°1829/2003 et est directement applicable aux États membres de l'Union européenne. Sinon (dans le cas par exemple des plantes ornementales), elle est fixée par la directive européenne 2001/18/CE qui est déclinée dans le droit français dans le code de l'environnement.

Pour commercialiser un produit contenant ou dérivant d'OGM, une entreprise doit effectuer une demande auprès d'un État membre.

Dans le cas d'OGM destiné à l'alimentation, le dossier est transmis à l'EFSA (‘European Food Safety Authority') qui est chargée de l'évaluation des risques environnementaux et sanitaires. Suite à l'avis de l'EFSA et à la consultation des États membres, la Commission européenne prépare un projet de décision et le soumet au vote de ces derniers. Dans le cas où ce projet ne recueille pas de majorité qualifiée [1] pour ou contre, il appartient in fine à la Commission de prendre une décision pour autoriser ou non sa commercialisation.

Si l'OGM n'est pas destiné à l'alimentation, l'État membre qui a reçu le dossier établit directement un rapport d'évaluation dans lequel il indique si l'OGM peut être mis sur le marché ou non. Si l'avis est favorable, la Commission européenne consulte le public et les autres États membres. C'est seulement en cas d'objection d'États membres qu'elle consulte l'EFSA (European Food Safety Authority) et soumet le projet de décision d'autorisation au vote des États membres. L'État membre rapporteur délivre, en cas d'avis favorable, l'autorisation.

Les directives européennes donnent une place importante à la consultation du public. Ainsi, au cours des procédures européennes d'autorisation de mise sur le marché d'OGM, le public est informé et consulté via le site Internet de la Commission européenne.

Les autorisations délivrées au niveau européen de dissémination et de mise sur le marché d'OGM sont valables sur tout le territoire de l'Union européenne. Elles sont généralement limitées à 10 ans et sont renouvelables. Toutefois, si un État membre considère qu'un OGM est susceptible de présenter un risque pour la santé humaine ou l'environnement, il peut recourir à la clause de sauvegarde prévue par la directive 2001/18/CE pour restreindre ou interdire provisoirement la culture ou la mise sur le marché de l'OGM sur son territoire. La nécessité du maintien de la mesure nationale ou de l'adoption d'une mesure européenne est ensuite examinée au niveau européen.

Dans le cas où une entreprise cherche à commercialiser un OGM pour sa mise en culture dans l'Union européenne, les États membres peuvent même demander une exclusion géographique de la mise en culture d'un OGM sans justification, conformément à la directive 2015/412, qui a modifié la directive 2001/18 en 2015, pour donner davantage de marge de manœuvre aux États membres de l'Union européenne pour décider s'ils souhaitent ou non que des OGM soient cultivés sur leur territoire.

L'entreprise responsable de la demande d'autorisation peut accepter ou refuser ces restrictions géographiques. En cas de refus, les Etats membres peuvent également interdire la mise en culture au niveau national pour des motifs autres que les risques sanitaires ou socio-économiques.

19 États membres dont la France ont demandé et obtenu une exclusion géographique totale ou partielle de leur territoire pour le seul OGM autorisé à la culture en Europe (le maïs MON810).

Des dispositions ont également été prises pour permettre la coexistence des cultures OGM et non OGM au niveau européen (directive 2001/18/CE) et au niveau national (code rural et pêche maritime).

[1] Majorité qualifiée de 55% des EM et 65% population UE

Les grands principes de l'encadrement de la dissémination d'OGM

L'évaluation des OGM

Au niveau européen

Les OGM destinés à être mis sur le marché ou cultivés commercialement dans l'Union européenne font tous l'objet d'une évaluation des risques sanitaires et environnementaux. Au niveau européen, l'évaluation des risques est réalisée par l'EFSA.

Les informations à fournir dans les dossiers de demandes d'autorisation et les principes à appliquer pour l'évaluation des risques sont fixés au niveau européen :

la directive 2001/18/CE définit les informations à fournir ainsi que les principes et méthodologies pour l'évaluation environnementale des OGM.
le règlement d'exécution (UE) n°503/2013 définit les exigences relatives au dossier de demande d'autorisation et à l'évaluation des OGM destinées à l'alimentation humaine et animale.
D'autres documents d'orientation publiés par l'EFSA précisent et complètent les exigences réglementaires en matière d'évaluation des risques environnementaux et sanitaires.

Les évaluations des risques sanitaires et environnementaux sont progressivement complétées par l'évaluation socio-économique. Ainsi, la directive 2001/18/CE a été modifiée par la directive (UE) 2015/412 pour donner la possibilité aux États membres de ne pas autoriser la culture d'un OGM pour des motifs autres que ceux liés à la santé ou à l'environnement, liés à des objectifs de politique environnementale, à l'aménagement du territoire, à l'affectation des sols, aux incidences socio-économiques, à la volonté d'éviter la présence d'OGM dans d'autres produits, à des objectifs de politique agricole ou encore des motifs liés à l'ordre public.

Au niveau national

En France, l'Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES) est l'entité chargée d'évaluer les risques sanitaires, environnementaux et socio-économiques associés à la dissémination d'OGM, depuis le 1er janvier 2022. Lorsque la réglementation le demande ou de manière volontaire, l'agence est saisie par le Gouvernement, pour émettre des avis qui contribuent, selon les cas, à l'avis émis au niveau européen, ou à la prise de décision au niveau national.

Ces avis sont rendus publics.

L'étiquetage et la traçabilité

L'étiquetage 'OGM'

Les règlements (CE) n°1829/2003 et 1830/2003 fixent les règles en matière de traçabilité et d'étiquetage des OGM autorisés à la mise sur le marché dans l'Union européenne.

L'étiquetage des OGM et des produits dérivés d'OGM est ainsi obligatoire.

Le caractère génétiquement modifié du produit ou de l'ingrédient concerné doit figurer sur l'étiquetage ou sur le présentoir du produit. L'obligation d'étiquetage s'applique indépendamment de la présence d'ADN ou de protéines résultant de la modification génétique. Les produits très transformés (comme les huiles raffinées) sont donc étiquetés dès lors que la matière première est génétiquement modifiée.

Afin de prendre en compte les cas possibles de présence accidentelle ou techniquement inévitable d'OGM dans les autres produits, un seuil d'exemption d'étiquetage est fixé à 0,9%. Pour que cette exemption s'applique, l'opérateur doit être en mesure de démontrer qu'il a pris toutes les mesures nécessaires pour éviter la présence d'OGM ou de leurs dérivés. Ce seuil s'applique pour chaque ingrédient ou aliment pour animaux considéré individuellement. Le seuil d'exemption ne s'applique pas aux semences destinées à la mise en culture.

Les produits issus d'un animal nourri avec des aliments génétiquement modifiés ne sont pas concernés par l'étiquetage obligatoire. Ainsi, le lait ou la viande d'un animal nourri avec des aliments génétiquement modifiés ne sont pas étiquetés comme produits génétiquement modifiés.

L'obligation de traçabilité permet de contrôler la conformité de cet étiquetage. Tous les produits OGM et leurs dérivés alimentaires doivent être identifiés à tous les stades de leur mise sur le marché, à l'aide d'un code unique permettant d'identifier chaque OGM. Ces informations doivent être conservées pendant une durée de 5 ans.

L'étiquetage 'sans OGM'

L'étiquetage des produits issus de filières « sans OGM » n'est pas réglementé au niveau européen.

Le principe d'un tel étiquetage a été introduit en France par la loi n°2008-595 du 25 juin 2008 relative aux OGM. Le décret n°2012-128 du 30 janvier 2012, pris en application de la loi, fixe les règles de l'étiquetage facultatif des denrées alimentaires issues de filières qualifiées « sans OGM ».

Trois catégories d'ingrédients peuvent faire l'objet d'une mention :

– les ingrédients d'origine végétale (par exemple, la farine, l'amidon ou la lécithine) peuvent porter la mention « sans OGM » s'ils sont issus de matières premières contenant au maximum 0,1% d'OGM

– les ingrédients d'origine animale (par exemple, le lait, la viande, le poisson ou les œufs) peuvent porter les mentions « nourri sans OGM (<0,1%) » ou « nourri sans OGM (<0,9%) » ;

– les ingrédients d'origine apicole peuvent être étiquetés « sans OGM dans un rayon de 3 km ».

Ces mentions apparaissent le plus souvent dans la liste des ingrédients. Lorsque le produit ne comporte pas de liste d'ingrédients ou lorsque l'ingrédient mis en avant représente plus de 95% de la denrée, la mention peut apparaître dans le champ visuel principal de l'emballage.

La détection des OGM

La réglementation européenne prévoit que tout OGM autorisé à la mise sur le marché dans l'Union européenne doit être accompagné d'une méthode de détection.

La méthode de détection d'un OGM est validée, avant autorisation de l'OGM, par le laboratoire de référence de l'Union européenne, avec l'aide d'un réseau de laboratoires désignés par les États membres.

Ces méthodes de détection des OGM sont utilisées pour réaliser des analyses dans le cadre des contrôles officiels afin de vérifier le respect de la réglementation sur les OGM, notamment les règles d'étiquetage.

La surveillance

Les autorisations de mise sur le marché d'OGM sont accompagnées d'un plan de surveillance qui doit être mis en œuvre par le détenteur de l'autorisation. Les plans de surveillance des OGM sont publiés dans le registre de la Commission européenne.

Des rapports annuels doivent être remis par le détenteur de l'autorisation à la Commission européenne. Les rapports annuels de surveillance de la culture du maïs MON810, seul OGM autorisé à la culture en Europe, sont rendus publics sur le site de la Commission européenne.

https://www.ecologie.gouv.fr/sites/default/files/styles/standard/public/graphique%20comp%C3%A9tences%20utilisation%20diss%C3%A9min%C3%A9e.jpg?itok=CgdDV8Le

Le contentieux sur les variétés tolérantes aux herbicides (VTH)

Fin 2014, neuf associations ont adressé un courrier au Premier ministre demandant, d'une part, l'abrogation de l'article D.531-2 du code de l'environnement en ce qu'il exempte les organismes obtenus par mutagenèse de la réglementation sur les OGM - dont font partie les variétés rendues tolérantes aux herbicides (VTH), et d'autre part, un moratoire sur ces VTH.

Le développement des nouvelles techniques de génie génétique a en effet entrainé un flou juridique autour de certaines variétés obtenues par plusieurs techniques de sélection, dont la mutagenèse aléatoire, utilisée principalement pour la création de variétés tolérantes aux herbicides.

Le silence gardé par l'administration quant à cette demande a fait naître une décision implicite de rejet, contre laquelle les associations ont formé un recours devant le Conseil d'État (CE). Par une décision du 3 octobre 2016, celui-ci a posé à la Cour de justice de l'Union européenne (CJUE) quatre questions préjudicielles et sursis à statuer sur les conclusions de la requête jusqu'à ce que la Cour se soit prononcée sur ces questions. Par un arrêt rendu le 25 juillet 2018 (affaire C‑528/16), la CJUE a ainsi :

clarifié le champ d'application de la directive 2001/18/CE : la Cour précise que tout produit d'une technique de mutagénèse est un OGM, et que seuls sont exemptés de la procédure d'évaluation les produits de techniques de mutagénèse traditionnellement utilisées pour diverses applications et dont la sécurité est avérée depuis longtemps.
précisé la notion de « techniques traditionnellement utilisées pour diverses applications et dont la sécurité est avérée depuis longtemps » : l'arrêt indique notamment, en son point 51, que la directive ne saurait être interprétée comme excluant de son champ d'application « des organismes obtenus au moyen de techniques/méthodes nouvelles de mutagenèse qui sont apparues ou se sont principalement développées depuis l'adoption de ladite directive ».
Dans sa décision du 7 février 2020, le Conseil d'État conclut que les techniques de mutagénèse aléatoire in vitro soumettant des cellules de plantes à des agents mutagènes chimiques ou physiques, ainsi que les techniques de mutagénèse dite dirigée ou d'édition du génome, ne sont pas des techniques traditionnellement utilisées et dont la sécurité est avérée depuis longtemps, étant apparues ou s'étant principalement développées depuis l'adoption de la directive 2001/18/CE. Il en résulte que les organismes obtenus à partir de ces techniques doivent être soumis à la réglementation relative aux OGM.

En conséquence, le Conseil d'État a enjoint au Premier ministre de modifier la règlementation qui précise les techniques de mutagenèse exemptées de la réglementation relative aux OGM afin de les distinguer de celles qui, conformément à son analyse, entrent dans le champ de cette réglementation.

Il enjoint également aux autorités compétentes de prendre toutes les dispositions nécessaires qui en découlent :

identifier, au sein du catalogue commun des variétés des espèces de plantes agricoles, celles des variétés qui y auraient été inscrites sans que soit conduite l'évaluation à laquelle elles auraient dû être soumises compte tenu de la technique ayant permis de les obtenir ;
apprécier, s'il y a lieu, d'engager la procédure de retrait des variétés concernées, la suspension voire la destruction des cultures en place.
Enfin, pour les variétés tolérantes aux herbicides restant autorisées, c'est-à-dire celles obtenues par toute autre technique que la mutagenèse aléatoire in vitro, le Conseil d'État enjoint, en vertu du principe de précaution :

de suivre les recommandations émises par l'Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (Anses) dans son avis du 26 novembre 2019 relatif à l'utilisation des variétés rendues tolérantes aux herbicides cultivées en France, qui demande notamment un suivi de leurs impacts environnementaux ;
de mettre en œuvre la procédure prévue à l'article 16, paragraphe 2, de la directive 2002/53/CE pour être autorisé à prescrire des conditions de culture appropriées pour ces variétés.
Suite à la décision du Conseil d'Etat, le Gouvernement a préparé un projet de décret et deux projets d'arrêtés afin de répondre aux injonctions du Conseil d'État. Ces projets de textes ont été transmis pour avis au Haut Conseil des Biotechnologies et notifiés à la Commission européenne. Celle-ci a émis un avis circonstancié contestant, avec cinq autres Etats membres, la compatibilité juridique des projets de texte avec la législation de l'Union européenne.

Enfin, concernant le suivi des VTH qui resteront autorisées, le Gouvernement a saisi l'Anses et l'Inrae pour l'appuyer dans la définition des mesures à mettre en œuvre. C'est sur la base des derniers avis rendus par ces instances que va être mis en œuvre le dispositif de suivi des VTH.

Le Conseil d'État a été saisi, par les organisations à l'origine du contentieux initial, d'un nouveau recours visant à obtenir l'exécution des injonctions de la décision du 7 février 2020.

Le Conseil d'Etat a rendu sa décision le 8 novembre 2021.

En ce qui concerne les VTH, le CE a enjoint au Gouvernement d'adopter, dans un délai de 3 mois, un plan d'action définissant les mesures retenues pour l'évaluation des risques des VTH pour la santé humaine et le milieu aquatique, ainsi qu'à mettre en œuvre la procédure prévue par le droit européen pour être autorisé à prescrire des conditions de culture appropriées, sous peine d'astreintes financières.

L'ordonnance n°2021-1659 du 15 décembre 2021, permet de fixer un cadre légal pour prescrire de telles conditions de culture, ainsi que le suivi des cultures.

En ce qui concerne le statut de la mutagenèse aléatoire in vitro, le CE sursoit à statuer et renvoie à la CJUE deux nouvelles questions préjudicielles qui peuvent être ainsi résumées :

– Pour distinguer parmi les techniques de mutagénèse les techniques qui ont été traditionnellement utilisées pour diverses applications et dont la sécurité est avérée depuis longtemps, ne faut-il considérer que les modalités selon lesquelles l'agent mutagène modifie le matériel génétique de l'organisme, ou faut-il prendre en compte l'ensemble des variations de l'organisme induites par le procédé employé, y compris les variations somaclonales, susceptibles d'affecter la santé humaine et l'environnement ?

– Pour déterminer si une technique de mutagénèse a été traditionnellement utilisée pour diverses applications et si sa sécurité est avérée depuis longtemps, faut-il ne prendre en compte que les cultures en plein champ ou est-il possible de prendre également en compte les travaux et publications de recherches ne se rapportant pas à ces cultures ? S'agissant de ces travaux et publications, faut-il seulement considérer ceux qui portent sur les risques pour la santé humaine ou l'environnement ?

La France transmettra ses observations à la CJUE au plus tard le 24 février 2022.

Avis de l'Anses du 26 novembre 2019

Le protocole de Carthagène

Le protocole de Carthagène a été adopté en 2000 au sein de la Convention sur la Diversité Biologique (CDB) et est entré en vigueur en 2003. Il a pour but de protéger la biodiversité en s'assurant que le transfert, la manipulation et l'utilisation des OVM (organismes vivants modifiés : par exemple les semences de maïs mais pas la farine de maïs) soient effectués avec le bon degré de sécurité.

C'est un socle commun qui est ensuite décliné dans les lois nationales. Il regroupe 173 parties ou Etats signataires mais certains grands pays exportateurs d'OGM que sont les Etats-Unis, le Canada et l'Argentine ne l'ont pas ratifié.

Il régit les transports transfrontaliers d'OVM avec notamment la nécessité d'accord préalable en connaissance de cause de l'importateur. L'exportateur doit fournir une évaluation des risques (sanitaires, écologiques et, sur une base volontaire, socio-économiques) et transmettre toutes les informations au centre d'échange pour la prévention des risques biotechnologiques ou BCH (biosafety clearing house). Ainsi, toutes les informations sont regroupées à l‘échelle mondiale.

Il s'appuie sur le principe de précaution et met en avant la sensibilisation et la participation du public aux prises de décision, y compris les peuples autochtones et les communautés locales.

Il encourage la mise en place de cadres réglementaires nationaux grâce à des mesures de renforcement des capacités des pays en développement.

Il est complété par le protocole additionnel de Nagoya Kuala Lumpur en vigueur depuis 2018 sur la responsabilité et les réparations en cas de dommage : celui-ci s'appuie sur le principe de « pollueur-payeur ».

La Conférence des Parties siégeant en tant que réunion des Parties au Protocole (COP-MOP) se réunit tous les deux ans, conjointement avec les réunions régulières de la Conférence des Parties (COP) à la Convention sur la diversité biologique. Elle discute notamment de l'implémentation du Protocole, et prend des décisions concernant notamment les travaux à mener, par exemple en matière de développement de matériel d'évaluation et de gestion des risques.

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Ministère de l'Ecologie, du Développement durable et de l'Energie - MEDDE | Catalogue Sdit - Innovons pour les transformations

Source : https://www.ecologie.gouv.fr/organismes-genetiquement-modifies-ogm-0

Le ministère de l'Écologie est, en France, l'administration chargée de préparer et mettre en œuvre la politique du Gouvernement dans les domaines du développement durable, de l'environnement et des ... Wikipédia

OGM & nouveaux OGM : parlons des idées reçues ! - Document ‘greenpeace.fr'

Agriculture

Les organismes génétiquement modifiés (OGM) ont refait surface d'une manière fracassante dans le débat public via les nouvelles techniques de génie génétique, ce que les industriels appellent des ”NBT” (new breeding techniques, en français “nouvelles techniques de sélection”). On vous explique ce sujet complexe et à hauts risques et on décrypte ensemble les idées reçues.

Anciens et nouveaux OGM : toujours la même histoire

Les OGM, c'est quoi ?
Un organisme génétiquement modifié, c'est un organisme vivant dont l'ADN a été bricolé pour le doter de propriétés qu'il ne possédait pas. Aujourd'hui, la création d'OGM sert surtout à rendre une plante résistante à un herbicide ou à lui faire produire elle-même un insecticide.

Et les nouveaux OGM, c'est quoi ?
Des OGM issus de nouvelles techniques : des techniques d'édition du génome. Et donc, tout comme pour les anciens OGM, ces techniques sont utilisées pour modifier le génome d'organismes, que ce soit des végétaux ou des animaux.
La liste de ces nouvelles techniques est longue et variée. Certaines d'entre elles ne sont d'ailleurs plus vraiment “nouvelles”. Elle inclut notamment toutes les techniques d'édition de gènes (ou édition du génome), par exemple CRISPR/Cas9.

Pour en savoir plus, consulter notre rapport sur ces nouvelles techniques

Et donc les NBT produisent des nouveaux OGM ?
Le terme NBT (New Breeding Techniques, en français “nouvelles techniques de sélection') a été inventé par les industriels pour désigner notamment les techniques d'édition du génome, évitant ainsi de nommer un chat un chat. La Commission européenne les appelle plutôt NGT (New Genomic Techniques, en français “nouvelles techniques de génie génétique”). Ces techniques, plus récentes, permettent de modifier le génome de plantes et d'animaux et donc d'obtenir des OGM, qui sont appelés “nouveaux OGM” pour les distinguer des OGM de première génération.

Et comme il n'y a pas de gènes étrangers, ce sont quand même des OGM ?
Oui. Ce qui compte, c'est le procédé utilisé : s'il y a modification artificielle du génome, le produit est un OGM. La présence d'un gène d'une autre espèce n'est pas un critère pour définir un OGM ou non.

Parlons des idées reçues !

Les OGM sont un remède à la faim dans le monde.
La solution à la faim dans le monde, ce n'est pas de produire plus, mais de produire là où il faut, avec des méthodes qui respectent notre environnement. Les OGM ne répondent en rien à ça !
En effet, on produit déjà trop et pourtant la faim est bien là : près d'un milliard de personnes s'endorment chaque jour le ventre vide. Dans le même temps, on produit plus d'aliments qu'il n'en faut pour nourrir les sept milliards d'êtres humains, le gaspillage alimentaire représente 30% de la production mondiale.

Pour en savoir plus, consultez notre rapport sur l'agriculture écologique

Les OGM sont un remède pour faire face au réchauffement climatique.
Les OGM ne sont pas un remède pour 3 raisons :

Les risques que pose leur dissémination incontrôlée dans l'environnement
Une mainmise accrue des multinationales sur les paysans, à travers les brevets et la dépendance aux produits phyto-sanitaires associés aux semences, portant préjudice à la souveraineté alimentaire.
Les promesses non tenues associées à ces OGM : jusqu'à présent, les OGM effectivement commercialisés qu'ils soient anciens ou nouveaux sont limités à des traits simples, par exemple la résistance à un herbicide.
L'industrie des OGM utilisait d'ores et déjà l'argument de la lutte contre les dérèglements climatiques pour justifier le développement des “anciens” OGM (ceux issus de la transgénèse). Pourtant, force est de constater que les OGM réellement développés n'ont contribué en rien à la lutte contre le changement climatique, à l'inverse des techniques de sélection classiques permettent de sélectionner depuis des années des variétés plus résilientes et plus à même de s'adapter aux changements climatiques. Il y a un vrai enjeu à faire en sorte de favoriser des semences diversifiées plutôt que de promouvoir des semences standardisées qui ne sont pas adaptées aux terroirs.

Les NBT ne visent pas à créer un nombre incalculable de mutation : le but de ces techniques est d'avoir une mutation précise à un endroit connu.
Même si les techniques d'édition du génome sont souvent décrites comme plus précises en termes d'effets intentionnels sur le matériel génétique, des irrégularités ont bels et bien été rapportées et notamment des effets non-intentionnels hors-site, sur le site visé et des réarrangements chromosomiques.

Ces effets peuvent avoir des implications sur la sécurité des denrées alimentaires, des aliments pour animaux et de l'environnement s'ils augmentent les niveaux de composés toxiques, réduisent les niveaux de composition nutritionnelle ou même produisent de nouveaux allergènes. Cela signifie que le niveau de précision plus élevé ne se traduit pas nécessairement par un niveau de sécurité plus élevé.

Vous pouvez consulter par exemple cet article scientifique à ce sujet : Kawall et al 2020.

Pour aller plus loin : Ces nouvelles techniques d'édition du génome consistent généralement à couper lʼADN avec des protéines, appelées nucléases, à un endroit choisi du génome dʼune cellule vivante. Les nucléases, aussi appelées ciseaux génétiques, vont trouver lʼendroit ciblé à lʼaide dʼune portion dʼARN servant de « guide ». La cellule répare ensuite lʼincision, ce qui le plus souvent réduit au silence le gène visé (extinction de gène). Cela n'a rien de naturel et c'est très différent de la sélection végétale qui a pour objectif d'accélérer l'apparition de variétés qui auraient pu apparaître naturellement.

Il n'a jamais été prouvé que les OGM avaient une quelconque répercussion sur l'organisme humain.
A l'inverse on n'a jamais non plus prouvé leur innocuité. C'est le principe de précaution qui doit prévaloir. En effet, ces techniques d'édition génomique peuvent conduire à des “erreurs génétiques” en dehors de la modification intentionnelle.

Pour aller plus loin, voici, une référence intéressante.

La méthode de production des nouveaux OGM n'est pas dangereuse, ce sont les utilisations qui le sont. De fait, on devrait autoriser la pratique mais surveiller les applications.
La réglementation OGM considère d'ores et déjà les applications au-delà de la question de la technique utilisée. En effet elle liste les techniques concernées mais ensuite c'est une évaluation au cas par cas, pour chaque OGM, qui est faite avant toute autorisation.

Si on n'arrive pas à développer d'OGM qui permettent de lutter contre la faim dans le monde, c'est à cause de Greenpeace qui refuse en bloc les OGM !
Le cadre réglementaire qui s'applique en Europe impose, à juste titre, une évaluation des risques avant d'autoriser la mise en culture ou la commercialisation d'OGM. C'est une application raisonnable du principe de précaution. La recherche sur des OGM à vocation agricole n'est pas interdite ou entravée, tant que les risques de dissémination sont contrôlés. Si les OGM ne se sont pas particulièrement développés en Europe, c'est soit parce que les pouvoirs publics estiment qu'on ignore les risques à long-terme, soit parce que les agriculteurs et/ou les consommateurs ne préfèrent pas les voir se déployer dans nos champs et nos assiettes.

Les produits issus des NBT existent déjà à l'état naturel. Pourquoi est-ce que cela représenterait un danger d'en disséminer davantage dans la nature ?
Les produits issus des NGT n'ont rien de naturels, c'est un mensonge de l'agro-chimie. Ils sont issus de techniques de modification génétique qui ne se produisent pas spontanément dans la nature mais sont bien effectuées en laboratoire. Etant donné que la plupart de ces techniques sont nouvelles, il est impossible d'évaluer pleinement les potentiels effets indésirables d'autant plus qu'elles peuvent également être combinées les unes aux autres et utilisées à plusieurs reprises. La dissémination dans la nature et sans traçabilité de ces produits issus des NGT représente donc un risque important pour la biodiversité.

La plupart des plantes consommées aujourd'hui (et notamment dans l'agriculture bio) sont issues de sélections naturelles ou humaines qui ont entraîné des modifications génétiques. En quoi est-ce différent des New Breeding Techniques ?
Il faut distinguer les sélections et modifications biologiques progressives, menées dans les champs ou à l'échelle de la plante entière, des modifications forcées, menées en laboratoire à l'échelle de la cellule dans le cas des nouvelles techniques de modifications génétiques et en particulier des techniques d'édition du génome.
En effet, les nouvelles techniques d'édition du génome consistent généralement à couper lʼADN à un endroit choisi du génome dʼune cellule vivante. Ce processus peut entraîner des erreurs génétiques, qui représentent un risque pour notre santé et l'environnement. C'est pour cela que nous demandons de soumettre tous les OGM, dont les OGM issus des NGT, à la réglementation OGM afin qu'ils soient soumis à une évaluation préalable et à un étiquetage, et qu'ils ne soient pas disséminés sans traçabilité.

Les OGM, comme le riz doré, permettraient de résoudre la faim dans le monde et de résoudre les problèmes de carences en vitamine dans certains pays d'Asie. Pourquoi vous y opposez-vous ?
Le riz doré est un riz transgénique mis au point par l'industrie des biotechnologies. Il a été génétiquement modifié pour contenir de la provitamine A (bêta-carotène). Ses défenseurs le présentent comme une solution miracle pour lutter contre la carence en vitamine A, un problème de santé publique dans de nombreux pays en développement entraînant parfois la cécité.

Des dizaines de millions de dollars ont été dépensés dans la recherche sur le riz doré. La recherche sur cet OGM accapare des ressources qui pourraient être utilisées plus efficacement pour s'attaquer aux causes sous-jacentes de la carence en vitamine A : la malnutrition, la pauvreté et le manque d'accès à une alimentation diversifiée.
En juillet 2021, les Philippines sont devenues le premier pays au monde à approuver la production du riz doré à des fins commerciales. Greenpeace condamne fermement cette décision. Plutôt que de miser sur ces OGM qui n'ont pas fait la preuve de leur innocuité environnementale ni de leur capacité à effectivement palier aux carences en provitamine, les autorités philippines devraient promouvoir l'agriculture écologique, plus résiliente, plus sûre et plus respectueuse de la santé, de l'environnement et des agriculteurs.

Derrière la justification « humanitaire », le riz doré fait office de “cheval de Troie” pour ouvrir la voie vers une autorisation globale des plantes génétiquement modifiées. L'argument de lutte contre la faim n'est qu'un argument marketing pour tenter de faire accepter les OGM. Les OGM n'ont rien tenu des grandes promesses d'augmentation de rendements agricoles, et donc finalement n'ont en rien contribué à la baisse de l'insécurité alimentaire ou de la malnutrition dans le monde. Ils n'ont tout simplement pas été conçus pour ça…

En refusant de les légaliser en Europe, la recherche est limitée. C'est pour cela qu'on ne trouve pas des OGM qui permettent de sauver le climat ou encore la faim dans le monde.
Greenpeace ne refuse pas de les légaliser : nous demandons simplement à ce qu'ils soient strictement réglementés. Cela suppose une évaluation solide des risques préalable à toute autorisation, ainsi qu'une traçabilité et un étiquetage. Si les OGM ne sont pas autorisés en Europe, c'est simplement parce qu'ils ne passent pas l'étape de l'évaluation des risques.

Pour aller plus loin :

Si vous souhaitez aller plus loin, voici quelques articles scientifiques et publications techniques.

Sur les techniques d'édition du génome / les nouveaux OGM :
- Le rapport “Danger à l'horizon : Pourquoi l'édition génomique n'est pas la réponse aux défis environnementaux de l'UE” de Greenpeace, mars 2021.
- NBT, de fausses solutions pour de vrais OGM”.
Sur les “erreurs génétiques” qui peuvent être générées par ces techniques d'édition du génome et les risques associés à ces techniques :
- Kawall, K., Cotter, J. & Then, C. Broadening the GMO risk assessment in the EU for genome editing technologies in agriculture. Environ Sci Eur 32, 106 (2020). https://doi.org/10.1186/s12302-020-00361-2
- Bauer-Panskus, A., Miyazaki, J., Kawall, K. et al. Risk assessment of genetically engineered plants that can persist and propagate in the environment. Environ Sci Eur 32, 32 (2020). https://doi.org/10.1186/s12302-020-00301-0
Sur les conflits d'intérêts autour des nouveaux OGM :
- Des documents révélés par Greenpeace, Corporate Europe Observatory et GeneWatchUK qui montrent les pressions exercées dès 2015 par les semenciers américains auprès de la Commission européenne pour déréglementer les nouveaux OGM.
- Les “CRISPR-files”, un ensemble de documents témoignant du lobby industriel, révélés par l'ONG Corporate Europe Observatory et diffusés en France par le média Reporterre.
  Sur le même sujet :

Changeons le scénario : le guide pour passer à l'action

Non aux OGM masqués !

Source : https://www.greenpeace.fr/ogm-nouveaux-ogm-parlons-des-idees-recues/

Fichier:Greenpeace logo.svg — Wikipédia

Greenpeace - Greenpeace est une organisation non gouvernementale internationale de protection de l'environnement présente dans plus de 55 pays à travers le monde… Wikipédia

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Collecte de documents et agencement, traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 31/01/2024

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"L'herbicide ‘Roundup' à base de glyphosate est lié à des niveaux épidémiques d'une maladie rénale chronique (CKDu) chez les populations des zones rurales du Sri Lanka" par GMWatch

GMWatch — 2023-10-21T09:21:47Z

ISIAS Pesticides Glyphosate Eau dure

L'herbicide ‘Roundup' à base de glyphosate est lié à des niveaux épidémiques d'une maladie rénale chronique (CKDu) chez les populations des zones rurales du Sri Lanka

Traduction du 20 octobre 2023 – avec ajout de compléments - par Jacques Hallard d'un article publié le 13 octobre 2023 par ‘gmwatch.org' sous le titre : https://gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20302-roundup-ingredient-connected-to-epidemic-levels-of-chronic-kidney-disease

Agriculteur pulvérisant des herbicides

L'eau dure est contaminée par des complexes de glyphosate dans les communautés sri-lankaises en proie à une maladie rénale chronique

[Addenda – Une eau dure est une eau qui contient beaucoup de [sels dissous, en particulier des sels de calcium (le bicarbonate de calcium pouvant se transformer en calcaire) et de magnésium ; c'est pourquoi la dureté d'une eau est mesurée par sa teneur en calcium et magnésium. À l'inverse, une eau douce est une eau qui en contient peu.
Dans la nature, toutes les eaux n'ont pas la même dureté : les eaux du Massif Central, des Vosges et du Massif Armoricain par exemple sont douces (moins de 200 milligrammes de calcaire dissous par litre d'eau), alors que certaines eaux de la Région parisienne sont très dures (jusqu'à 900 milligrammes de calcaire dissous par litre d'eau). Il n'y a aucun danger à boire une eau dure lorsqu'on est en bonne santé. Contrairement à ce qui est souvent affirmé, la présence d'ions calcium dans l'eau aurait même tendance à diminuer le risque de formation de calculs rénaux.

Cependant, une eau trop dure peut présenter des inconvénients d'utilisation. L'eau dure diminue en effet les propriétés détergentes des lessives et savons qu'il faut utiliser en plus grande quantité. Par ailleurs, son usage en agriculture augmente la concentration de sels dans les sols et favorise leur stérilisation. Enfin, certains sels, en particulier le calcaire, peuvent se déposer, sous une forme solide appelée tartre, sur les parois des canalisations, des ballons d'eau chaude ou des chaudières.
À l'inverse, une eau trop douce est une eau corrosive qui ronge les parois des canalisations favorisant la formation de fuites. Or les bactéries se développent préférentiellement aux points de fuite et de corrosion. En outre, la corrosion augmente la concentration en cuivre, étain ou plomb de l'eau, suivant le matériau dont sont faites les conduites, toutes substances nocives à la consommation. Une eau trop douce est donc une eau qui contribue à la dégradation de la qualité de l'eau dans les canalisations.

Pour à la fois protéger les équipements de l'encrassement et maintenir la qualité de l'eau lors de sa distribution, l'eau doit donc être juste assez dure pour qu'une couche protectrice de carbonate de calcium se dépose sur les parois des canalisations, les isolant de l'eau transportée… - Source : https://www.cnrs.fr/cw/dossiers/doseau/decouv/potable/dureDouc.html ]

Article traduit :

Au cours des deux dernières décennies, des dizaines de milliers de personnes vivant dans les zones rurales du Sri Lanka ont été dévastées par une insuffisance rénale due à des causes peu claires, également connues sous le nom de CKDu. Des incidences similaires de mystérieuses maladies rénales sont apparues dans les communautés agricoles tropicales du monde entier.

[Addenda – Qu'est-ce que la CKDu ? - La maladie rénale chronique d'étiologie inconnue (CKDu) est un type de maladie rénale chronique qui touche principalement les communautés agricoles marginalisées dans certaines régions du monde où un grand nombre de personnes développent une forme inexpliquée et mortelle de maladie rénale.

Parce que les populations touchées comptent parmi les plus pauvres du monde et sont exposées à un degré élevé de risques professionnels et environnementaux, et parce que la maladie est considérée comme un 'mystère médical', le CKDu a fait l'objet d'une attention particulière dans les magazines scientifiques et les médias.

Répartition dans le monde > Distribution in the world

Qui est touché ? > {{}}Who is affected ?

Un exemple historique de néphropathie régionale > A historical example of regional nephropathy

Références :

[1] Cecilia Torres et al. (2019, October 9). Decreased Kidney Function of Unknown Cause in Nicaragua : A Community-Based Survey. Retrieved from https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S027263860901587X

[2] (2019, October 9). Kidney disease of unknown causes in agricultural communities in Central America is declared a serious public health problem
https://www.paho.org/hq/index.php?option=com_content&view=article&id=9062:2013-kidney-disease-agricultural-communities-central-america-serious-public-health-problem&Itemid=1926&lang=en

Source : https://www.theisn.org/initiatives/what-is-ckdu/ ]

Suite de l'article traduit

Une étude massive sur le terrain des puits alimentant en eau potable les communautés sri-lankaises, menée par des chercheurs de l'Université Duke, a identifié un coupable possible — le glyphosate, le composé actif du Roundup, l'herbicide le plus utilisé au monde.

Les résultats de l'étude ont été publiés dans ‘Environmental Science and Technology Letter's le 13 septembre 2023.

Le ‘Roundup' est un herbicide à base de glyphosate utilisé pour lutter contre les mauvaises herbes … Parce qu'il est censé se décomposer dans l'environnement en quelques jours à quelques semaines, son utilisation est relativement sous-réglementée par la plupart des agences de santé publique. Mais lorsque le glyphosate rencontre certaines traces d'ions métalliques qui rendent l'eau dure, des complexes d'ions magnésium et calcium - glyphosate-ions métalliques - peuvent se former. Ces complexes peuvent persister jusqu'à sept ans dans l'eau et 22 ans dans le sol.

“On a toujours pensé que ce produit chimique se décomposerait très rapidement dans l'environnement, mais il semble rester beaucoup plus longtemps que prévu lorsqu'il se complexifie dans l'eau dure”, a déclaré Nishad Jayasundara, professeur adjoint au ‘Juli Plant Grainger‘ de ‘Santé environnementale mondiale' à Duke. 'Nous devons examiner comment le glyphosate interagit avec ces autres éléments et ce qui arrive au glyphosate lorsque vous le prenez dans votre corps en tant que complexe.”

Dans certaines zones agricoles du Sri Lanka, le climat sec et élevé combiné à ses formations géologiques crée les conditions idéales pour l'eau calcaire. C'est également dans ces régions que la CKDu a atteint des niveaux épidémiques, jusqu'à 10% des enfants âgés de 5 à 11 ans présentant des signes de lésions rénales précoces.

Jayasundara, qui est lui-même originaire du Sri Lanka, pensait que le glyphosate pourrait jouer un rôle dans l'incidence de la CKDu en raison de l'eau calcaire de la région, même si le Sri Lanka a interdit l'utilisation de l'herbicide. Pour tester son hypothèse, Jayasundara a fait équipe avec le chimiste environnemental Lee Ferguson, professeur de génie civil et environnemental à Duke et son doctorant Jake Ulrich. En collaboration avec Mangala De Silva, professeur à l'Université de Ruhuna, au Sri Lanka, l'équipe Duke a échantillonné plus de 200 puits dans quatre régions du Sri Lanka.

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/69/Sri_Lanka_provinces.png/220px-Sri_Lanka_provinces.pngCarte des provinces du Sri Lanka – Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Provinces_du_Sri_Lanka

Le laboratoire de Ferguson à Duke utilise la spectrométrie de masse à haute résolution et en tandem pour identifier les contaminants-même la plus petite trace d'entre eux-par leurs poids moléculaires. C'est une méthode très sensible d'identification et de quantification qui permet d'avoir une vue d'ensemble des polluants présents dans un système d'eau.

[Addenda - Spectrométrie de masse - Source : Wikipédia sous licence CC-BY-SA 3.0. -La liste des auteurs de cet article est disponible ici.

- Introduction - Structure d'un spectromètre de masse - La source d'ionisation - A quoi sert la spectrométrie de masse ?- Le détecteur - L'analyseur - La spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)

Spectrométrie de masse - Définition

La spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) - Voir aussi : Séquençage par spectrométrie de masse

La spectrométrie de masse en tandem consiste à sélectionner un ion par une première spectrométrie de masse, à le fragmenter, puis à effectuer une deuxième spectrométrie de masse sur les fragments ainsi générés. Elle peut être réalisée à l'aide de nombreux appareils combinant des secteurs magnétiques, électriques, quadripolaires ou des temps de vol, mais également au sein d'un même analyseur dans le cas d'une trappe d'ions… ]

Suite du document traduit

Grâce à cette technique, les chercheurs ont découvert des niveaux significativement plus élevés d'herbicide dans 44% des puits situés dans les zones touchées, contre seulement 8% de ceux situés à l'extérieur.

“Nous nous sommes vraiment concentrés ici sur l'eau potable, mais il est possible qu'il existe d'autres voies d'exposition importantes : le contact direct des travailleurs agricoles pulvérisant le pesticide, ou peut-être de la nourriture ou de la poussière”, a déclaré Ferguson. “J'aimerais voir une étude accrue mettant davantage l'accent sur les liens entre ces voies d'exposition. Il semble toujours qu'il y ait des choses qui nous manquent.”

À ce stade, Ulrich a également trouvé des niveaux élevés de fluorure et de vanadium — qui sont tous deux liés à des lésions rénales — dans l'eau potable de la plupart des communautés à forte incidence de CKDu. Les chercheurs conviennent qu'il faut accorder plus d'attention aux contributions potentielles de chacun de ces contaminants, individuellement ou de concert avec d'autres. Mais étant donné le raisonnement de leur hypothèse basée sur le glyphosate dans l'étude et les niveaux élevés d'utilisation de l'herbicide dans le monde entier, ils pensent également que ces résultats devraient constituer un avertissement sérieux lors de l'examen du risque d'exposition au glyphosate.

Une partie de la préoccupation de Ferguson, a-t-il déclaré, est que le profil du devenir du glyphosate ressemble à un contaminant qu'il a étudié plus près de chez lui - des substances per et polyfluoroalkyliques, ou PFAS, également appelées “produits chimiques éternels” en raison de leur persistance dans l'environnement.

[Addenda – Polyfluoroalkyliques, ou PFAS - 'Nous considérons les PFAS comme un contaminant de l'eau potable parce qu'il est mobile et persistant. Maintenant, nous réalisons que le glyphosate peut également être assez persistant dans les zones d'eau dure”, a déclaré Ferguson. 'Cela me préoccupe au sujet des expositions ici aux États-Unis.” - Ce travail a été soutenu par le NIEHS (U2CES030851) et l'Opération Accélération de l'Expansion et du Développement de l'Enseignement Supérieur (AHEAD) du Ministère de l'Enseignement Supérieur financée par la Banque Mondiale (AHEAD DOR 02/40).

Citation : “Le glyphosate et le fluorure dans l'eau potable à Haute Dureté Sont positivement associés à une Maladie rénale Chronique d'Étiologie Inconnue (CKDu) au Sri Lanka”, Jake C. Ulrich, Kate Hoffman, TDKSC Gunasekara, PMMA Sandamini, Brian P. Jackson, P. Mangala CS De Silva, Nishad Jayasundara, P. Lee Ferguson. Lettres sur la science et la technologie de l'environnement, oct. 10, 2023. EST ce que je : 10.1021 / acs.esthète.3c00504. https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.estlett.3c00504 - Source : Université Duke via Eurekalert - https://www.eurekalert.org/news-releases/1004375 - Source : https://www.inspq.qc.ca/pfas/definition-et-utilisation-fiche-technique ]

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/10/2023

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"Une solution alimentaire et climatique pour l'Afrique : remettre au goût du jour les plantes et les cultures négligées ou oubliées : sorgho, millets (fonio, mil, teff…), amarante, aubergine, chou frisé, quinoa, etc…" par GMWatch

GMWatch — 2023-06-27T16:04:23Z

ISIAS Alimentation Afrique Cultures négligées

Une solution alimentaire et climatique pour l'Afrique : remettre au goût du jour les plantes et les cultures négligées ou oubliées : sorgho, millets (fonio, mil, teff…), amarante, aubergine, chou frisé, quinoa, etc…

Traduction du 24 juin 2023 – avec ajout de compléments sur les plantes et cultures négligées par Jacques Hallard d'un article en date du 21 juin 2023, publié par ‘gmwatch.org' sous le titre « Bringing back neglected crops : A food and climate solution for Africa » - Auteurs : Lysiane Lefebvre, David Laborde et Valérie Piñeiro – Référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20240-bringing-back-neglected-crops-a-food-and-climate-solution-for-africa

Millet farming in South Sudan

Alors que les crises, à la fois alimentaire et climatique, continuent de causer des souffrances dans le monde entier, une solution sous-estimée — les plantes et les cultures négligées — pourrait être un outil puissant pour atténuer ces deux crises [alimentaire et climatique] dans l'une des régions mondiales les plus touchées : l'Afrique.

Les plantes et les cultures négligées — y compris les céréales telles que le sorgho, le millet et les légumes tels que l'amarante, l'aubergine et le chou frisé — sont également appelées cultures “indigènes”, “perdues”, “indigènes”, “orphelines”, “traditionnelles” ou “sous-utilisées”, ou comme ingrédients dans les “aliments oubliés”.

[Addenda - Le sorgo commun, aussi orthographié sorgho, est une espèce de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae, originaire d'Afrique. C'est une plante herbacée annuelle, qui peut atteindre 3 mètres de haut. Elle est cultivée soit pour ses graines, le sorgo grain, soit comme fourrage, le sorgho fourrager. Wikipédia ]

[Addenda - Millet est un terme générique qui désigne en français plusieurs espèces de plantes de la famille des Poacées. Ce sont des céréales vivrières, à très petites graines, cultivées principalement dans les zones sèches, notamment en Afrique et en Asie. Elles sont souvent appelées aussi mil. Wikipédia ]

Ces termes capturent divers aspects de ces cultures importantes : elles sont indigènes ou originaires d'une région spécifique (par exemple, des régions d'Afrique) ; ils ont traditionnellement été à la base d'aliments hautement nutritifs, mais au fil du temps, ils ont été perdus ou oubliés par beaucoup et sont donc devenus orphelins ; et ils sont maintenant sous-utilisés par les agriculteurs et les producteurs et, de même, négligés par les consommateurs, les sélectionneurs de plantes, les décideurs et les donateurs.

Ramener des cultures négligées n'est pas un sujet nouveau, mais l'idée a pris un nouvel élan en 2023, que les Nations Unies ont déclarée Année internationale du mil. Cet article plaide en faveur de la réintroduction et de l'intensification de la culture et de l'utilisation de ces plantes, qui offrent un moyen prometteur de faire face à la fois aux crises alimentaire et climatique — en particulier pour l'Afrique.

[2023 : Année internationale du mil, une céréale « durable »]

Les plantes négligées étaient traditionnellement cultivées pour la subsistance, mais au cours du 20e siècle, elles ont été progressivement remplacées par des cultures mieux adaptées à l'agriculture commerciale. Le secteur agroalimentaire mondialisé s'est de plus en plus spécialisé, intensifié et concentré. Parallèlement à la modernisation et à l'urbanisation, la recherche de toujours plus d'efficacité et de productivité a conduit à la domination de très peu (sans doute trop peu) de sources de végétaux alimentaires. Une poignée de cultures de base ont remplacé la vaste gamme de cultures de plantes pour la subsistance : 75% des variétés de cultures ont disparu au cours du 20e siècle.

En 2020, seules trois espèces végétales (maïs, riz et blé) représentaient 41% de l'apport calorique mondial. Comme le montre la figure 1, la croissance de la superficie de production de ces trois principales cultures (en bleu) en Afrique a largement dépassé celle des céréales traditionnelles (en orange), comme le fonio, le sorgho et le mil.

Bringing back neglected crops - Figure 1Agrandir le graphique

Ramener les cultures négligées-Figure 1

Les cultures négligées ont été abandonnées, les producteurs se concentrant sur des cultures moins nombreuses et plus rentables, et les consommateurs préférant des plantes cultivées plus pratiques, qui pourraient plus facilement être transformées en produits alimentaires.

Pourquoi ramener des cultures négligées ?

Une partie de la réponse réside dans l'augmentation du nombre d'options alimentaires et la diversification des marchés, afin de créer un approvisionnement alimentaire mondial plus sûr face à des chocs plus fréquents.

Les multiples crises de ces dernières années ont révélé de nombreuses faiblesses dans les systèmes alimentaires. Des événements tels que des ralentissements économiques locaux et mondiaux, des conflits politiques et militaires, des phénomènes météorologiques extrêmes dus au climat, des pandémies, y compris le COVID-19, et des ravageurs et des maladies des cultures, se sont combinés pour faire grimper les prix des denrées alimentaires et plonger des millions de personnes dans la faim.

Ces crises ont frappé particulièrement durement l'Afrique, et celle-ci reste à haut risque : plus d'un Africain sur cinq, soit 278 millions de personnes, souffre de faim chronique, et l'inflation des prix alimentaires en Afrique a dépassé 20% en juin 2022 (son plus haut niveau depuis le début du suivi de l'indicateur il y a plus de 20 ans).

Les impacts du changement climatique sont particulièrement importants : d'une part, ils affectent déjà la sécurité alimentaire et la nutrition et devraient continuer à réduire la productivité des cultures ; d'autre part, les systèmes alimentaires sont responsables de 34% des émissions brutes mondiales de gaz à effet de serre.

Encore une fois, ces impacts retombent lourdement sur l'Afrique

Les phénomènes météorologiques extrêmes dans la Corne de l'Afrique, par exemple, devraient aggraver l'insécurité alimentaire et entraver les progrès vers la réduction de la malnutrition, portant le nombre de personnes confrontées à une crise ou pire à 23-26 millions, si la sécheresse en cours se prolonge pour une cinquième saison.

[Addenda - La Corne de l'Afrique est un surnom géographique qui désigne une péninsule de l'Afrique de l'Est qui s'étend depuis la côte sud de la mer Rouge jusqu'à la côte ouest de la mer d'Arabie, en passant par le golfe d'Aden et dont la forme, sur une carte, évoque une corne de rhinocéros. Wikipédia ]

Carte des États de la Corne de l'Afrique (en vert).

Carte des États de la Corne de l'Afrique (en vert). Source

https://13commeune.fr/app/uploads/2020/07/CORNE-de-Lafrique-720x482.gif

Source : https://13commeune.fr/evenements/la-corne-de-lafrique-ethiopie-erythree-1/

Suite de la traduction

Comment les cultures négligées peuvent-elles faire partie de la solution en Afrique ?

L'expansion de l'utilisation des cultures négligées peut aider à diversifier l'agriculture et les systèmes alimentaires et à introduire une plus grande variété d'aliments dans les approvisionnements mondiaux —y compris des céréales, des fruits et légumes, des racines et des tubercules plus nutritifs —, tout en renforçant la résilience au changement climatique et en fournissant des emplois et d'autres sources de revenus aux agriculteurs.

Grâce à des interventions parallèles et à des investissements appropriés, y compris dans une production agricole supplémentaire, la diversification des sources de nourriture peut aider à réduire la vulnérabilité des consommateurs à la volatilité des prix des denrées alimentaires et à accroître la stabilité des prix des denrées alimentaires à la consommation.

Les cultures négligées offrent également une gamme d'options pour améliorer la diversité alimentaire. Beaucoup ont une densité nutritive relativement élevée, ce qui les rend particulièrement attrayants. De nombreuses plantes cultivées de base négligées sont également plus nutritives que les produits de base dominants.

Le ‘millet effiloché', le fonio et le teff ont des teneurs en fer plus élevées que le maïs, le riz et le blé —bien que les trois derniers continuent de remplacer le premier (voir Encadré 1).

Comme le montre la figure 2 (ci-après), les céréales traditionnelles (en orange) ont également une teneur en acides aminés relativement plus élevée que les cultures non indigènes (en bleu). Les acides aminés sont essentiels pour la santé humaine et contribuent à une meilleure nutrition.

Bringing back neglected crops - Figure 2

Ramener les cultures négligées- Figure 2 – Pour agrandir

Les avantages nutritionnels des espèces négligées sont particulièrement importants compte tenu des problèmes de malnutrition et de pauvreté en Afrique. Les faibles revenus sont généralement associés à des régimes alimentaires moins nutritifs qui, à leur tour, entraînent un certain nombre de problèmes de santé publique.

Ainsi, améliorer la disponibilité et maintenir « l'abordabilité », un accès abordable, des aliments fabriqués à partir de plantes négligées, offre un moyen nutritif de lutter contre la malnutrition et d'améliorer les résultats sanitaires, en particulier pour les ménages à faible revenu, en augmentant la teneur en nutriments et en diversifiant les régimes alimentaires.

Les plantes cultivées négligées peuvent également être supérieures aux produits de base dominants en raison de leur adaptation inhérente à l'environnement naturel et aux conditions locales. Ces plantes tolèrent mieux les précipitations irrégulières et les sols peu fertiles, elles prospèrent mieux dans des conditions sèches et même lors des grandes sécheresses, et elles réussissent souvent là où d'autres cultures échouent.

Ces espèces se caractérisent également par une efficacité élevée d'utilisation de l'eau et de l'azote, nécessitant moins d'eau et peu ou pas d'intrants chimiques, comme les engrais synthétiques et les pesticides.

Beaucoup sont donc aptes à la culture marginale et traditionnelle en Afrique, y compris dans la région aride de la Corne de l'Afrique. L'Afrique étant particulièrement vulnérable aux impacts du changement climatique, la tolérance de ces cultures aux variations de précipitations et de températures est un atout important.

Parce qu'elles ont longtemps été marginalisées sur le plan économique, les cultures de plantes négligées recèlent également un énorme potentiel de création de nouveaux marchés, d'emplois et de revenus locaux — de la production à l'ajout de valeur et à la distribution.

Les légumes traditionnels, tels que l'amarante, l'aubergine et le chou frisé, sont déjà et de plus en plus populaires parmi les segments les plus riches de la population mondiale et elles font progressivement leur chemin sur les marchés de consommation traditionnels. Selon la culture, des marchés de niche pourraient être développés ou une adoption plus généralisée encouragée pour les céréales traditionnelles telles que le quinoa cultivé en Amérique latine.

Encadré 1 : Qu'est-ce que le fonio et comment aide-t-il les agriculteurs d'Afrique de l'Ouest ?

‘Yolélé Foods' ramène le fonio, une céréale cultivée originaire d'Afrique de l'Ouest. Depuis 2017, l'entreprise-basée aux États-Unis et en partenariat avec des agriculteurs d'Afrique de l'Ouest ont réintroduit le fonio pour créer des opportunités économiques pour les communautés agricoles de petits exploitants ; pour soutenir leurs systèmes agricoles diversifiés, régénérateurs et résilients au climat ; et pour partager les ingrédients et les saveurs de l'Afrique avec le monde.

Selon le cofondateur et PDG de la société, Philip Teverow, la hausse des prix du blé à la suite de l'invasion de l'Ukraine par la Russie a souligné “la folie de dépendre des céréales importées et la folie de ne pas se tourner vers des cultures qui ont été adaptées au cours des millénaires au climat et au sol de l'Afrique”.

En 2022, l'entreprise a investi dans une usine de transformation de fonio au Mali, avec le soutien d'une subvention de 2 millions de dollars de l'USAID. Ce projet s'alignait sur la stratégie de l'entreprise consistant à “construire des installations de transformation en Afrique de l'Ouest, capables de transformer les plantes en aliments destinés à la vente locale et mondiale” et devrait créer près de 14.000 emplois et générer 4,5 millions de dollars de ventes pour les petits exploitants agricoles sur deux ans. La capacité supplémentaire servira à approvisionner ‘Yolélé Foods' ainsi que d'autres entreprises internationales intéressées par l'approvisionnement en fonio.

Avec des informations tirées d'articles publiés par Bloomberg, ‘FoodNavigator' et ‘the Culinary Scoop', ainsi que le site ‘Yolélé Foods'.

La création de chaînes de valeur pour les cultures négligées peut également encourager l'intégration du secteur informel (qui prévaut en l'absence d'un marché développé) ainsi qu'une plus grande inclusion des petits exploitants agricoles ruraux et des femmes.

Comme la culture de plantes traditionnelles et moins lucratives, incombe souvent aux femmes, les cultures négligées offrent la possibilité de donner aux agricultrices les moyens d'étendre leurs plantations et leurs récoltes — à condition que l'utilisation des plantes en cuisine soit également encouragée, grâce à des innovations qui facilitent leur préparation et prennent moins de temps. La relance des cultures négligées peut également renforcer le rôle des connaissances autochtones dans la lutte contre les crises alimentaire et climatique.

En soi, ramener des cultures négligées n'est pas une panacée pour tous les problèmes alimentaires et climatiques. Réintroduire le mil en monoculture, par exemple, ne générerait pas la diversité biologique, végétale et alimentaire souhaitée, ni ne résoudrait le problème des sols dégradés. C'est pourquoi la réintroduction de cultures négligées doit s'accompagner de politiques et de pratiques qui favorisent l'alignement sur l'agenda plus large du développement durable.

Que faudra-t-il pour ramener les cultures négligées ?

Le potentiel des cultures négligées pour le système agroalimentaire d'aujourd'hui peut être exploité avec la bonne combinaison de technologies, d'approches et de pratiques à la fois modernes et traditionnelles, pour assurer une productivité et une rentabilité accrues des cultures et de l'économie, et un alignement sur les préférences des consommateurs.

Travail de Lysiane Lefebvre, David Laborde, et Valeria Piñeiro

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Annexe sur les plantes et cultures négligées

Article Wikipédia sur Sorgo commun - Sorghum bicolor • Sorgho, Millet à balai, Sorgho bicolore - Pour les articles homonymes, voir Sorgho (homonymie).

Sorghum bicolor

Description de cette image, également commentée ci-après

Sorgo commun (panicule au stade maturation).

Classification APG III (2009)
Règne	Plantae
Clade	Angiospermes
Clade	Monocotylédones
Clade	Commelinidées
Ordre	Poales
Famille	Poaceae
Sous-famille	Panicoideae
Super-tribu	Andropogonodae
Tribu	Andropogoneae
Sous-tribu	Sorghinae
Genre	Sorghum

Espèce

Sorghum bicolor
(L.) Moench, 1794 1

Statut de conservation UICN

( LC )
LC : Préoccupation mineure

Le sorgo commun (Sorghum bicolor), aussi orthographié sorgho, est une espèce de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae (Graminées), originaire d'Afrique.

C'est une plante herbacée annuelle, qui peut atteindre 3 mètres de haut. Elle est cultivée soit pour ses graines, le sorgo grain, soit comme fourrage, le sorgho fourrager.

Le sorgo est la cinquième céréale mondiale par le volume de production, après le maïs, le riz, le blé et l'orge 2,3. C'est la principale céréale pour de nombreuses populations à faible revenu vivant dans les régions tropicales semi-arides d'Afrique et d'Asie. Cette plante est aussi la sixième source de calories alimentaires pour la population mondiale, après le riz, le blé, le sucre (de betterave et de canne), le maïs et la pomme de terre. Elle est également largement utilisée en alimentation animale sous forme de fourrage vert, de paille sèche ou de concentré de céréales4.

Description - Sorghum bicolor est une plante herbacée annuelle ou vivace à courte durée de vie, traitée comme une plante annuelle en culture5. Les tiges (chaumes) dressées, robustes, aux entrenœuds pleins, peuvent atteindre 100 à 600 cm de long et 50 à 300 mm de diamètre et portent une panicule terminale6. C'est une plante qui ressemble au maïs et à la canne à sucre.

Le sorgho commun a un système racinaire fibreux, caractéristique des graminées, qui peut atteindre une profondeur de 1,5 à 2,4 m. Ce système racinaire est très étendu et a la capacité de devenir dormant dans les périodes de stress hydrique, ce qui contribue à la résistance à la sécheresse de la plante et en fait une culture adaptable dans les systèmes agricoles marginaux des zones arides 7.

Les feuilles, qui ressemblent à celles du maïs, ont un limbe plat, linéaire à lancéolé, largement arrondi à la base, de 30 à 100 cm de long sur 5 à 10 mm de large, et une ligule membraneuse de 1 à 3 mm de long6. Elles sont disposées de façon alterne sur les côtés opposés de la tige (disposition distique) et on compte de 14 à 18 feuilles sur une plante adulte au moment de la floraison. Elles sont généralement plus courtes et plus petites vers le haut de la tige jusqu'à la feuille-drapeau qui sous-tend l'inflorescence. Elles peuvent, selon les variétés, être distribuées également le long de la tige ou au contraire groupées vers la base. Dans des conditions très sèches, les feuilles s'enroulent vers le haut et vers l'intérieur, réduisant ainsi la transpiration et la perte d'humidité en diminuant la surface exposée. Elles présentent en surface des dépôts de silice de forme irrégulière qui agissent comme une barrière physique atténuant le stress hydrique en diminuant la transpiration et contrariant la pénétration physique dans les tissus végétaux de ravageurs tels que la mouche du sorgho (Atherigona soccata)7.

Les talles sont de nouvelles tiges qui naissent au niveau des nœuds situé à la base de la tige principale. Les cultivars du sorgho ont une capacité de tallage très variable, certains tallent très tôt, tandis que chez d'autres le tallage n'intervient qu'après la floraison. Le nombre de talles dépend de caractères héréditaires, mais aussi de l'apport de carbone et des températures nocturnes. La température et la durée du jour peuvent affecter le tallage, les températures élevées et les jours courts étant des facteurs défavorables. Le tallage contribue de façon appréciable au rendement en grains7.

L'inflorescence est une panicule ouverte ou contractée, lancéolée, ovale ou globuleuse, non verticillée, de 4 à 50 cm de long sur 2 à 20 cm de large, aux ramifications terminées par un racème. Les ramifications primaires de la panicule sont apprimées ou étalées. Le pédoncule est droit ou recourbé vers le bas. Les racèmes comptent de 1 à 6 épillets fertiles, sessiles6.

Tige feuillée.

Graines de sorgo rouge et de sorgo blanc.

Panicule.

Épillets.

Sorgho AL Precioso

Les épillets fertiles, oblongs ou ovales ou orbiculaires, comprimés dorsalement, comprennent un fleuron basal stérile et un fleuron fertile, sans extension du rachillet, et mesurent de 3 à 10 mm de long. Ils persistent sur la plante à maturité. Ils sont sous-tendus par deux glumes dissemblables, ovales, cartacées ou coriaces, la glume inférieure étant plus large que la glume supérieure et dépassant l'apex des fleurons. Les fleurons fertiles ont une lemme obovale, hyaline de 1 à 3 mm de long, à l'apex entier ou denté, mutique ou portant une arête géniculée à la colonne torsadée. La fleur compte deux lodicules ciliées6.

Le fruit est un caryopse de 4 mm environ, qui est exposé à maturité entre lemme et paléole écartées. Son taux d'humidité à maturité est encore relativement élevé (25 à 30 %) et la récolte doit être séchée rapidement6.

Distribution - Le sorgho est probablement originaire d'Éthiopie, d'où il s'est répandu dans toute l'Afrique. Il était connu à Rome du temps de Pline l'Ancien. Il est également recensé par Xénophon en 401 av. J.-C. dans les plaines de Cilicie, en Anatolie, dans l'actuelle Turquie 8.

L'aire de répartition originelle de Sorghum bicolor se situe en Égypte, en Afrique tropicale orientale (Éthiopie, Kenya, Somalie, Soudan, Tanzanie, Tchad, Ouganda), en Afrique tropicale occidentale (Bénin, Burkina Faso, Côte d'Ivoire, Gambie, Ghana, Guinée, Liberia, Mali, Mauritanie, Niger, Nigeria, Sénégal, Sierra Leone), en Afrique tropicale centrale (Cameroun, Gabon, Guinée Équatoriale, République centrafricaine, République Démocratique du Congo) et en Afrique australe (Afrique du Sud, Angola, Botswana, Eswatini, Malawi, Mozambique, Namibie, Zambie, Zimbabwe).

L'espèce s'est naturalisée dans le sous-continent indien, en Australie et en Amérique du Nord et du Sud 9.

De nos jours, il est cultivé, et parfois subspontané, dans tous les continents. C'est une plante de climat chaud, mais comme pour le maïs, la sélection a permis de créer des variétés cultivables en pays tempérés. En Europe, sa culture reste cependant cantonnée aux pays méditerranéens. En France il est cultivé sur plus de 60 000 ha, principalement dans le sud-ouest en alternative au maïs car il est moins exigeant en eau10.

Utilisation

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/01/Sorgo_Avila_Spain.JPG/220px-Sorgo_Avila_Spain.JPG

Sorgo dans la zone d'irrigation de la rivière Adaja (Ávila)

Alimentation humaine

En matière d'alimentation humaine, le sorgho comme le millet sont parmi les céréales les plus cultivées en Afrique subsaharienne, après le riz et le maïs. Il s'agit d'une source principale d'alimentation de la majorité des habitants du Sahel11.

Le sorgo à grain est une culture vivrière dans de nombreux pays d'Afrique et d'Asie. Le sorgo peut se consommer en grain à l'instar du riz, ou être réduit en farine12. Sous le nom de jowar en Inde, la farine de sorgo est privilégiée dans la confection du pain bhakri, un aliment de base dans plusieurs régions. Dans les pays occidentaux il entre dans la composition de biscuits pour le goûter. En Tunisie, on réalise fréquemment des gâteaux au sorgo (droo) et la farine de sorgho mélangée à de l'eau, des épices et du sucre peut devenir une sorte de soupe roborative au petit-déjeuner. Le sorgo est également à la base de boissons recherchées, notamment pendant le ramadan. Les tiges de sorgo bicolores se mâchent tout comme la canne à sucre13.

Autres usages

Les sorghos sont également utilisés pour des usages très diversifiés dans de nombreux pays14

Les sorghos fourragers sont utilisés en alimentation animale en grains, ou comme fourrage en ensilage ou à la pâture principalement dans les pays occidentaux et en Afrique du Nord.
Herbe à chat : la plupart des mélanges vendus en distribution sont un mélange de graines d'orge et de sorgo.
Production de sucre et sirop : des tiges du sorgo bicolore est extraite une mélasse ou un sirop sucré (sirop de sorgo), aux États-Unis sont produits 1 000 litres de sirop par ha13.
Alcool, notamment au Burkina Faso, mais aussi et surtout en Chine avec le maotai, alcool de sorgo, considéré en Chine, comme le meilleur alcool ; le célèbre er guo tou (二锅头酒) de Pékin ou encore le meigui lu jiu, alcool blanc de sorgo, parfumé à la rose.
Dolo et tchapalo, boissons traditionnelles sahéliennes préparées à base de sorgo, cuit dans l'eau et fermenté avec de la levure.
Agrocarburant : le sorgo à sucre pourrait être une solution pour produire un agrocarburant tel que le bioéthanol, avec le risque quasi-certain cependant de mettre en péril les cultures vivrières locales. Un projet pilote a été mis en place en Inde, d'autres sont en cours aux Philippines, au Mexique, au Mozambique et au Kenya. Peu demandé, contrairement au maïs, l'utilisation de cette plante facile à cultiver ne déstabilise pas encore le marché alimentaire. En revanche, l'accaparement de surfaces potentiellement destinées à l'alimentation va devenir un problème crucial.[réf. nécessaire]
Le sorgo fibre permet grâce à la méthanisation de sa biomasse la fabrication de biomatériaux destinés à la fabrication de films plastiques ou de balais biodégradables.
Teinture : plusieurs variétés non-comestibles de sorgo sont cultivées exclusivement pour le colorant rouge contenu dans ses feuilles.
Toxicité

Intoxication par le cyanure d'hydrogène - Le sorgho commun contient de la dhurrine, glucoside toxique qui produit à parts égales de l'acide cyanhydrique (HCN) et du p-hydroxylbenzaldéhyde lorsqu'elle est hydrolysée sous l'action d'enzymes présents dans les cellules. Cela se produit lorsque les tissus végétaux sont perturbés (broyage, mastication, etc.). La teneur en dhurrine diminue au fur et à mesure de la croissance et surtout après la floraison, elle dépend aussi des conditions environnementales. Les sorghos à grains et les sorghos sucriers ont des teneurs en dhurrine plus élevées que les sorghos fourragers7.

Le risque d'intoxication par le cyanure concerne les animaux en particulier en cas d'ingestion de plants jeunes ou de repousses, en particulier s'il s'agit de plantes stressées ou endommagées. Il est faible lorsque les animaux consomment des plants au stade de la floraison ou de la mise à graines, ou sous forme d'ensilage 7.

Les graines de sorgho contiennent des traces de dhurrine (1 à 29 ppm), alors que les germes des mêmes graines cultivées pendant 3 jours à l'obscurité à 30 °C contiennent de 258 à 1 030 ppm de poids sec. Le séchage et le broyage des germes ne réduisent pas la teneur potentielle en HCN et la quantité de HCN obtenue à partir de germes cultivés à partir de 100 g de semences (61,3 mg) dépasse la dose fatale moyenne pour un adulte. Des ouvriers agricoles ont été terrassés par les émanations de cyanure lors de grandes opérations d'ensilage de sorgho à l'échelle industrielle. La dose létale médiane (CL50) sous forme gazeuse est comprise entre 100 et 300 μg/g, la mort survenant en moins d'une heure7.

Intoxication par les nitrates - A l'instar d'autres espèces de graminées, telles que le mil (Pennisetum glaucum) et le Sudan Grass (herbe du Soudan, Sorghum ×drummondii), le sorgho à grains ou le sorgho fourrager peuvent dans certaines circonstances accumuler des nitrates, potentiellement toxiques pour les ruminants. Les nitrates sont convertis dans le rumen en nitrites. Ceux-ci absorbés dans le sang réagissent avec l'hémoglobine pour former la méthémoglobine, ce qui bloque le transport de l'oxygène.

L'accumulation des nitrates dans les plantes se produit lorsque leur teneur dans le sol est élevée et que les conditions environnementales (sécheresse, temps froid, application d'herbicides, etc.) freinent leur conversion en protéines. On considère que les plantes contenant plus de 1,5 % de nitrate de potassium (KNO3) par rapport à la matière sèche sont potentiellement dangereuses pour du bétail affamé15.

Culture - Le semis se fait vers mai-juin : les graines de sorgho se sèment à environ 3-4 cm de profondeur en espaçant les pieds de 40 cm et les rangs de 60 cm, l'objectif de peuplement étant de 150 000 à 180 000 plantes par hectare16. Les graines se récoltent à l'automne lorsqu'elles sont dures, idéalement avant les gelées. Il faut ensuite les faire sécher et les décortiquer pour enlever le son. En France, son rendement moyen est de 53 quintaux/hectare17.

Nutrition

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d7/Gluten_free_beer_in_a_market.jpg/220px-Gluten_free_beer_in_a_market.jpg

Bière sans gluten dans un supermarché américain. Article détaillé : maladie cœliaque.

Le millet et le sorgho ne contiennent pas de gluten. On peut maintenant trouver les farines et les grains certifiés sans gluten de ces céréales dans des endroits spécialisés pour les allergies alimentaires. Il existe également de la bière certifiée sans gluten.

Production - La très grande majorité des surfaces semées en sorgho se trouvent en Afrique et en Asie (Inde notamment). Les pays occidentaux produisent environ 40 % de la récolte mondiale, pour l'alimentation animale, sur 10 % seulement de la surface totale.

Les principaux pays producteurs en millions de tonnes en 201418 :

{{}}	Pays	Production (million de tonnes)	Monde (%)
1	États-Unis	10,988	16,2
2	Mexique	8,394	12,4
3	Soudan	7,271	10,7
4	Nigeria	6,741	9,9
5	Inde	5,390	7,9
6	Éthiopie	4,339	6,4
7	Argentine	3,466	5,1
8	Chine	2,961	4,4
9	Brésil	2,279	3,4
10	Burkina Faso	1,708	2,5
11	Niger	1,426	2,1
12	Australie	1,282	1,9
13	Mali	1,272	1,9
14	Cameroun	1,150	1,7
15	Tchad	0,897	1,3
Total monde		67,871	100 %

Taxinomie - L'espèce Sorghum bicolor a été décrite par le botaniste allemand, Moench, et publiée en 1794 dans Methodus Plantas Horti Botanici et Agri Marburgensis : a staminum situ describendi19. Auparavant, Linné avait décrit, et publié en 1753 dans son Species plantarum, trois espèces distinctes pour le sorgho cultivé : Holcus sorghum, Holcus saccaratus et Holcus bicolor20. En 1794, Moench créa le genre Sorghum, séparé du genre Holcus, et regroupa dans une espèce unique, Sorghum bicolor, tous les sorghos cultivés21.

Noms vernaculaires - Sorgo à sucre, sorgho en ancienne orthographe, sorgo grain, gros mil (Afrique), millet indien, grand millet, millet à balai, blé égyptien, dari, doura, gros millet, riz égyptien, sorgho à balai, sorgho blanc, sorgho commun, sorgho vulgaire, sorgho douro, sorgho feterita, sorgho du Soudan, sorgho durra, sorgho menu, sorgho penché22,23.

Synonymes - Selon Catalogue of Life (16 mars 2018)24 : [afficher] Liste des synonymes

Liste des sous-espèces et variétés

Selon Tropicos (25 août 2016)25 (Attention liste brute contenant possiblement des synonymes) :

sous-espèces :
- Sorghum bicolor subsp. arundinaceum (Desv.) de Wet & J.R. Harlan ex Davidse
- Sorghum bicolor subsp. bicolor
- Sorghum bicolor subsp. drummondii (Nees ex Steud.) de Wet ex Davidse
- Sorghum bicolor subsp. verticilliflorum (Steud.) de Wet ex Wiersema & J. Dahlb.
variétés :
- Sorghum bicolor var. arduini Snowden
- Sorghum bicolor var. bicolor
- Sorghum bicolor var. cafer (Ard.) Fosberg & Sachet
- Sorghum bicolor var. caffrorum (Thunb.) Mohlenbr.
- Sorghum bicolor var. cernuum (Ard.) Ghişa
- Sorghum bicolor var. charisianum (Busse & Pilg.) Snowden
- Sorghum bicolor var. drummondii (Nees ex Steud.) Mohlenbr.
- Sorghum bicolor var. exaristatum Doronina & Ivanjuk.
- Sorghum bicolor var. obovatum (Hack.) Fosberg & Sachet
- Sorghum bicolor var. picigutta Snowden
- Sorghum bicolor var. rotundulum (Snowden) Fosberg & Sachet
- Sorghum bicolor var. saccharatum (L.) Mohlenbr.
- Sorghum bicolor var. subglabrescens (Steud.) Fosberg & Sachet
- Sorghum bicolor var. subglobosum (Hack.) Snowden
- Sorghum bicolor var. technicum (Körn.) Stapf ex Holland
- Sorghum bicolor var. transiens (Hack.) Fosberg & Sachet
  Variétés cultivées - Il existe plus de 128 variétés de sorgho grain inscrites dans le Catalogue européen des espèces et variétés26. Environ 145 variétés de sorgho grain sont inscrites au Catalogue officiel français27.

Voir aussi - Le « sorgho » voit son nom attribué au 24e jour du mois de fructidor du calendrier républicain ou révolutionnaire français28, généralement chaque 10 septembre du calendrier grégorien.

Source avec Notes et références : https://fr.wikipedia.org/wiki/Sorgo_commun

Article Wikipédia sur Millet (graminée) - Pour les articles homonymes, voir Millet.

Nom vulgaire ou nom vernaculaire ambigu :
l'appellation « Millet » s'applique en français à plusieurs taxons distincts.

Description de cette image, également commentée ci-après

Millet séché

Taxons concernés

Dans la famille des Poacées :

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Millet est un terme générique qui désigne en français plusieurs espèces de plantes de la famille des Poacées (graminées). Ce sont des céréales vivrières, à très petites graines, cultivées principalement dans les zones sèches, notamment en Afrique et en Asie. Elles sont souvent appelées aussi mil. Millet sans autre précision désigne souvent le millet commun, mais le millet le plus cultivé est le « millet perle ».

Moins exigeantes et plus rustiques que le sorgho commun, ces espèces sont bien adaptées aux zones tempérées ou tropicales sèches où la saison des pluies est brève.

Le sorgho commun, graminée céréalière et fourragère, est appelé aussi « gros millet » ou « millet indien ».

Étymologiquement, millet est un diminutif de mil, terme qui dérive du latin millium, nom de ces plantes en latin.

Histoire du millet - Vers 10 000 av. J.-C. ont lieu des « révolutions néolithiques » en Chine. La culture du millet apparaît ainsi dans les bassins des fleuves Yangtsé et fleuve Jaune 1, notamment il y a 11 000 ans dans les sites de Nanzhuangtou et de Donghulin qui révèlent des grains de Setaria italica (Millet des oiseaux) et de Panicum miliaceum (Millet commun) retrouvés sur des outils de pierre et dans des poteries, ces plantes étant devenues les cultures céréalières traditionnelles dominantes en Chine2. Des chercheurs chinois ont affirmé avoir retrouvé en 2005 des nouilles à base de millet datant de 2000 av. J.-C. à Lajia, dans la partie amont du fleuve Jaune 3, concluant que la Chine avait inventé les pâtes avant les italiens. Cette découverte fait néanmoins débat car aucun outil pour moudre de la farine n'a été trouvé sur le site. De plus, le millet, ne contenant pas de gluten, ne permet pas de faire de nouilles seul et ce n'est que plus tard que le blé, plus collant, serait arrivé dans la région mentionnée4. Le millet a été consommé et cultivé, sans être domestiqué, par des chasseurs-cueilleurs puis des éleveurs en Libye durant la période du subpluvial néolithique (« Sahara vert »), de 7 500 à 3 000 av. J.-C 5.

La culture du millet se diffuse dans la région de la Mer Noire 5 000 av. J.-C., au Japon 4 000 av. J.-C. et en Corée 3 500 av. J.-C.6 Depuis l'Antiquité et jusqu'au Moyen Âge le millet a été consommé dans toute l'Europe méditerranéenne sous forme de bouillie ou de galette appelée milhàs en langue d'oc, mălai en roumain (qui a d'abord désigné la semoule de millet, avant de désigner celle de maïs), cruchade en Gascogne, mell en Poitou (notamment en Vendée), miglio en Italie, etc. Il a été remplacé par le maïs dans les cultures et l'alimentation depuis l'introduction de cette dernière céréale au XVI e siècle.

Aspects économiques En général, les statistiques englobent toutes les cultures de millet dans une seule rubriquenote 1. La production mondiale est estimée à 28 millions de tonnes (soit environ 1,5 % du total céréalier), dont 95 % viennent de l'Afrique et de l'Asie. Dans les pays du Sahel, en Afrique de l'Ouest, le mil, culture vivrière importante pour la sécurité alimentaire de ces pays, représente souvent plus de 30 % de la production céréalière totale. Il s'agit généralement d'une culture extensive, pratiquée sans irrigation, ni engrais. Les rendements dans ces conditions sont très bas, compris entre 200 et 500 kg par hectare. Dans les pays développés, le millet occupe une place très marginale, comme aliment des oiseaux de volière. Il y a peu d'échanges au niveau du commerce international, la production étant le plus souvent autoconsommée.

Productions - Principaux pays producteurs en millions de tonnes
	Pays	Production en 20147	% monde	Production en 20198
1	Inde	11,420	41 %	10,235
2	Niger	3,322	11,9 %	3,270
3	Chine	1,776	6,4 %	2,3009
4	Mali	1,715	6,2 %	1,878
5	Nigeria	1,385	5 %	2,000
6	Soudan	1,258	4,5 %	1,133
7	Burkina Faso	0,973	3,5 %	0,970
8	Éthiopie	0,915	3,3 %	1,125
9	Tchad	0,683	2,5 %	0,717
10	Russie	0,493	1,8 %	0,439
Total monde		27,827	100 %	30,672

Intérêt alimentaire - Articles connexes : Soungouf et Thiéré (couscous).

Le millet est un aliment énergétique, nutritif, recommandé pour les enfants et les personnes âgées ou en convalescence [réf. nécessaire].

Il est consommé surtout sous forme de bouillies et de galettes. La farine de mil devient rapidement rance et ne peut pas être conservée longtemps. Traditionnellement, le grain est pilé dans un mortier. De plus en plus, on mécanise cette préparation : le grain est alors passé dans une décortiqueuse et un moulin à farine, ce qui évite un travail laborieux et améliore la qualité de la farine. La teneur en protéines des différents mils, et leur qualité, se compare à celle du blé ou du maïs. Une des principales espèces de millet, l'éleusine a une teneur relativement élevée en méthionine, acide aminé qui fait souvent défaut dans les céréales tropicales.

Le millet contient un gluten dont la composition comprend notamment une protéine de la famille des prolamines, la panicine, à hauteur de 40 %10.

À partir de la farine de mil (soungouf), on prépare des couscous de mil dont les grains sont de différentes tailles11 :

le thiéré est un couscous fin cuit à la vapeur ;
le thiakry est un couscous à gros grains cuit à l'eau ;
l'araw, le laakh et le fondé sont des couscous à très gros grains cuits à l'eau.
Principaux taxons appelés « millets »

Les millets les plus cultivés sont indiqués en gras.

Tribu des Andropogonées :

Coix spp. : larmes-de-Job
Tribu des Eragrostidées :

Eleusine coracana : éleusine
Eragrostis tef : teff
Tribu des Panicées :

Brachiaria deflexa : fonio à grosse graine
Digitaria spp. : fonio blanc, fonio noir, millet sanguin...
Echinochloa spp. : millet japonais
Panicum miliaceum : millet commun
Paspalum scrobiculatum : herbe à épée
Pennisetum glaucum : Millet perlé
Setaria italica : millet des oiseaux
Urochloa ramosa : panic rameux (browntop millet en anglais)
Le maïs et le sorgho sont parfois comptés parmi les millets majeurs.

Éleusine ou « ragi » - Article détaillé : Éleusine. Nom scientifique : Eleusine coracana.

Cette plante produit plusieurs épis au sommet de la tige. Ses graines sont très petites (1-2 mm de diamètre). Ses besoins en eau sont légèrement supérieurs à ceux des autres espèces de mil.

L'éleusine, appelée « ragi » en Inde, est une culture vivrière importante en Afrique orientale et en Asie (Inde, Népal), où elle se cultive jusqu'à 2 000 m au-dessus du niveau de la mer.

Fonio ou « mil africain »

Ce terme regroupe plusieurs espèces de céréales mineures cultivées en Afrique de l'Ouest dans les régions sèches sub-sahéliennes.

« Fonio blanc » (Digitaria exilis), culture très importante en Afrique de l'Ouest : Mali, Nigeria, Niger, Burkina Faso, Sénégal et Guinée.
« Fonio noir » (Digitaria iburua), présent au Nigeria, au Togo et au Bénin.
« Fonio à grosses graines » (Brachiaria deflexa), culture pratiquée seulement dans le massif du Fouta-Djalon en Guinée et en Sierra Leone.
Millet commun - Article détaillé : Millet commun. Nom scientifique : Panicum miliaceum. Noms communs : « millet blanc » ou « millet à grappes »·

Plante de 1,3 m environ, à inflorescences en panicules lâches, ramifiées et tombantes.

Cette céréale est cultivée dans des régions tempérées, en Russie, en Ukraine, au Kazakhstan, aux États-Unis, en Argentine et en Australie.

Diverses variétés, avec des grains de couleur blanche, jaune, brune et même noire, étaient cultivées en France jusqu'à l'époque contemporaine. La plupart ont disparu des cultures, mais certaines se sont maintenues, à l'état d'adventices, notamment dans les champs de maïs12.

Millet des oiseaux - Article détaillé : Millet des oiseaux.

Millet à grappes ou du millet en branches Setaria italica.

Millet à grappes ou du millet en branches Setaria italica. Nom scientifique : Setaria italica. Noms communs : « petit mil » ou « miliade ».

Plante de 1 à 1,5 m environ, à inflorescences longues, cylindriques, assez compactes, autrefois semée dans les prairies temporaires. Remis au gout du jour dans toute l'Europe grâce aux nouvelles normes visant à favoriser la biodiversité aux abords des champs.

Le premier pays producteur est la Chine. Espèce cultivée également en Inde, en Indonésie, en Corée, dans le Sud de l'Europe et en Afrique orientale.

Millet indien - Article détaillé : Éleusine des Indes.

Éleusine des Indes.

Éleusine des Indes. Nom scientifique : Panicum sumatrense. Culture répandue en Inde, au Népal, au Pakistan, au Sri Lanka, dans l'est de l'Indonésie et l'ouest de la Birmanie.

Millet japonais

Tête de millet japonais.

Tête de millet japonais. Deux espèces de « millets japonais » sont cultivées en Asie : Noms scientifiques : Echinochloa esculenta et Echinochloa frumentacea. Culture importante dans les régions subtropicales de l'Inde.

Millet perle ou « petit mil » - Article détaillé : Millet Perle.

Millet perle.

Millet perle. Nom scientifique : Pennisetum glaucum. Noms communs : « millet perle, petit mil, mil à chandelle, mil pénicillaire » ou « mil » (tout court). C'est la plus cultivée de toutes les espèces de mil, il représente la moitié de la production mondiale de mil ; parmi celles-ci, c'est celle qui a le potentiel de rendement le plus élevé en conditions de sécheresse. Il croît sur des sols sableux et pauvres, là où on ne pourrait pas cultiver le maïs, le sorgho ni même l'éleusine. Les graines se forment sur un faux épi compact de 10 à 150 cm de long (chandelle). Culture traditionnelle en Afrique, surtout au Sahel, en Asie (Inde, Pakistan). Introduit récemment comme culture céréalière aux États-Unis, où il est utilisé comme fourrage d'été.

Teff - Article détaillé : Teff.

Teff

Teff - Nom scientifique : Eragrostis tef. - Céréale à graines très petites, cultivée dans les régions montagneuses de l'Éthiopie, où sa production dépasse celle de la plupart des autres céréales. Tolère les sols lourds, mal drainés.

Coix - Article détaillé : Coix.

Coix lacryma-jobi

Coix lacryma-jobi - Nom scientifique : Coix lachryma-jobi - Noms communs : coix, aussi appelé larme de Job, est une céréale très secondaire, surtout cultivée dans le sud-est asiatique.

Herbe à épée - Article détaillé : Herbe à épée.

Graines de Paspalum scrobiculatum.

Graines de Paspalum scrobiculatum.- Nom scientifique : Paspalum scrobiculatum - Noms communs : herbe à épée. C'est une céréale spontanée en Afrique occidentale et en Inde, abondante le long des chemins, dans les fossés et les dépressions. En Inde, cette espèce a été domestiquée il y a environ 3000 ans.

Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Millet_(gramin%C3%A9e)

Le fonio : une céréale africaine – Document ‘cirad.fr'

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Grains de fonio et de fonio sauvage (© J-F Cruz, Cirad)
Epis de fonio (© J-F Cruz, Cirad)
Battage traditionnel du fonio (© J-F Cruz, Cirad)
Le fonio (Digitaria exilis ) est cultivé en Afrique de l'Ouest depuis des siècles. Longtemps réduit à l'état de céréale marginale à cause de la petitesse de ses grains, le fonio connaît aujourd'hui un regain d'intérêt en raison des qualités gustatives et nutritionnelles que lui reconnaissent les consommateurs.

Des recherches réalisées depuis une vingtaine d'années ont permis de mécaniser plusieurs étapes de sa transformation pour mieux le valoriser sur les marchés urbains locaux ou à l'exportation vers l'Europe ou l'Amérique.

Ce site est réalisé par les Unités Mixtes de Recherche QualiSud et Innovation du Cirad en collaboration avec des Instituts de Recherche d'Afrique de l'Ouest (IER-Mali, IRAG-Guinée, IRSAT-Burkina Faso, ESP-Sénégal...) et il bénéficie des contributions de nombreux acteurs de la recherche et du développement travaillant dans et pour les pays du Sud.

Il s'adresse en priorité aux acteurs des filières céréalières, mais aussi à tous ceux qui s'intéressent aux espèces parfois négligées mais participant pleinement à la diversité alimentaire.

Vidéo : le fonio - L'ouvrage Le fonio, une céréale africaine a été publié aux Editions QUAE en 2011.

L'ouvrage Fonio, an African cereal a été publié par le Cirad et l'IRAG en 2016.

Fonio (© J-F Cruz, Cirad)Contact - © Cirad 2004, 2019 — Cookies et statistiques — Informations légales — Contact- Source : https://fonio.cirad.fr/

Voir également : Digitaria exilis –Wikipedia https://fr.wikipedia.org › wiki › Digitaria_exilis– « Le fonio blanc est une plante herbacée de 80 cm de haut. Son inflorescence composée est formée de racèmes regroupant des épillets à deux fleurs ... »

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Collecte de documents et agencement, traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 26/
06/2023

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"Il faut réduire réellement l'emploi des pesticides en agriculture plutôt que de faire de vaines promesses pour défendre les ‘nouveaux Organismes Génétiquement Modifiés' (OGM) - Nouvelles techniques de sélection des plantes" par GMWatch

GMWatch — 2023-06-14T14:34:18Z

ISIAS Pesticides OGM

Il faut réduire réellement l'emploi des pesticides en agriculture plutôt que de faire de vaines promesses pour défendre les ‘nouveaux Organismes Génétiquement Modifiés' (OGM) - Nouvelles techniques de sélection des plantes

Traduction 13 juin 2023 par Jacques Hallard – avec ajout d'une annexe sur ‘New Breeding Techniques' ou Nouvelles techniques de sélection des plantes' d'un article publié le 06 juin 2023 par ‘gmwatch.org' et intitulé « Real pesticide reduction instead of empty promises for GMOs » ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20230-real-pesticide-reduction-instead-of-empty-promises-for-gmos

Les politiciens conservateurs torpillent la réduction des pesticides dans l'Union européenne (UE), tout en appelant à la déréglementation des ‘nouveaux OGM'

Dans une série de marchandages politiques, la Commission européenne envisage de ‘vendre' la déréglementation des nouveaux OGM avec la réduction des pesticides de l'UE (Règlement sur l'utilisation durable, ou SUR en abrégé) comme un 'package deal'.

Cependant, une analyse de ‘foodwatch' montre que les promesses hypothétiques de nouvelles plantes cultivées OGM (issues des nouvelles techniques génomiques, NGT) résistantes aux ravageurs ou aux maladies, sont un ‘hareng rouge'.

[Hareng rouge – Expression tirée du nom d'un poisson de la famille des Clupeidae (également dénommé Kipper), le terme « hareng rouge » (en anglais : red herring) est utilisé au cinéma 1 ou en littérature 2. Il s'agit d'un procédé de narration qui vise la mise en place d'une ou plusieurs fausses pistes pour aboutir à un retournement final, non anticipé par le public, donnant un tout autre sens à l'intrigue. Agatha Christie en fait explicitement usage dans Dix Petits Nègres en exploitant la chanson et le jeu possible que lui offre la double interprétation du terme (dans la septième strophe : « Quatre petits nègres s'en allèrent en mer. / Un hareng saur avala l'un d'eux / et il n'en resta plus que Trois » ou, selon les traductions, « Quatre petits nègres se baignèrent au matin, / Poisson d'avril goba l'un / N'en resta plus que trois » ; en anglais « hareng saur » et « poisson d'avril » étant « red herring » ou « hareng rouge »)… » - Source ]

'Les nouvelles plantes cultivées génétiquement modifiées n'entraînent pas de réduction de l'emploi des pesticides, bien au contraire', affirment les ONG GLOBAL 2000, ‘Bund für Umwelt und Naturschutz Deutschland' (BUND) et Foodwatch.

'Bien au contraire, la déréglementation de la législation européenne sur les OGM donnerait aux entreprises agroalimentaires - comme Bayer et Corteva - un contrôle encore plus grand sur nos semences et soutiendrait le modèle commercial des semences de plantes résistantes aux herbicides, y compris les pesticides dans l'emballage. Les perdants de cet accord toxique seraient l'environnement, la biodiversité, les consommateurs et les agriculteurs'.

Forte augmentation de l'utilisation des pesticides requise avec la Réglementation de l'utilisation durable des pesticides (SUR)

Que les plantes génétiquement modifiées aident à réduire l'utilisation de pesticides n'est jusqu'à présent qu'une affirmation du secteur de l'agro-industrie. Jusqu'à présent, l'Union européenne n'a pas publié de chiffres concrets sur un tel potentiel des technologies de ce ‘nouveau génie génétique'. Il n'existe pas non plus de données provenant d'une recherche sur le sujet. Dans les pays où la proportion de variétés de plantes génétiquement modifiées est élevée, aucune réduction des pesticides n'a été réalisée au cours des 25 années écoulées depuis leur introduction en agriculture, et l'utilisation des pesticides s'est multipliée.

Lars Neumeister, auteur de l'étude et expert en pesticides chez ‘Foodwatch', a déclaré : 'Au Brésil, par exemple, l'utilisation des pesticides a plus que quadruplé depuis 2000. En ce qui concerne la réduction des pesticides dans l'Union européenne, le potentiel de ce ‘Nouveau génie génétique' est actuellement proche de zéro. En revanche, le potentiel de réduction des pesticides grâce à la protection préventive des plantes cultivées et à l'amélioration écologique, est de 60 à 100 pour cent'.

Les groupes politiques souhaitent que l'UE introduise rapidement une loi ambitieuse pour la réduction obligatoire des pesticides, ainsi qu'un instrument de mesure significatif pour enregistrer cette réduction de l'emploi des pesticides.

Modèle économique : cercle vicieux des pesticides

Lars Neumeister a déclaré : 'Les cultures de NGT accéléreront la perte de diversité génétique, en particulier si le génie génétique est sous le contrôle de quelques sociétés mondiales de pesticides et de semences. L'uniformité génétique est une cause majeure de l'utilisation des pesticides. Une uniformité génétique plus élevée entraîne à son tour une utilisation accrue de pesticides et l'utilisation de pesticides encore plus dangereux contre les mauvaises herbes résistantes. Ce cycle fatal stimule les ventes des entreprises'.

Les quatre plus grandes entreprises semencières mondiales détiennent environ 60% du marché total des semences. Ces entreprises (Bayer, Syngenta, Corteva, BASF) sont également les plus gros vendeurs de pesticides.

[Voir à ce sujet : « The sobering details behind the latest seed monopoly chart » par Kiki Hubbard - This article was originally published in June 2019] ; source : « https://www.pccmarkets.com/sound-consumer/2019-06/the-sobering-details-behind-the-latest-seed-monopoly-chart/ ]

La proposition législative pour la loi européenne sur le génie génétique est attendue pour le 05 juillet 2023.

Il y a des raisons de craindre que la Commission européenne déréglemente les plantes NGT sous prétexte de réduction des pesticides et que les plantes NGT soient commercialisées à l'avenir sans étiquetage et sans évaluation suffisante des risques. Dans le même temps, les politiciens conservateurs de l'UE en particulier, torpillent le projet de loi européen sur la réduction des pesticides dans les négociations en cours au Conseil et au Parlement européen.

Brigitte Reisenberger de GLOBAL 2000 a déclaré : 'La Commission européenne ne doit pas s'impliquer dans ce marchandage politique, car il est basé sur les fausses promesses du lobby agroalimentaire. Les nouvelles plantes cultivées génétiquement modifiées augmentent l'utilisation de pesticides et alimentent la crise de la biodiversité. Pour une agriculture résiliente, diversifiée et adaptée au climat et la sauvegarde de la production agricole pour les générations futures, un engagement fort et juridiquement ancré en faveur de la réduction des pesticides, d'une part, et une réglementation stricte continue et une évaluation des risques des nouvelles plantes génétiquement modifiées, d'autre part, sont tous deux nécessaires.'

Les vraies solutions sont sur la table

La diversité de nos champs et des variétés de plantes robustes et adaptées localement sont la clé d'une agriculture qui aide efficacement à faire face à la crise climatique et à la diminution de la biodiversité. 'Travailler avec moins ou même pas de pesticides chimiques de synthèse est possible – l'agriculture biologique le montre. La lutte intégrée contre les ravageurs repose également d'abord sur la prévention et la promotion des insectes bénéfiques. Une rotation des cultures plus large et plus diversifiée peut contribuer à réduire le nombre d'organismes nuisibles.

En revanche, les plantes génétiquement modifiées avec une résistance aux herbicides insérée, n'aident certainement pas, bien au contraire : leur culture, qui implique davantage d'utilisation de pesticides, nuit encore plus la biodiversité. La liberté de choix pour l'agriculture écologique et sans OGM - mais aussi pour les consommateurs -, ne peut être garantie qu'avec une loi forte sur le génie génétique', a déclaré Pia Voelker de la branche allemande des ‘Amis de la Terre' en Allemagne (Bund für Umwelt und Naturschutz Deutschland e. V.-BUND. Source : Données BUND 2000

[Voir et écouter aussi : Statement on Genome Editing (Pia Völker) – YouTube - YouTube https://www.youtube.com › watch - Vidéo en anglais 4:04https://www.google.fr/search?q=Pia+...

YouTube · Tagesspiegel — Veranstaltungen · 30 juin 2021

Pia Voelker works as an editor for topics related to genetic engineering in agriculture at the organization 'Gen-ethisches Netzwerk' in Berlin…

Pia Voelker travaille comme rédactrice pour les sujets liés au génie génétiqu

Référence du document traduit : https://www.gmwatch.org/en/

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Annexe – ‘New Breeding Techniques' ou Nouvelles techniques de sélection des plantes

Les nouvelles techniques de sélection des plantes, appelées aussi « nouvelles techniques de sélection végétale » ou « nouvelles techniques d'amélioration des plantes » (en anglais « new breeding techniques (NBT) ou new plant breeding techniques », sont un ensemble de techniques d'édition génomique employées dans le domaine de la sélection végétale pour développer de nouvelles variétés cultivées (cultivars) de plantes.

Historique

La plupart de ces techniques ont été rassemblées pour la première fois sous l'appellation « NBT » par le rapport de 2011 du Centre commun de recherche de l'Union européenne 1. Individuellement, ces techniques peuvent cependant être très anciennes, comme la pratique de la greffe, ou très récentes, comme CRISPR-Cas9 mise au point en 2012.

Techniques

Liste des techniques utilisées dans le cadre des NBT

Selon les travaux du Centre commun de recherche européen 1 et du Haut Conseil des biotechnologies français 2, l'appellation New Breeding Techniques recouvre l'ensemble des techniques suivantes :

nucléase à doigt de zinc (ZFN) ;
nucléases effectrices de type activateur de transcription (TALEN) ;
CRISPR-Cas9 ;
mutagénèse dirigée par oligonucléotides ;
modulation de l'expression des gènes par RdDM (interférence par ARN) ;
agroinfiltration ;
greffe (avec emploi d'un greffon et/ou d'un porte-greffe génétiquement modifié) ;
cisgénèse et intragénèse ;
biologie de synthèse ;
méganucléase ;
sélection inverse.
Certaines de ces techniques ne sont pas spécifiques au domaine végétal, ou ne sont pas réellement nouvelles, à l'exemple de la pratique de la greffe. En outre, ces différentes techniques sont susceptibles d'être utilisées simultanément ou en complément d'autres techniques comme la sélection génomique 2. Par exemple, la capacité d'Agrobacterium à introduire de nouveaux gènes dans une plante (c'est-à-dire l'agroinfiltration) est utilisée comme vecteur pour l'introduction des nucléases issues de différentes techniques (ZFN, TALEN ou CRISPR-Cas9)3,4.

Objectifs

Les NBT permettent de produire plusieurs types d'effets5 :

Les New Breeding Techniques se distinguent par leur capacité à cibler et modifier le génome des plantes2, et d'obtenir rapidement des variétés stables, à la différence des méthodes classiques de sélection végétale 6 qui procèdent par croisements et qui prennent plusieurs années supplémentaires. Par rapport aux OGM (organismes génétiquement modifiés), les plantes obtenues par les techniques NBT sont réputées se caractériser par l'absence d'ADN étranger6. De même, avec l'utilisation des NBT « rien ne permet de différencier une modification naturelle d'une modification volontaire », estime Léon Otten, chercheur à l'Institut de biologie moléculaire des plantes du CNRS. Ainsi, une plante à fleurs sur 20 serait naturellement modifiée par des agrobactéries, qui y insèrent une partie de leurs gènes. Parmi les espèces végétales concernées par ces insertions horizontales de gènes extérieurs, on compte le théier, le houblon, la patate douce, le tabac ou la banane 3,7,4.

L'utilisation des NBT vise à permettre6 :

une action limitée aux gènes d'intérêt ;
l'absence de recours à de l'ADN étranger ;
l'édition multiple d'un gène ;
l'édition simultanée de plusieurs gènes ;
l'élargissement maîtrisé de la base génétique d'une espèce ;
le développement de tout trait d'intérêt agronomique ou écologique ;
la domestication accélérée d'une espèce.
Risques

Selon le comité consultatif commun d'éthique de l'INRA, CIRAD et d'Ifremer, « Les risques associés aux nouvelles techniques d'édition du génome sont pluriels et intriqués entre eux : environnementaux, sanitaires, agricoles, économiques, sociaux et politiques. Ceux spécifiquement associés à ces nouvelles techniques sont peu nombreux : principalement le bioterrorisme qui reste toutefois une menace abstraite pour les végétaux. De la sorte, le précédent des plantes génétiquement modifiées (PGM, obtenues par transgenèse) a permis d'investiguer et documenter la plupart des risques environnementaux et sanitaires existants. Pour les risques agricoles, l'édition du génome peut à la fois être un facteur réduisant l'agro-biodiversité mais aussi une solution pour l'enrichir et répondre à de nouveaux enjeux. Dans son 11e avis, le Comité d'éthique analyse également les risques économiques, sociaux et politiques et relève que différentes interrogations pointent vers une préoccupation commune : faire en sorte que ces nouvelles technologies, associées aux régimes de propriété intellectuelle, ne dépossèdent pas les citoyens de leur capacité d'action sur des objets d'intérêt commun. Ce qui invite à repenser les liens entre techniques et systèmes agricoles8. »

Applications

Grâce aux NBT, il est possible d'intégrer à des végétaux des traits nouveaux au sein de l'espèce ou issus d'autres variétés.

Les principales filières agricoles et alimentaires considèrent que l'utilisation de ces techniques de sélection peuvent avoir de nombreuses applications dans différents domaines9.

Résistance aux maladies

Les NBT sont employées dans des recherches visant à développer les résistances des plantes à différentes maladies. Une variété de maïs résistante à la nécrose létale du maïs, destinée à l'Afrique de l'Est, est en cours de création par le CIMMYT en utilisant CRISPR/Cas9 10,11. CRISPR/Cas9 a également été utilisé pour développer la résistance de variétés de tomate et de concombre aux potyvirus, en inactivant un gène utilisé par cette famille de virus pour se développer dans les organismes hôtes12.

En parallèle, les TALENs sont utilisées dans des recherches visant à développer la résistance du riz aux bactéries Xanthomonas 13,14.

La cisgénèse a également permis à des pommes de terre de devenir résistantes au mildiou, en combinant simultanément trois gènes de résistance à cet agent pathogène15.

Adaptation aux conditions environnementales

La technique CRISPR/Cas9 a permis de favoriser l'expression d'un gène connu pour accroître la tolérance du maïs à la sécheresse en remplaçant le promoteur associé par un promoteur augmentant sa fréquence d'expression 16.

Qualité nutritionnelle et conservation des aliments

Grâce à l'utilisation des TALENs, un gène en partie responsable de la synthèse d'acides gras chez le soja a été éteint, augmentant la part des acides mono-insaturés et réduisant celle des acides gras saturés, améliorant ainsi la qualité nutritionnelle de l'huile extraite de la variété de soja concernée17.

L'interférence par ARN a également servi à empêcher l'expression d'un gène provoquant la modification de l'amidon de la pomme de terre au contact du froid (conservation réfrigérée). Sans cela, l'amidon transformé en sucres réducteurs, lorsque la pomme de terre est ensuite mis au contact de hautes températures (huile de friture), produit des acrylamides, probablement cancérogènes pour l'homme18.

Développement de l'agriculture biologique

En pratique, les différentes applications des NBT peuvent être utilisées pour renforcer la résistance des variétés cultivées, en y introduisant des caractéristiques de variétés sauvages (procédé de « rewilding ») afin d'améliorer les rendements en agriculture biologique. De cette manière, les plantes ont moins besoin d'engrais ou des pesticides, objectifs fixés par l'IFOAM à l'agriculture biologique19.

Selon le comité éthique commun de l'INRA, CIRAD et d'Ifremer, « les techniques d'édition de génome sont pleinement compatibles avec l'agro-écologie ». Les scientifiques consultés évaluent que les objectifs principaux de l'agro-écologie peuvent être atteints grâce aux NBT, par exemple l'augmentation de la biodiversité, la réduction de la quantité d'intrants (herbicides, engrais…) ou la suppression de la résistance à un herbicide par des mutations dirigées visant à revenir à la plante sauvage. Les membres du comité soulignent la nécessité de « prendre le temps d'améliorer, soulignant que les « ciseaux moléculaires » offerts par CRISPR-Cas9 ne pourront apporter les solutions aux problèmes de l'agriculture qu'à la condition qu'on leur donne le temps de s'éprouver dans des milieux ouverts », tout en ouvrant les systèmes d'évaluation des innovations au-delà de l'analyse bénéfices-risques et de « mener une réflexion collective et inclusive » à laquelle participe la société8.

Une position similaire a été exprimée par l'agronome Michel Griffon qui juge que les « nouvelles biotechnologies végétales offrent des opportunités très intéressantes pour consolider une agriculture ancrée dans une vision écologique de la production végétale »20. Idem pour Urs Niggli, directeur de l'Institut de recherche sur l'agriculture biologique (Forschungsinstitut für biologischen Landbau, FIBL) qui évoque le « grand potentiel » des NBT comme moyen de lutter contre les maladies et d'éviter l'utilisation de pesticides en agriculture biologique 20,21. La FiBL dresse une liste de priorités aux NBT appliquéses à l'agriculture biologique22 :

la résistance des semences aux maladies ;
une vitesse de développement rapide des plantes ;
domination et tolérance aux adventices ;
résistance à la verse ;
augmentation de l'assimilation des nutriments grâce au développement du réseau racinaire et de la symbiose avec les organismes du sol ;
ensemble des traits améliorant la qualité de la plante et de ses produits.
Toutefois, la FiBL s'inquiète des problématiques d'usage des variétés en fonction des formes de propriété intellectuelle appliquées et déplore le fait que ces techniques soient principalement mises en œuvre par les plus importantes entreprises semencières22.

Cadre juridique

La Cour de justice de l'Union européenne dans un jugement rendu sur le statut réglementaire des variétés issues des biotechnologies végétales établit que les organismes issus des nouvelles techniques de mutagénèse ne sont pas exclus de la directive 2001/18 et doivent par conséquent être considérés comme des OGM23.

Hors de l'Union européenne, des États ont adopté leur réglementation au développement des New Breeding Techniques :

le Département de l'Agriculture des États-Unis a indiqué ne pas mettre en place de régulation spécifique pour les plantes créées grâce aux NBT, tant que celles-ci auraient pu être obtenues par les méthodes de sélection classiques. Une exception est toutefois prévue pour les variétés de plante sécrétant ou tolérantes à des pesticides24 ;

au Canada, la législation se focalise sur le caractère nouveau d'un trait, indépendamment de la manière dont une variété en a été dotée, que ce soit par sélection traditionnelle ou par d'autres méthodes, parmi lesquelles les NBT25 ;

au Brésil, l'autorisation des variétés impliquant l'usage des nouvelles techniques de sélection se base, depuis janvier 2018, sur une évaluation au cas par cas centrée sur les caractéristiques de la plante et la présence ou non d'ADN d'une autre espèce. De plus, la Commission technique nationale de biosécurité prend en compte l'éventualité que la variété ait pu être autorisée dans un autre pays26 ;

l'Argentine a adapté sa législation pour être en accord avec le protocole de Carthagène en privilégiant une approche au cas par cas. Dans l'éventualité où il n'y a pas d'ADN provenant d'une autre espèce ou d'ADN recombinant dans la plante finale, les autorités argentines considèrent que les plantes issues font l'objet de la même réglementation que les variétés traditionnelles27 ;
Article complet avec Annexes> Wikipédia

Voir également :_OGM & nouveaux OGM : parlons des idées reçues ! Greenpeace France https://www.greenpeace.fr › ogm-nouveaux-ogm-parl...-../../../../C:/Users/JH/Documents/O...« Et les nouveaux OGM, c'est quoi ? Des OGM issus de nouvelles techniques : des techniques d'édition du génome. Et donc, tout comme pour les anciens OGM... »

Europe : bientôt des règles assouplies pour les « nouveaux OGM ... Reporterre https://reporterre.net › Nouveaux-OGM-en-Europe-ci...- « 19 mai 2023 — En juin, la législation européenne encadrant les « nouveaux OGM » pourrait être assouplie, au grand bonheur de l'agro-industrie…

Agriculture : la Commission européenne souhaite réguler les « nouveaux OGM... La Tribune https://www.latribune.fr › union-europeenne › agricult...-22 mai 2023 — Agriculture : la Commission européenne souhaite réguler les « nouveaux OGM » · Renforcer la compétitivité de l'agriculture européenne

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"Des effets involontaires ont été trouvés dans le soja génétiquement modifié (OGM) : ils comprennent des niveaux accrus d'allergènes" par GMWatch

GMWatch — 2023-05-30T09:42:49Z

ISIAS OGM Santé Third World Network Omiques

Des effets involontaires ont été trouvés dans le soja génétiquement modifié (OGM) : ils comprennent des niveaux accrus d'allergènes

Traduction du 29 mai 2023 par Jacques Hallard – avec ajout d'un dossier sur les technologies « omiques » et une présentation de Third World Network - d'un article publié le 18 mai 2023 par ‘gmwatch.org' sous le titre « Unintended effects found in GM soybean include increased levels of allergens » - Référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20226-unintended-effects-found-in-gm-soybean-include-increased-levels-of-allergens

Illustration de soja

L'analyse suivante est fournie parhttps://www.twn.my/Third World Network.

[Addenda - Technologies « omiques » : les principaux sujets d'étude omiques menant à la connaissance d'un phénotype]

Source : https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/27/Omics-fr.svg/langfr-520px-Omics-fr.svg.png

***

Traduction de l'article original de ‘gmwatch.org' >

Une étude récente propose un moyen plus avancé et approfondi d'évaluer les changements potentiels dans le profil de composition des plantes cultivées génétiquement modifiées (OGM), afin d'évaluer les effets non intentionnels ayant des implications potentielles sur la salubrité des aliments.

En utilisant des techniques avancées de profilage moléculaire 'omique' qui peuvent évaluer les changements globaux des niveaux d'ARN, de protéines et de métabolites dans une plante, l'étude sur un soja OGM a révélé une gamme de changements involontaires dans le profil de composition, y compris des niveaux accrus d'allergènes et de 70 protéines qui étaient exprimés différemment par rapport à l'homologue conventionnel non-OGM. Les scientifiques ont conclu que ces changements ont une signification biologique potentielle, avec une altération de plusieurs voies métaboliques (liées à la synthèse et au traitement des protéines).

Les processus actuels d'évaluation des risques utilisent généralement une approche 'ciblée' pour évaluer les changements potentiels aux profils nutritionnels et antinutritionnels des plantes OGM, où un nombre limité de composants sont évalués. Même si des changements significatifs sont détectés par rapport à son homologue non génétiquement modifié, les autorités chargées de la régulation jugent généralement la différence 'non biologiquement significative', si les niveaux se situent dans ceux observés dans d'autres plantes.

[Addenda – Equivalence substantielle - « Principe utilisé pour réguler la production et le commerce des nouveaux aliments, comme ceux issus des biotechnologies (OGM). Il indique que, si un aliment ou un composé alimentaire est essentiellement semblable à un aliment ou à un composé alimentaire existant, il peut être traité de la même manière en ce qui concerne la sécurité…] –

[Le principe d'équivalence en substance ou d'équivalence substantielle (traduction de l'anglais substantial equivalence) est un principe controversé, utilisé depuis les années 1990 dans l'Industrie alimentaire, promu par les industriels pour que les produits alimentaires ultra-transformés ou ceux issus des biotechnologies (OGM) soient cadrés par les mêmes règles et législations que les aliments non-transformés. Il présuppose que, si un aliment transformé ou un composé alimentaire est essentiellement (en termes composition chimique et de nutriments) semblable à un aliment ou à un composé alimentaire existant, il peut être traité de la même manière en ce qui concerne la sécurité alimentaire 1. Ce principe appliqué à un OGM, signifie que si cet OGM est jugé « équivalent en substance » à son équivalent naturel ou issu de l'agriculture conventionnelle ou d'une production biotechnologie, il sera déclaré aussi « sain » que l'autre. Cependant, des objections argumentées ont été faites, notamment quant à sa pertinence éthique2,3 et quant à sa validité scientifique, difficilement démontrable2,3 pour l'évaluation des risques ; selon ses détracteurs, entre autres défauts, il présuppose, sans preuve, que l'équivalence en substance implique une équivalence nutritionnelle ; et il ne compare que la composition chimique de deux aliments alors que les effets de matrices biologiques ou les interactions entre protéines et d'autres molécules ont des effets également très importants en termes de nutrition et de toxicologie). En 1999, dans le journal Nature, Miller, ancien créateur et directeur (de 1989 à 1993) de l'Office de la Biotechnology à la FDA, et ancien membre du groupe d'experts de l'OCDE sur la sécurité des biotechnologies (de 1984 à 1992) estimait qu'on a usé et abusé de ce concept (qu'il a contribué à introduire à la FDA) et qu'il est injustement décrié4…. – Article complet sur ce site : https://fr.wikipedia.org/wiki/Principe_d%27%C3%A9quivalence_en_substanc ]

[Voir également : https://www.infogm.org/+-Equivalence-substantielle-+ ]

Suite de l'article traduit >

Ce concept d' 'équivalence substantielle' a longtemps été critiqué comme inadéquat et arbitraire. En effet, en pratique, ce principe permet de comparer une lignée transgénique à n'importe quelle autre variété au sein de l'espèce, et même à une entité abstraite constituée du composite de caractères sélectionnés parmi toutes les variétés.

L'approche alternative de 'biologie des systèmes' entreprise par les auteurs de l'étude avec l'utilisation de techniques de profilage global fournit plutôt une analyse non ciblée et non supervisée qui réduit les biais, offre une chance supplémentaire de détecter des changements involontaires tels que de nouvelles toxines ou allergènes, et permet de comparer des composés ou des molécules pertinents pour chaque culture GM, plutôt qu'à une liste prédéterminée de composés. L'élargissement de la gamme de composés permet également à l'évaluation des risques de se tenir au courant des changements dans le progrès technique des cultures GM qui peuvent impliquer des niveaux d'intervention plus profonds et donc une complexité accrue des changements potentiels.

[Addenda - La biologie des systèmes (ou biologie intégrative) est un domaine récent de la biologie qui étudie les organismes vivants comme les systèmes qu'ils sont en réalité, par opposition aux approches historiques qui tendent à décomposer l'étude à tous les niveaux, en biologie, physiologie, biochimie… La biologie systémique cherche à intégrer différents niveaux d'informations pour comprendre comment fonctionne réellement un système biologique. En étudiant les relations et les interactions entre différentes parties du système biologique (organites, cellules, systèmes physiologiques, réseaux de gènes et de protéines permettant la communication des cellules), le chercheur tente de former un modèle de fonctionnement de la totalité du système. Si la biologie des systèmes est un domaine théorisé à la fin du XXe siècle, plusieurs biologistes et chimistes ont travaillé dans ce sens dès la fin du XIXe siècle (par exemple le biologiste et chimiste français Marcellin Berthelot qui privilégiait une approche systémique et synthétique de la biochimie). La biologie moléculaire des systèmes commence avec l'étude des gènes et des protéines d'un organisme, en utilisant la technique HTS (high-throughput screening, criblage à haut débit) pour quantifier les changements dans le génome, le transcriptome, le protéome et le métabolome en réponse à une perturbation donnée. Cette technique consiste à effectuer de manière automatique des centaines de fois la même opération, en pharmacologie par exemple, pour trouver une molécule qui convient. L'analyse à haut débit du transcriptome s'effectue à l'aide de puces à ADN. Pour détecter les différentes protéines, on utilise par exemple la HTS avec la spectrométrie de masse. D'autres approches en biologie des systèmes ne privilégient pas le niveau moléculaire et cherchent au contraire à intégrer les niveaux d'organisation de manière plus large1. - Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Biologie_des_syst%C3%A8mes ]

Suite de l'article traduit >

Comme le concluent les auteurs, 'Sur la base des résultats générés par l'approche proposée dans notre étude, nous concluons que l'évaluation comparative selon les directives actuelles de l'EFSA n'est pas adaptée à l'objectif et doit être améliorée.'

Au lieu de cela, une 'approche de biologie des systèmes basée sur une perspective holistique peut être plus informative dans l'évaluation des risques que l'analyse ‘endpoint-by-endpoint' actuellement utilisée pour l'évaluation des effets involontaires potentiels dans une plante OGM'.

[Addenda – Endpoint - Point final - Terme similaire : critère biologique. Définition : un critère d'effet biologique est un marqueur direct de l'évolution d'une maladie - par exemple les symptômes d'une maladie ou le décès - utilisé pour décrire un effet sur la santé (ou une probabilité de cet effet) résultant de l'exposition à un produit chimique. Source : GreenFacts : GreenFacts

En savoir plus : L'exposition à un produit chimique particulier peut entraîner une série de critères d'évaluation. L'effet le plus sensible (effet critique) est celui qui se produit au niveau d'exposition le plus bas. Le calcul d'une dose journalière tolérable (DJT) ou d'une dose journalière acceptable (DJA) est basé sur la dose sans effet nocif observé (NOAEL) de l'effet le plus sensible et garantit également une protection contre tous les autres effets nocifs. Source : GreenFacts : GreenFacts

Source : https://ec.europa.eu/health/scientific_committees/opinions_layman/perfume-allergies/en/glossary/def/endpoint.htm ]

Suite et fin de l'article traduit >

GMWatch préconise depuis longtemps d'inclure des analyses 'omiques' dans l'évaluation des risques des cultures GM anciennes et nouvelles. Jusqu'à présent, cela ne s'est pas produit.

***

Intégration des analyses omiques dans l'évaluation des risques liés aux OGM en Europe : une étude de cas d'essais de soja sur le terrain

Auteurs : Benevenuto, R. F., Zanatta, C. B., Waßmann, F. et coll.

Environ Sci Eur 35, 14 (2023) - https://doi.org/10.1186/s12302-023-00715-6

Résumé

En Europe, les organismes génétiquement modifiés (OGM) sont soumis à un processus d'autorisation incluant une évaluation obligatoire des risques. Selon les directives respectives de l'Autorité européenne de sécurité des Aliments (EFSA), l'un des piliers de cette évaluation des risques liés aux OGM est une analyse comparative des caractéristiques de composition et agronomiques.

Cette approche ciblée a été critiquée pour ses limites, car elle ne considère que les composés prédéterminés, étant insuffisante pour évaluer une gamme complète de composés pertinents, y compris les toxines et les anti-nutriments, au cas par cas.

Des stratégies fondées sur des technologies omiques avancées non ciblées ont été proposées comme approche potentiellement plus large à mettre en œuvre à l'étape initiale du cadre d'évaluation des risques. Ici, nous fournissons un exemple d'analyse omique étape par étape basée sur une approche de biologie des systèmes pour s'inscrire dans le contexte de la réglementation européenne sur les OGM.

Nous avons effectué des essais sur le terrain avec du soja Intacta ™ Roundup Ready ™ 2 Pro génétiquement modifié (OGM) contenant à la fois des inserts transgéniques cry1Ac et cp4epsps et analysé son profil protéomique par rapport à son homologue non OGM et aux variétés de référence.

Sur la base de l'approche comparative point final par point final de l'EFSA, l'analyse protéomique a révélé six protéines de l'OGM en dehors des intervalles de tolérance de 99% des variétés de référence (RV) dans le test d'équivalence. Fait intéressant, à partir du comparateur quasi-isogénique (non GM), nous avons trouvé jusqu'à dix protéines en dehors des limites d'équivalence desdites RVs.

Selon les directives statistiques de l'EFSA, les différences constatées dans l'abondance des métabolites entre un OGM et son comparateur non OGM ne seraient pas considérées comme biologiquement pertinentes car tous les composés préoccupants restaient dans les limites d'équivalence des VR commerciaux.

En évaluant les données protéomiques et métabolomiques grâce à notre approche de biologie systémique proposée, nous avons trouvé 70 protéines et le métabolite xylobiose exprimés de manière différentielle entre l'OGM et son comparateur non OGM.

La pertinence biologique de ces résultats a été révélée par une analyse de réseau biologique fonctionnel, où nous avons trouvé des altérations dans plusieurs voies métaboliques liées à la synthèse et au traitement des protéines.

De plus, l'analyse de l'allergénicité a identifié 43 protéines au potentiel allergène exprimées de manière différentielle dans la variété de soja OGM. Nos résultats démontrent que la mise en œuvre de technologies omiques avancées non ciblées dans l'évaluation des risques des OGM permettra une évaluation précoce et holistique des effets néfastes possibles.

L'approche proposée peut permettre de mieux comprendre les effets involontaires spécifiques de la modification génétique sur le métabolisme de la plante, les réseaux biologiques impliqués et leurs interactions, et permet de formuler et d'étudier des hypothèses de risque dédiées en premier lieu.

Nous tirons des conclusions sur une comparaison détaillée avec l'évaluation comparative selon l'EFSA et nous fournissons des arguments scientifiques et des exemples sur la façon dont l'approche comparative actuelle n'est pas adaptée à son objectif.

§§§ - Addenda >

Third World Network (TWN) est une organisation internationale indépendante de recherche et de plaidoyer à but non lucratif impliquée dans les questions relatives au développement, aux pays en développement et aux affaires Nord-Sud.

TWN a été formé en novembre 1984 à Penang, en Malaisie, lors de la session de clôture d'une Conférence internationale sur 'Le Tiers Monde : Développement ou crise ? 'organisé par l'Association des consommateurs de Penang et auquel ont participé plus d'une centaine de participants de 21 pays. Lors de cette conférence, TWN a été formé pour renforcer en particulier la coopération entre les groupes de la société civile du Sud.

Sa mission est de favoriser une meilleure articulation des besoins et des droits des peuples du Sud, une répartition équitable des ressources mondiales et des formes de développement écologiquement durables et répondant aux besoins humains.

Les objectifs de TWN sont d'approfondir la compréhension des dilemmes et des défis de développement auxquels sont confrontés les pays en développement et de contribuer aux changements de politique dans la poursuite d'un développement juste, équitable et écologiquement durable.

Pour atteindre ces objectifs, TWN mène des recherches sur les questions économiques, sociales, sanitaires et environnementales relatives au Sud ; publie des livres et des magazines ; participe aux processus intergouvernementaux ; organise et participe à des conférences, séminaires et ateliers ; et fournit une plate-forme représentant largement les intérêts et les perspectives du Tiers Monde dans des forums internationaux tels que les agences des Nations Unies, en particulier la FAO, l'OMS et l'OMPI , ainsi que l'OMC, la Banque mondiale et le FMI.

Le site Web de TWN contient des informations sur l'économie, la santé, l'environnement et d'autres questions du point de vue du développement. Il existe également un site Web dédié à la biosécurité. Des traductions sélectionnées en chinois mandarin des documents Web de TWN sont disponibles sur http://twnchinese.net .

TWN est légalement enregistrée en Malaisie avec son Secrétariat international à Penang et des bureaux à Kuala Lumpur (Malaisie), Genève (Suisse) et Delhi (Inde). Des chercheurs sont basés à Pékin, au Caire, à Jakarta, à Katmandou, à Manille et à New York. Le Secrétariat régional pour l'Amérique Latine est situé à Montevideo (Uruguay) et le Secrétariat régional pour l'Afrique à Accra (Ghana). Source : About TWN

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Annexe - Un dossier sur les technologies « omiques »

Les sciences « omiques » ? - Du nouveau pour la biologie moléculaire et pour la planète – Publié le 16 décembre 2018, 21:26 CET par The Conversation France'

Auteur :

https://cdn.theconversation.com/avatars/421825/width170/image-20190619-171252-19sa4gf.jpg Gilles MirambeauMaître de conférences, Sorbonne Université Paris
Déclaration d'intérêts - Gilles Mirambeau ne travaille pas, ne conseille pas, ne possède pas de parts, ne reçoit pas de fonds d'une organisation qui pourrait tirer profit de cet article, et n'a déclaré aucune autre affiliation que son organisme de recherche.

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En 1944, quand Erwin Schroedinger publia son fameux essai « What is life ? », qui révolutionna la vision moléculaire du vivant, on était très loin de s'imaginer où nous conduirait la dynamique qu'il avait lancé en faisant de la biologie moléculaire une science transversale respectant in fine les principes énergétiques de la planète.

La nouvelle discipline s'est articulée autour de la biochimie et de la génétique, avec les apports de la physique, de la chimie et de la biologie. La bactérie Escherichia coli et ses virus, les coliphages, servirent alors de modèle de référence pour établir - entre les années 1950 et 1960 - le dogme central de la biologie moléculaire : la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule, protégée de l'extérieur grâce à ses membranes lipidiques, et du rôle des acides nucléiques - ADN et ARN pour la synthèse des protéines.

A l'époque, le biologiste de laboratoire en était encore à l'ère artisanale dans ses pratiques quotidiennes, assisté par des authentiques compagnons, verriers, électriciens, mécaniciens… 75 ans plus tard, les acquis de la biologie moléculaire ont atteint un niveau inouï de complexité. Ils fondent ce qui est désormais l'industrie du vivant.

Cette évolution majeure a été rendue possible par une accélération énorme des progrès technologiques, de la mise en commun des connaissances acquises et de la croissance de la masse critique des chercheurs et chercheuses engagé·e·s dans cette interface multidisciplinaire. Les moyens mis en jeu pour la médecine ont aussi beaucoup contribué à intégrer la biologie moléculaire pour explorer le contexte cellulaire et physiologique de l'être humain. C'est évidemment notre propre organisme examiné à la loupe de la biologie moléculaire qui nous intéresse, plutôt que la modeste Escherichia coli.

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« Omique » : de quoi parle-t-on ?

Ces dernières années, chimie, physique et informatique ont permis de développer des technologies dites « omiques ». Il s'agit de mettre en œuvre une ingénierie d'analyse systématique du contenu du vivant à l'échelle moléculaire. En macromolécules ADN (génomique) ; ARN (transcriptomique) ; protéines (protéomique) ; métabolites cellulaires (métabolomique) ; lipides (lipidomique). Une plate-forme de services technologiques adaptés et fonctionnant à la demande peut désormais, à partir de n'importe quel échantillon contenant de la matière organique, réaliser une méta-analyse de type « omique ».

L'ère « omique » débute en fanfare au début des années 2000 avec l'annonce du séquençage complet de l'ADN du génome humain. Le matériel génétique de l'espèce humaine, codé dans l'ADN a été déchiffré avec ses 3 milliards de nucléotides selon une séquence précisément agencée entre les 4 nucléotides A,T,G et C le long des 23 paires de chromosomes.

Les chercheurs ont poursuivi leurs investigations sur l'ARN et les protéines. Dans les cellules humaines, protéome et transcriptome sont maintenant analysés à partir des milliards de copies traduites (protéome) de tout ou partie des environ 20 000 protéines identifiées et des copies d'ARNs transcrits (transcriptome) représentant des centaines de millions de molécules (quantité extrapolée à partir d'Escherichia coli).

https://images.theconversation.com/files/250031/original/file-20181211-76962-1qiim0r.jpg?ixlib=rb-1.1.0&q=45&auto=format&w=754&fit=clip Agrandir

Diagrammes de Voronoï à partir de l'analyse protéomique de plusieurs organismes modèles. (En haut) Protéocartes annotées par catégorie fonctionnelle. (En bas) Mêmes diagrammes annotés avec les noms des gènes. Adapté de W. Liebermeister et coll., Proc. Natl. Acad. Sci., 111 :8488, 2014._, Author provided

La découverte de la présence massive dans nos organismes d'une grande diversité de microbes incluant les virus est aussi un des résultats majeurs de ces méta-analyses. Le corps humain contient autant de bactéries, toutes espèces confondues que de cellules humaines (environ 40 trillions… Soit 200 grammes pour un individu de 70 kg, et non pas 10 fois plus comme encore souvent annoncé. Les approches « omiques » ont révolutionné la caractérisation de ce microbiote humain.

Dans le domaine de la biodiversité, les technologies « omiques » ont permis d'en savoir plus sur le nombre d'espèces. Le plancton marin, par exemple : la métagénomique a révélé une immense biodiversité microbienne à la surface des océans représentants des 3 règnes primaires (eucaryotes à l'état de protistes, bactéries et archées), sans oublier la multitude de virus qui leurs sont associé. Récemment une analyse métatranscriptomique des protistes prélevés par 68 stations marines du réseau Tara a identifié pour ces microorganismes un total de 116 millions de transcrits d'ARN, témoignant d'une biodiversité inimaginable.

Biologie des systèmes

Ces exemples qui frappent l'esprit illustrent à quel point la voie du réductionnisme qui fut longtemps une force motrice essentielle pour conduire les recherches en biologie moléculaire a été débordée par la complexité du vivant et par la multitude d'innovations à la croisée des chemins entre informatique et biotechnologie, entre académie et « start-up », sous l'influence de la Californie et du Massachusetts.

Dans ce cadre complexe et délicat à appréhender, se dégage une voie nouvelle pour la biologie : on pourrait l'appeler « postomique » et souligner sa vision nécessairement holistique pour traiter du global et du détail en même temps. Nous sommes entrés dans l'ère de la biologie des systèmes.

De fait, l'écologie scientifique, enjeu majeur pour le futur de la planète, s'intéresse de plus en plus aux informations moléculaires accessibles pour influencer la pertinence de ses modèles à l'échelle des écosystèmes. On a cité deux exemples : le plancton marin avec, notamment, sa capacité à produire 50 % de l'oxygène planétaire ; la flore intestinale avec son impact évident sur la santé humaine. Le tout est à replacer dans le cadre de la biomasse planétaire récemment évaluée à environ 550 gigatonnes de carbone.

https://images.theconversation.com/files/250042/original/file-20181211-76968-16fotx.jpg?ixlib=rb-1.1.0&q=45&auto=format&w=754&fit=clip Agrandir

Diagrammes de Voronoï de la biomasse planétaire. A) Biomasse des principaux taxons du monde vivant ; B) Biomasse des taxons animaux. D'après Y. M. Bar-On et coll., Proc. Natl. Acad. Sci. 115 :6506, 2018. Author provided

Face à l'émergence de ces incroyables métadonnées, « macro-micro », le modèle de recherche scientifique toujours en vogue dans beaucoup d'universités et d'organismes de recherche limite terriblement la marge de manœuvre. Cela perdurera tant que l'on restera dans un esprit de court terme, en grande partie fondé sur une compétition entre chercheurs générant trop de pression, de précarité et d'échec.

Pour être à la hauteur de sa mission de long terme, le scientifique doit vite retrouver une perspective ouvrant sur un avenir plus fécond, collaboratif et participatif.

Revenons aux sciences « omiques » et à leur utilité pour le futur. Elles peuvent aider à l'émergence de concepts prometteurs comme le biomimétisme. La grande idée est de faire en sorte que l'économie et l'écologie n'aillent plus l'une sans l'autre]. Pourra alors s'ouvrir une nouvelle ère bio-inspirée. La « postomique » à l'échelle mésoscopique est bien au cœur d'un futur fondé sur des sciences et des technologies qui permettent le mieux pour l'humanité et la planète. La toile d'araignée contre le plastique.

nouvelles technologies biotechnologies biologie génome

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Omique traité en détail par Wikipédia - Ne doit pas être confondu avec Ohmique.

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Les principaux sujets d'étude omiques menant à la connaissance d'un phénotype.

Les branches de la science connues sous le nom d'omiques (ou -omiques) sont constituées de diverses disciplines de la biologie dont les noms se terminent par le suffixe « -omique », comme la génomique, la protéomique, la métabolomique, la métagénomique et la transcriptomique 1. Les « omiques » visent la caractérisation et la quantification collectives de pools de molécules biologiques qui se traduisent par la structure, la fonction et la dynamique d'un ou plusieurs organismes : le tout étant souvent utilisé pour décrire ou comprendre un phénotype.

Le suffixe -ome est utilisé pour désigner les objets d'étude de ces domaines, tels que le génome, le protéome ou le métabolome respectivement. « -ome » tel qu'il est utilisé en biologie moléculaire fait référence à une sorte de « totalité » (« globalité »).

Étymologie

« -Ome » trouve son origine dans une variante de la terminaison grecque -ωμα (« -oma ») et s'emploie de plus en plus à partir du XIX e siècle. Il apparaissait à l'origine dans des termes comme sclérome ou rhizome. Tous ces termes dérivent de mots grecs en -ωμα, une séquence qui n'est pas un suffixe unique, mais analysable comme -ω-μα, le -ω- appartenant au radical du mot (généralement un verbe) et le -μα étant un véritable suffixe grec formant des noms abstraits. C'est un exemple de « néo-suffixe » formé par abstraction de divers termes grecs en -ωμα ; séquence qui ne formait pas un suffixe identifiable en grec.

L'Oxford English Dictionary suggère que sa troisième définition est issue d'une rétroformation de mitome. Les premières attestations incluent biome (1916) et génome (d'abord défini sous le nom « Genom » en allemand par Hans Winkler en 1920 2).

L'association avec « chromosome » en biologie moléculaire est due à une étymologie hasardeuse : le mot dérive des racines grecques χρωμ(ατ)- « couleur » et σωμ(ατ)- « corps ». Alors que σωμα (« corps ») contient véritablement le suffixe -μα, le -ω- qui le précède n'est pas un suffixe formateur de racine mais fait partie de la racine du mot. Étant donné que « génome » fait référence à la composition génétique complète d'un organisme, un néo-suffixe -ome fait ici référence à la « totalité » ou à l'« achèvement ».

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Un tournant historique est marqué vers la création des omiques lorsqu'en 1944 Erwin Schrödinger publie son essai Qu'est-ce que la vie ?1

La nouvelle discipline s'articule alors autour de la biochimie et de la génétique, avec les apports de la physique, de la chimie et de la biologie. La bactérie Escherichia coli et ses virus, les coliphages, servirent alors de modèle de référence pour établir entre les années 1950 et 1960 la théorie fondamentale de la biologie moléculaire : la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule, protégée de l'extérieur grâce à ses membranes lipidiques, et du rôle des acides nucléiques -ADN et ARN pour la synthèse des protéines.

Les bioinformaticiens et les biologistes moléculaires furent parmi les premiers scientifiques à appliquer largement les suffixes « -ome »/« omique » dans le quatrième quart du XXe siècle. Parmi les premiers utilisateurs de cette idée figuraient les bioinformaticiens de Cambridge (Royaume-Uni), où se trouvaient les premiers laboratoires de bioinformatique tels que le centre MRC3, le centre Sanger et l'EBI (Institut européen de bio-informatique). Le centre MRC réalisa les premiers projets sur le génome et le protéome.

Applications

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2d/Meta-omics_data_based_biogeochemical_modeling.jpg/220px-Meta-omics_data_based_biogeochemical_modeling.jpg Agrandir

(en) Modélisation biogéochimique à partir de différentes -omiques (2017)

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1c/S%C3%A9quen%C3%A7age_omique_microbiologie.png/220px-S%C3%A9quen%C3%A7age_omique_microbiologie.png Agrandir

Séquençage ADN en microbiologie, dans une vidéo du CNRS (2022)

Les domaines d'études et d'applications des omiques ne cessent de croître depuis la fin du XXe siècle, particulièrement avec les avancées informatiques et l'ère d'Internet. Plus récemment, les omiques ont trouvé une nouvelle échelle de recherche dans la multiomique 4, permettant d'associer et de croiser scientifiquement les données de ces différents champs d'applications omiques pour une plus grande finesse d'analyse et de résultats.

Domaines d'études omiques

Génomique : étude du génome de tous types d'organismes.
- Génomique cognitive : étude des changements dans les processus cognitifs associés aux profils génétiques.
- Génomique comparative : étude de la relation entre la structure et la fonction du génome de différentes espèces ou souches biologiques.
- Génomique fonctionnelle : Décrit les fonctions et les interactions des gènes et des protéines (utilise souvent la transcriptomique).
- Métagénomique : étude des métagénomes, c'est-à-dire du matériel génétique récupéré directement dans des échantillons environnementaux5.
- Neurogénomique : étude des influences génétiques sur le développement et la fonction du système nerveux.
- Pangénomique : étude de l'ensemble des gènes ou des génomes présents dans une espèce donnée.
- Génomique personnelle : branche de la génomique qui s'occupe du séquençage et de l'analyse du génome d'un individu. Une fois les génotypes connus, le génotype de l'individu peut être comparé aux publications scientifiques afin de déterminer la probabilité d'expression d'un trait et son risque de maladie. C'est une branche de la médecine personnalisée.

L'épigénome est le support du génome, des fixateurs de protéines et d'ARN, les structures alternatives de l'ADN et des modifications chimiques sur l'ADN.
- Épigénomique : étude des modifications de l'épigénome d'une cellule. Les technologies modernes employées comprennent la conformation des chromosomes par Hi-C, diverses méthodes de séquençage ChIP-Seq et autres combinées à des fractionnements protéomiques, et des méthodes de séquençage qui cherchent les modifications chimiques des cytosines, comme le séquençage au bisulfite.
- Nucléomique : étude de l'ensemble complet des composants génomiques qui forment le noyau cellulaire (nucléome). Le 4D Nucleome Consortium a officiellement rejoint l'IHEC (International Human Epigenome Consortium) en 2017.

Le lipidome est l'ensemble des cellules lipidiques d'un organisme, y compris les modifications apportées par un organisme à cet ensemble particulier de lipides, produit par un organisme ou un système.
- Lipidomique : étude à grande échelle des voies et des réseaux de lipides. Les techniques de spectrométrie de masse sont utilisées ici.

Le protéome est l'ensemble des protéines, comprenant également les modifications apportées à un ensemble particulier de protéines, par un organisme ou un système.
- Protéomique : étude à grande échelle des protéines, en particulier de leurs structures et de leurs fonctions. Des techniques de spectrométrie de masse sont utilisées.
- Immunoprotéomique : étude de grands ensembles de protéines (protéomique) impliquées dans la réponse immunitaire.
- Nutriprotéomique : identification des cibles moléculaires des composants nutritifs et non-nutritifs de l'alimentation. Utilise les données de spectrométrie de masse de la protéomique, notamment pour l'étude d'expression des protéines.
- Protéogénomique : un domaine émergent de la recherche biologique à l'intersection de la protéomique et de la génomique. Utilisation des données protéomiques pour l'annotation des gènes.
- Génomique structurelle : étude de la structure tridimensionnelle de chaque protéine codée par un génome donné, en utilisant une combinaison d'approches expérimentales et de modélisation.
Le sécrétome est l'ensemble des molécules organiques et inorganiques sécrétées par des cellules, des tissus, des organes et des organismes biologiques.

La glycomique est l'étude complète du glycome, c'est-à-dire des sucres et glucides.

Le transcriptome est l'ensemble de toutes les molécules d'ARN, y compris l'ARNm, l'ARNr, l'ARNt et d'autres ARN non codants, produites dans une ou une population de cellules.
- Transcriptomique : étude des transcriptomes, de leurs structures et de leurs fonctions.

Métabolomique : étude scientifique des processus chimiques impliquant des métabolites. Il s'agit d'une étude systématique des empreintes chimiques uniques que des processus cellulaires spécifiques laissent derrière eux. C'est en d'autres mots l'étude de leurs profils, du stade de métabolites à celui de « petites molécules »6.
Métabonomique : mesure quantitative de la réponse métabolique dynamique multi-paramétrique des systèmes vivants à des stimuli physiopathologiques ou à des modifications génétiques.

Génomique nutritionnelle : une science qui étudie la relation entre le génome humain, la nutrition et la santé. Comme la pharmacogénomique, elle mène à la personnalisation des effets de la nutrition sur un patient7.
- La nutrigénétique étudie l'effet des variations génétiques sur l'interaction entre l'alimentation et la santé, avec des implications pour les sous-groupes sensibles.
- Nutrigénomique : Étude des effets des aliments et de leurs constituants sur l'expression des gènes. Elle étudie l'effet des nutriments sur le génome, le protéome et le métabolome.
La pharmacogénomique étudie l'effet de la somme des variations au sein du génome humain sur les médicaments ;
La pharmacomicrobiomique étudie l'effet des variations du microbiome humain sur les médicaments et vice versa.
Toxicogénomique : domaine scientifique qui traite de la collecte, de l'interprétation et du stockage d'informations sur l'activité des gènes et des protéines dans une cellule ou un tissu particulier d'un organisme en réponse à des substances toxiques.
Autres

Interactomique : étude des interactions entre les différentes molécules biochimiques (par exemple entre protéines différentes ou identiques dans le protéome et dans différents contextes).
Mitointeractomique : prédiction des interactions protéine-protéine, de leurs propriétés physico-chimiques, du polymorphisme et des maladies liées au protéome mitochondrial 8.
Psychogénomique : processus consistant à appliquer les outils de la génomique et de la protéomique pour parvenir à une meilleure compréhension des substrats biologiques et des maladies du cerveau qui se manifestent par des anomalies du comportement. En appliquant la psychogénomique à l'étude de la toxicomanie, le but ultime est de mettre au point des traitements plus efficaces pour ces troubles ainsi que des outils de diagnostic objectifs, des mesures préventives et, éventuellement, des remèdes.
Génomique des cellules souches : aide à la recherche biologique autour des cellules souches. L'objectif est de faire des cellules souches un système-modèle de premier plan pour comprendre la biologie humaine et ses états pathologiques et, finalement, d'accélérer les progrès vers une application clinique.
Connectomique : étude du connectome, la totalité des connexions neuronales du cerveau (ensemble cerveau gauche-cerveau droit-cervelet-gliome-moelle épinière).
Microbiomique : étude des génomes des communautés de micro-organismes qui vivent dans une niche environnementale spécifique (par exemple les intestins ou le cerveau humains).
Article connexe : Microbiome.

Cellomique : l'analyse et l'étude quantitative des cellules à l'aide de méthodes de bioimagerie et de bioinformatique.
Tomomique : Combinaison de la tomographie et des méthodes omiques pour comprendre la biochimie des tissus ou des cellules à haute résolution spatiale, généralement à l'aide de données de spectrométrie de masse par imagerie9.
Ethomique : mesure à haut débit du comportement des animaux par des machines.
Vidéomique (ou « vide-omique ») : paradigme ou technique d'analyse vidéo inspiré des principes de la génomique, où une séquence vidéo (ou « d'images en continu ») peut être interprétée comme la capture d'une image unique évoluant dans le temps par le biais de mutations révélant une scène10.
Multiomique : Intégration de différentes omiques dans une seule étude ou un seul pipeline analytique.
Culture - Ne doit pas être confondu avec Culturomique (biologie). Cette section est vide, insuffisamment détaillée ou incomplète. Votre aide est la bienvenue ! Comment faire ?

Inspirée par des questions fondamentales en biologie de l'évolution, une équipe de Harvard autour de Jean-Baptiste Michel et Erez Lieberman Aiden a créé le néologisme américain « culturomics » (culturomiques) pour décrire l'application de la collecte et de l'analyse de données massives aux études culturelles et artistiques.

Cette pratique tend à se développer avec l'aide de l'informatique et de l'utilisation et de la transcription de données dans de nombreuses formes d'art. Ainsi, loin du processus scientifique d'études biologique et bioinformatiques, il s'agit ici plutôt d'un outil au service de la création.

Article complet avec références sur « omiques » > https://fr.wikipedia.org/wiki/Omique

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Collecte de documents et agencement, traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 29/05/2023

Site ISIAS = Introduire les Sciences et les Intégrer dans des Alternatives Sociétales

Site : https://isias.info/

Adresse : 585 Chemin du Malpas 13940 Mollégès France

Courriel : jacques.hallard921@orange.fr

Fichier : ISIAS OGM Santé Third World Network Omiques .5.docx

http://yonnelautre.fr/local/cache-vignettes/L160xH109/arton1769-a3646.jpg?1510324931

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"Un nouveau rapport présente des alternatives efficaces au glyphosate" par GMWatch

GMWatch — 2023-03-20T10:24:21Z

ISIAS Agriculture Glyphosate Alternatives

Un nouveau rapport présente des alternatives efficaces au glyphosate

Traduction du 17 mars 2023 – avec ajout de compléments sur les alternatives au glyphosate – d'un article publié le 16 mars 2023 par ‘gmwatch.org' sous le titre « New report showcases effective alternatives to glyphosate » ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20196-new-report-showcases-effective-alternatives-to-glyphosate

Les agriculteurs peuvent maintenir leurs rendements et protéger leur santé

Cette année, l'UE décidera de la ‘réapprobation' [renouvellement de l'autorisation] du glyphosate, l'ingrédient actif du Roundup, le désherbant le plus populaire et le plus controversé au monde. L'exposition à l'herbicide présente non seulement un risque pour la santé humaine et d'autres organismes vivants, mais menace également la biodiversité et l'avenir de l'agriculture.

Publié en collaboration avec les Verts européens, le nouveau rapport de PAN Europe montre qu'il existe des alternatives non chimiques beaucoup plus sûres pour toutes les principales utilisations connues des herbicides à base de glyphosate (GBH) et comment la transition vers un système agricole sans glyphosate est économiquement réalisable.

[Addenda - Le Parti Vert Européen est un parti politique européen créé le 22 février 2004 à Rome. Il est composé de 36 partis écologistes nationaux dans 32 États d'Europe, dont des états non-membres de l'Union Européenne. Il prend la succession de la Fédération européenne des Partis verts. Wikipédia ]

[Addenda – Voir aussi > L'Union paneuropéenne internationale qui est une association fondée au lendemain de la Première Guerre mondiale, en 1926 à Vienne, par le comte Richard Coudenhove-Kalergi qui a publié en 1923 son livre-manifeste ... Wikipédia ]

Il existe une idée fausse très répandue selon laquelle les herbicides sont sans danger pour la santé humaine et ont peu d'impact sur l'environnement. Les systèmes agricoles traditionnels dépendent désormais presque entièrement de l'utilisation d'herbicides, y compris le glyphosate.

La gestion des mauvaises herbes est l'un des défis majeurs de l'agriculture, en particulier dans les systèmes de cultures arables et maraîchères, mais il existe d'autres solutions au glyphosate.

Le Dr Charles Merfield, expert mondial de la gestion non chimique des mauvaises herbes et auteur principal du rapport, déclare : « La gestion des mauvaises herbes sans herbicides agrochimiques est tout à fait faisable. Les agriculteurs et les producteurs biologiques le font depuis plus de 70 ans ! Les scientifiques et les entreprises de machines ont accumulé une énorme expérience, expertise et science, et ont développé des techniques et de nombreuses machines pour la gestion non chimique des mauvaises herbes.'

Comme le montre le rapport, il existe des alternatives plus sûres de faible et de haute technologie au glyphosate dans la gestion des mauvaises herbes. Les agriculteurs peuvent maintenir leurs rendements, éviter que les mauvaises herbes renforcent leur résistance, protéger la santé et la biodiversité des sols et minimiser l'érosion. En parallèle, ils protègent leur propre santé et celle de leur famille et de leurs voisins.

Le Dr Merfield ajoute : « Le passage à la gestion non chimique des mauvaises herbes nécessite des changements dans le système agricole plus large, principalement la diversification, comme une gamme plus large de cultures et de bétail, dans une rotation. Cela aura de multiples avantages pour la ferme et l'environnement partagé, par exemple, la santé des sols, la biodiversité, moins de nouvelles entités (telles que les produits agrochimiques) dans l'environnement, une eau et un air plus propres, etc. Passer d'une gestion des mauvaises herbes dominée par les herbicides à une gestion intégrée des mauvaises herbes, axée sur des techniques non chimiques n'est donc pas un risque, mais plutôt une énorme opportunité d'améliorer tous les aspects des systèmes agricoles, y compris la rentabilité.

Téléchargez le rapport : https://issuu.com/pan-uk/docs/alternative_20methods_20in_20weed_2

Source : PAN Europe - Contenu 1999 - 2023 GMWatch. Développement Web par SCS Web Design

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Ajout de compléments sur les alternatives au glyphosate

Offre d'emploi : on recherche des alternatives au glyphosate - Pierre-joseph Delorme - Publié le 15 décembre 2020 – Document ‘ENTRAID'

https://www.entraid.com/wp-content/uploads/2020/12/alternatives-glyphosate-700x388.jpg

Classement par degrés d'efficacité des alternatives au glyphosate.

Des alternatives au glyphosate existent et sont souvent connues. Mais l'efficacité des différents leviers peut parfois laisser perplexe.

Dans la gamme de produits autorisés, le glyphosate n'a pas d'équivalent et cela depuis 1974, année de son homologation. Son avis de décès est pratiquement rédigé et la cérémonie devrait avoir lieu à la fin de l'année 2022. A cette date, le prolongement de son utilisation à l'échelle européenne sera tranché. Quelles sont les alternatives au glyphosate ?

Des alternatives au glyphosate classées par efficacité

Des alternatives existent, on le voit par exemple dans l'agriculture biologique ou le labour et même le labour superficiel revient en force. Dans le tableau ci-dessous produit par Arvalis, il semble même cocher presque toutes les cases. Par contre c'est une alternative couteuse, gourmande en temps et forte consommatrice de GNR. A l'heure où l'Europe vient de fixer de nouveaux objectifs de réduction des émissions de gaz à effet de serre, la solution parait inadéquate. Il y a aussi des situations qui rendent cette alternative difficile. Dans des sols superficiels, caillouteux ou en forte pente. Les adeptes de l'agriculture de conservation, dont pour beaucoup le glyphosate est indispensable, vont devoir changer leur fusil d'épaule.

Tableau efficacité des différents leviers par Arvalis

Tableau d'efficacité des différentes alternatives au glyphosate par Arvalis

Vers du travail superficiel

La méthode qui semble la plus adéquate est le travail superficiel sur une profondeur de 8-15 cm mais réalisé par temps séchant. Même principe que pour un binage efficace. Même constat pour le travail très superficiel entre 0-8 cm. Pour cette solution, des constructeurs se sont emparés du problème. Des outils scalpeurs font leur apparition.

Un autre éventail de solutions

D'autres alternatives existent. Les couverts végétaux pour étouffer les adventices. Des rotations plus longues à adapter. Même si cela est plus facile à écrire qu'à réaliser. Le désherbage électrique, thermique ou encore à micro-ondes semblent efficaces. A réserver à des cultures à forte valeur ajoutée. Le fauchage andainage avant récolte qui permet de couper aussi certaines adventices avant la montée à graine.

La solution passe peut être simplement par un mixe de toutes ces solutions. Suivant le climat, le type de culture ou de sol. D'ici là, des surprises peuvent arriver. Comme des dérogations pour certaines formes d'agriculture.

Quel Outil pour désherber comme un glyphosate ?

De nouvelles restrictions d'usage pour le glyphosate

"Le glyphosate provoque directement des troubles du développement et la mortalité des chrysopes vertes (insectes auxiliaires, ennemis naturels de certains ravageurs des plantes cultivées)" par GMWatch

GMWatch — 2023-02-15T21:05:35Z

ISIAS Pesticides Glyphosate Chrysopes

Le glyphosate provoque directement des troubles du développement et la mortalité des chrysopes vertes (insectes auxiliaires, ennemis naturels de certains ravageurs des plantes cultivées)

Traduction du 15 février 2023 – avec compléments sur les chrysopes – par Jacques Hallard d'un article intitulé Glyphosate directly causes impaired development and mortality in lacewing diffusé par ‘gmwatch.org' ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20173-glyphosate-directly-causes-impaired-development-and-mortality-in-lacewing

chrysopidae insect green lacewing

‘Third World Network' résume les résultats d'une nouvelle étude

[Third World Network est une ONG et un réseau international d'organisations et d'individus engagés dans les causes de l'environnement, du développement et des relations Nord-Sud, avec notamment le problème de la dette du tiers monde… - Source ]

Les effets des herbicides sur les arthropodes non ciblés ne sont testés que de manière superficielle, car on part du principe que les herbicides ne tuent les insectes qu'indirectement, en tuant leurs plantes hôtes. Cependant, une nouvelle étude montre que l'exposition orale directe peut être très importante pour les pesticides systémiques tels que les herbicides à base de glyphosate. Dans les systèmes de culture, y compris les cultures de plantes génétiquement modifiées tolérantes au glyphosate, ces herbicides et leurs produits de dégradation sont ingérés par les insectes utiles associés aux cultures.

L'étude a testé les effets de l'absorption orale de la formulation ‘WeatherMax' de Roundup sur les larves de la chrysope Chrysoperla carnea, en dessous des doses d'application recommandées. L'exposition orale à long terme des larves de C. carnea pendant tous les stades de vie juvénile a entraîné un arrêt du développement, une altération de la formation des cocons et une forte mortalité.

Le danger causé par l'action insecticide directe des herbicides à base de glyphosate, après absorption orale, est très pertinent pour la sécurité environnementale et révèle une lacune dans les évaluations des risques réglementaires qui devrait être comblée de toute urgence, en particulier à la lumière du déclin actuel des insectes.

Source du commentaire : Third World Network

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A Roundup herbicide causes high mortality and impairs development of Chrysoperla cornea (Stephens) (Neuroptera : Chrysopidae) - (Un herbicide Roundup provoque une forte mortalité et nuit au développement de Chrysoperla cornea (Stephens) (Neuroptera : Chrysopidae)) - N. Defarge, M. Otto & A. Hilbeck
Science of The Total Environment, Volume 865, 2023 -

https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.161158

www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969722082614 ?via%3Dihub

23 décembre 2022

Résumé

Le glyphosate a été et est encore largement utilisé dans les formulations d'herbicides dans le monde entier. Ainsi, les herbicides à base de glyphosate (GBH) ajoutent considérablement à la charge environnementale des pesticides et justifient une évaluation stricte des risques.

Les tests écotoxicologiques des herbicides se concentrent sur les plantes non ciblées et les animaux supérieurs, tandis que les effets directs sur les arthropodes ne sont testés que de manière superficielle, sur la base d'une exposition par contact.

Cependant, l'exposition orale, comme nous le montrons dans notre cas, peut être très pertinente pour les pesticides systémiques, tels que le GBH. Plus précisément, dans les systèmes de culture comprenant des cultures de plantes génétiquement modifiées tolérantes au GBH, ces herbicides et leurs produits de dégradation sont présents à l'intérieur et à l'extérieur des plantes cultivées et, par conséquent, sont ingérés par la faune arthropode associée aux cultures.

Nous avons testé les effets de l'absorption orale de la formulation ‘WeatherMax' de Roundup sur les larves de la chrysope Chrysoperla carnea, un organisme modèle dans les programmes de tests d'écotoxicité. L'exposition orale à long terme des larves de C. carnea tout au long de ses stades de vie juvéniles, a été testée avec des concentrations allant de 0,001 à 1 % de dilution, donc inférieures au 1,67 % qui est recommandé pour les applications sur le terrain.

L'inhibition de la métamorphose était observable à 0,1 %, mais à une concentration de 0,5 %, le GBH a considérablement entravé la formation des cocons et a entraîné des malformations létales massives. A une concentration de GBH de 1 %, la moitié des individus sont restés des larves permanentes et aucun adulte n'a éclos vivant. Les effets observés ont suivi une relation dose-réponse claire.

Le danger causé par l'action insecticide directe du GHB après absorption orale est très pertinent pour la sécurité environnementale et révèle une lacune dans les évaluations des risques réglementaires qui devrait être comblée de toute urgence, en particulier à la lumière du déclin actuel des insectes.

Source : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20173-glyphosate-directly-causes-impaired-development-and-mortality-in-lacewing

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Compléments d'après Wikipédia

La chrysope verte (Chrysoperla carnea), parfois appelée demoiselle aux yeux d'or, est une espèce d'insectes de la famille des chrysopidés, ordre des névroptères. Elle constitue un ennemi naturel de certains ravageurs en horticulture et arboriculture. Synonyme ancien : Chrysopa carnea

Reconnaissance des chrysopes - Les adultes mesurent de 10 à 15 mm. Leurs ailes membraneuses (25 mm) sont transparentes. Le corps et les nervures des ailes sont verts (rosissent en automne quand l'insecte recherche un abri pour hiverner)1. Les yeux sont dorés. Les antennes sont longues et filiformes.

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/94/Zeudkrizop.jpg/220px-Zeudkrizop.jpg

Œufs de chrysope sur feuille d'olivier.

Les larves (7 à 8 mm) sont jaune-grisâtre/vert-brun avec deux bandes longitudinales rouges. Elles sont munies de pièces buccales piqueuses-suceuses pour capturer leurs proies et en aspirer le contenu. Sur les côtés, elles sont pourvues de verrues et de poils.

Les œufs, de forme elliptique et de couleur verdâtre, portés sur un long filament sont pondus sur les feuilles au voisinage des colonies des futures proies.

Sur l'image des œufs de chrysope, on peut remarquer une colonie de psylles de l'olivier (Euphyllura olivina) sur la gauche, qui constitue une bonne réserve de nourriture pour les futures larves de chrysope.

Régime alimentaire et importance pratique

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/85/Chrysope_larve.jpg/250px-Chrysope_larve.jpg

Larve de chrysope sur feuille d'olivier couverte de fumagine, probablement en quête de larves L1 de Saissetia oleae pour se nourrir.

Les adultes se nourrissent de miellat et de pollen. Les larves s'attaquent aux œufs, aux larves et aux adultes de divers insectes (cochenilles, pucerons et chenilles de plusieurs espèces de lépidoptères) ainsi qu'aux acariens (araignées rouges entre autres). Au cours de son développement, une larve de chrysope peut se nourrir de plus de 500 pucerons ; en une heure, 30 à 50 araignées rouges peuvent être dévorées.

L'activité de ces insectes permet de réguler la prolifération des ravageurs de certaines cultures. Les chrysopes permettent de réduire l'utilisation d'insecticides contre les pucerons et autres petits arthropodes nuisibles, ce qui a ainsi une action favorable sur la protection de l'environnement.

Sensibilité et protection - Les chrysopes vertes, et les larves plus particulièrement, sont sensibles aux produits phytosanitaires. Elles sont actives de mai à septembre : deux ou trois générations se succèdent. Il faut utiliser pendant cette période des produits phytosanitaires qui n'agissent pas sur les chrysopes. Les œufs sont sensibles aux huiles et la plupart des stades sont sensibles aux esters phosphoriques et produits chlorés. Ils tolèrent la plupart des fongicides.

Le maintien de haies permet de conserver des espèces animales et végétales utiles. Les haies permettent aux chrysopes adultes de trouver en lisière du verger le miellat et le pollen nécessaires à leur subsistance et à leur reproduction ainsi que des abris pour passer l'hiver.

Une étude a enregistré un taux de mortalité important chez des larves de chrysope nourries de chenilles de ver du cotonnier ayant survécu à l'ingestion de maïs Bt 2

Lutte biologique Chrysoperla carnea est un auxiliaire de lutte biologique contre la cochenille noire de l'olivier 3.

Références

 Michael Chinery, Insectes de France et d'Europe occidentale, Paris, Flammarion, août 2012, 320 p. (ISBN 978-2-08-128823-2), p. 106-107

  Page de l'INRA [archive] faisant référence à : Hilbeck A. et al., 1998. Effects of transgenic Bacillus thuringiensis cornfed prey on mortality and development time of immature Chrysoperla carnea (Neuroptera : Chrysopidae). Environmental Entomology, 27(2), 480-487

 Villenave-Chasset J., Etude de Bio-écologie des Névroptères dans une perspective de lutte biologique par conservation [archive], Institut National d'Horticulture (Université d'Angers), 2006
Voir aussi - Bibliographie

Documents des stations fédérales de Changins (Chrysopes et hémérobes et les auxiliaires : plus que de simples croqueurs de ravageurs), d'ArboSud (Les auxiliaires en verger : Chrysope et Syrphes) et du Nouvel Olivier (Fumagine et Cochenille et Fumagine, cochenille, Métaphycus : les stratégies de lutte). Nouvel Olivier mai/juin 1999, p. 12.

Articles connexes : Oléiculture Coccinelles

Certains Syrphes dont le Syrphe ceinturé (Episyrphus balteatus) aux larves prédatrices de pucerons.

Sur les autres projets Wikimedia : Chrysope verte, sur Wikimedia Commons

Liens externes

(en) Référence Fauna Europaea : Chrysoperla carnea(Stephens, 1836) [archive] (consulté le 11 janvier 2022)
(en) Référence BioLib : Chrysoperla carnea(Stephens, 1836) [archive]
(en) Référence Catalogue of Life : Chrysoperla carnea(Stephens, 1836) [archive] (consulté le 11 janvier 2022)
(fr) Référence INPN : Chrysoperla carnea(Stephens, 1836) [archive] (TAXREF [archive])
Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Chrysope_verte

Autres sources d'information sur les chrysopes :

https://www.jardiner-autrement.fr/fiches-techniques/les-chrysopes/

https://jardinage.ooreka.fr/astuce/voir/311806/utilite-des-chrysopes

https://www.vignevin-occitanie.com/fiches-pratiques/les-chrysopes/

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Collecte des documents et agencement, traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 15/02/2023

Site ISIAS = Introduire les Sciences et les Intégrer dans des Alternatives Sociétales

http://www.isias.lautre.net/

Adresse : 585 Chemin du Malpas 13940 Mollégès France

Courriel : jacques.hallard921@orange.fr

Fichier : ISIAS Pesticides Glyphosate Chrysopes..2.docx

http://yonnelautre.fr/local/cache-vignettes/L160xH109/arton1769-a3646.jpg?1510324931

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"Des résultats génomiques inattendus dans les techniques des modifications génétiques actuelles et de la prochaine génération : conclusion résumée d'une nouvelle étude importante de l'organisation ‘Third World Network'" par GMWatch

GMWatch — 2023-02-06T10:45:04Z

ISIAS OGM Résultats génomiques inattendus

Des résultats génomiques inattendus dans les techniques des modifications génétiques actuelles et de la prochaine génération : conclusion résumée d'une nouvelle étude importante de l'organisation ‘Third World Network'

Traduction du 04 février 2023 – et ajout d'informations sur le Séquençage de troisième génération , sur les INDEL et sur les technologies ‘omics'- par Jacques Hallard, d'un article en date du 02 février 2023, publié par ‘gmwatch.org' sous le titre « Unintended genomic outcomes in current and next generation GM techniques » ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20170-unintended-genomic-outcomes-in-current-and-next-generation-gm-techniques

Le génie génétique classique et les nouvelles techniques d'édition du génome ou édition génomique, en particulier la technologie CRISPR/Cas, augmentent les possibilités de modification du matériel génétique dans les organismes vivants. Des préoccupations légitimes en matière de sécurité découlent des modifications génétiques involontaires qui ont été signalées comme des effets secondaires de ces techniques.

Un article récent a systématiquement examiné la littérature scientifique pour les études qui ont étudié les altérations génomiques involontaires chez les plantes génétiquement modifiées.

[Voir par exemple : OGM : mutations involontaires sur des embryons humains version PDF par Christophe NOISETTE - Date de rédaction / mise à jour : 2 avril 2021 – Source : https://www.infogm.org/7157-ogm-mutations-involontaires-embryons-humains ].

Il a montré une gamme d'impacts de telles techniques sur les génomes de l'hôte, allant de petits polymorphismes nucléotidiques (variations de la séquence d'ADN qui se produisent lorsqu'un seul nucléotide – adénine, thymine, cytosine ou guanine – dans la séquence du génome est modifié et l'altération particulière est présente dans au moins 1% de la population), jusqu'à une grande variation génomique.

Il a également révélé un manque évident d'informations détaillées sur les plans expérimentaux dans les publications examinées. Comme les résultats inattendus sont directement corrélés au type de méthode analytique utilisée pour étudier les altérations de la séquence d'ADN, la plupart des articles pourraient sous-estimer ces effets, en raison du manque de tests dédiés.

Les auteurs concluent qu'il est nécessaire de développer des cadres liés à des rapports appropriés et à des installations expérimentales dédiées, ainsi qu'à la définition de la pertinence biologique des données générées. De nouveaux outils, tels que le séquençage de troisième génération, sont également nécessaires pour permettre une évaluation complète des risques. Comme les nouvelles technologies évoluent constamment, un examen plus approfondi des méthodes d'analyse prospectives devrait être effectué à l'avenir. Cela fournira aux organismes de réglementation, travaillant dans le domaine des organismes génétiquement modifiés, des informations précieuses sur la capacité de détecter et d'identifier les interventions génomiques.

Nous reproduisons ci-dessous le résumé et les conclusions de l'article.

Source du commentaire : ‘Third World Network' (Réseau du Tiers Monde) https://biosafety-info.net/articles/biosafety-science/emerging-trends-techniques/unintended-genomic-outcomes-in-current-and-next-generation-gm-techniques/

Welcome to Third World Network (TWN) >

[Third World Network (TWN) est une organisation internationale indépendante de recherche et de plaidoyer à but non lucratif impliquée dans les questions relatives au développement, aux pays en développement et aux affaires Nord-Sud.

TWN a été formé en novembre 1984 à Penang, en Malaisie, lors de la session de clôture d'une Conférence internationale sur 'Le Tiers Monde : Développement ou crise ? ' organisé par l'Association des consommateurs de Penang et auquel ont participé plus d'une centaine de participants de 21 pays. Lors de cette conférence, TWN a été formé pour renforcer en particulier la coopération entre les groupes de la société civile du Sud.

Sa mission est d'apporter une plus grande articulation des besoins et des droits des peuples du Sud, une répartition équitable des ressources mondiales et des formes de développement écologiquement durables et répondant aux besoins humains.

Pour atteindre ces objectifs, TWN mène des recherches sur les questions économiques, sociales, sanitaires et environnementales relatives au Sud ; publie des livres et des magazines ; participe à des processus intergouvernementaux ; organise et participe à des conférences, séminaires et ateliers ; et fournit une plate-forme représentant largement les intérêts et les perspectives du Tiers Monde dans des forums internationaux tels que les agences des Nations Unies, en particulier la FAO, l'OMS et l'OMPI , ainsi que l'OMC, la Banque mondiale et le FMI.

Le site Web du TWN contient des informations sur l'économie, la santé, l'environnement et d'autres questions du point de vue du développement. Il existe également un site Web dédié à la biosécurité. Des traductions sélectionnées en chinois mandarin des documents Web de TWN sont disponibles sur http://twnchinese.net.

TWN est légalement enregistrée en Malaisie avec son Secrétariat international à Penang et des bureaux à Kuala Lumpur (Malaisie), Genève (Suisse) et Delhi (Inde). Des chercheurs sont basés à Pékin, au Caire, à Jakarta, à Katmandou, à Manille et à New York. Le Secrétariat Régional pour l'Amérique Latine est situé à Montevideo (Uruguay) et le Secrétariat régional pour l'Afrique est à Accra (Ghana)…]

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Résultats génomiques non intentionnels dans les techniques de modifications génétiques (GM) actuelles et de prochaine génération : une revue systématique

Auteurs : Chu, P. et Agapito-Tenfen, S. Z. (2022). Plantes, 11(21), 2997 - https://doi.org/10.3390/plants11212997 - https://www.mdpi.com/2223-7747/11/21/2997 - 07 Novembre 2022

[NORCE Norwegian Research Centre AS, Climate & Environment Division, Siva Innovasjonssenter, Sykehusvn 21, 9019 Tromsø, Norway - * Author to whom correspondence should be addressed].

Résumé

Le génie génétique classique et les nouvelles techniques d'édition du génome, en particulier la technologie CRISPR/Cas, augmentent les possibilités de modification du matériel génétique dans les organismes vivants. Ces technologies ont le potentiel de fournir de nouveaux caractères agricoles, y compris des micro-organismes modifiés et des applications environnementales.

Cependant, des préoccupations légitimes en matière de sécurité découlent des modifications génétiques involontaires (GM) qui ont été signalées comme effets secondaires de ces techniques. Ici, nous examinons systématiquement la littérature scientifique pour les études qui ont étudié les altérations génomiques involontaires chez les plantes modifiées par les techniques GM suivantes :

Transfert de gènes médié par Agrobacterium tumefaciens, bombardement biolistique et CRISPR-Cas9 délivré via un transfert de gène médié par Agrobacterium (basé sur l'ADN), bombardement biolistique (basé sur l'ADN) et sous forme de complexes ribonucléoprotéiques (RNP).

Les résultats de notre revue de la littérature montrent que l'impact de telles techniques sur les génomes de l'hôte varie de petits polymorphismes nucléotidiques à de grandes variations génomiques, telles que la duplication segmentaire, la troncature chromosomique, la trisomie, la chromothripsie, la rupture du pont de fusion, y compris de grands réarrangements de séquences ADN vecteur-squelette.

Nous avons également examiné le type de méthode analytique appliquée pour étudier les altérations génomiques et avons constaté que seuls, cinq articles utilisaient le séquençage du génome entier dans leurs méthodes d'analyse. De plus, des variations structurelles plus importantes détectées dans certaines études ne seraient pas possibles sans stratégies de séquençage à longue lecture, ce qui montre une sous-estimation potentielle de ces effets dans la littérature.

Comme les nouvelles technologies évoluent constamment, un examen plus approfondi des méthodes d'analyse prospectives devrait être effectué à l'avenir. Cela fournira aux organismes de réglementation travaillant dans le domaine des organismes génétiquement modifiés des informations précieuses sur la capacité de détecter et d'identifier les interventions génomiques.

Conclusions et orientations futures

Cette revue systématique a révélé un manque évident d'informations détaillées sur les plans expérimentaux dans les publications examinées, ce qui a posé une limitation à notre méta-analyse. Dans le contexte d'altérations involontaires de l'ADN, nous avons trouvé une gamme de réarrangements de séquences différentes allant de l'introduction de petits ‘INDEL' à des duplications chromosomiques à longue séquence.

La littérature montre que les résultats inattendus sont directement corrélés au type de méthode analytique utilisée pour étudier les altérations de la séquence d'ADN et que la plupart des articles pourraient avoir une sous-estimation de ces effets en raison du manque de tests dédiés.

Nous n'avons trouvé aucune ligne directrice ou tendance méthodologique concernant la conception expérimentale, le choix de la méthode d'analyse et l'analyse statistique. Par conséquent, pour une mise en œuvre réglementaire efficace de ces tests, il est nécessaire de développer des cadres liés à des rapports appropriés et à des configurations expérimentales dédiées.

Plus important encore, il est nécessaire d'établir un cadre pour la définition de la pertinence biologique des données générées. Nous avons observé le même schéma lorsque nous avons étudié les altérations des analyses de profil protéomique et métabolomique des plantes génétiquement modifiées.

Néanmoins, l'absence de méthodes harmonisées semble être due aux progrès rapides des technologies ‘omics', plutôt qu'à des rapports incohérents. Cela peut être observé même à partir de la courte fenêtre d'articles vieux de cinq ans, analysés dans cette étude.

En résumé, nous concluons que les nouvelles techniques génomiques, telles que les techniques de séquençage, sont des outils appropriés pour dépister de manière exhaustive les altérations des plantes génétiquement modifiées en raison de leur débit élevé et de leur nature non ciblée. Compte tenu de la rapidité de développement des nouveaux OGM, de nouveaux outils tels que le séquençage de troisième génération sont nécessaires pour permettre une évaluation complète des risques.

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Annexe sur le Séquençage de troisième génération

Séquençage longue lecture : Oxford Nanopore Technology (ONT)

Présentation de la technologie de séquençage troisième génération.

La technologie de séquençage à lecture longue (Long-read sequencing) proposée par ONT (Oxford Nanopore Technologies) est basée sur la détection d'un courant différentiel lors du passage d'une molécule unique linéaire à travers un nanopore biologique ancré dans une membrane synthétique. Le nanopore est un capteur de flux ionique qui varie selon l'encombrement stérique du composé qui le traverse, ce qui permet d'identifier la séquence d'un brin l'ADN sur une grande longueur (jusqu'à plusieurs Mb) quelle que soit sa composition en éléments répétés, en régions riche en GC ou méthylées.

https://igdr.univ-rennes.fr/sites/igdr.univ-rennes.fr/files/styles/petit_largeur_25_/public/medias/images/FC-20210428-0007.JPG?itok=2qblToXT

Ce type de technologie de séquençage peut être utilisé dans de nombreuses applications biologiques (de manière non exhaustive) :

Recherche fondamentale en génomique :
- Résoudre les régions difficiles à séquencer (i.e. répétitions) avec des lectures ultra longues.
- Identifier les modifications chimiques ARN / ADN (méthylation, acétylation) par séquençage direct.

Recherche sur l'ARN
- Annoter et quantifier les transcrits complets à l'aide de longues lectures (connectivité directe des exons).
- Explorez les modifications épitranscriptomiques (e.g. m6A) grâce au séquençage direct de l'ARN.

Recherche clinique
- Cartographier des variants structuraux complexes (SV), incluant les insertions d'éléments transposables.
- Phaser les variants en utilisant de longues lectures.

Microbiome
- Assembler des génomes complets.
- Séquencer sur le lieu de l'échantillonnage (compte tenu de la portabilité)
  
  https://igdr.univ-rennes.fr/sites/igdr.univ-rennes.fr/files/styles/petit_largeur_25_/public/medias/images/FC-20210428-0010.png?itok=wdZg1cC4

Projet IGDRion : MinION@IGDR

Ce projet vise à résumer les informations concernant le processus d'utilisation de la technologie de séquençage MinION à l'IGDR.

Les informations sont également accessibles via :

a GitHub public repositories dédiés pour les outils développés/utilisés par l'équipe.
a GitLab private repo pour le suivi spécifique des projets.
Localisation : Le minION est localisé sur le Campus de Villejean, Bâtiment 4, IGDR, salle 015 - Rez de Chaussée).

Système - Nous avons :

2 MK1B (MinION) dont un en collaboration avec Dominique Lavenier et Emeline Roux.
1 MK1C
1 GridION en prêt via un projet du Cancéropôle Grand Ouest (Drs David Gilot, Aurélien Sérandour et Pierre-François Carton).

https://igdr.univ-rennes.fr/sites/igdr.univ-rennes.fr/files/styles/moyen_largeur_50_/public/medias/images/IMG_3034.JPG?itok=_9Pn2ULB

Formulaire de demande d'utilisation du séquenceur Nanopore : Lire la suite à la source

Contacts :

Thomas DERRIEN Equipe Génétique du Chien thomas.derrien@univ-rennes1.fr +33 (0)2 23 23 65 34

Edouard CADIEU Equipe Génétique du Chien edouard.cadieu@univ-rennes1.fr +33 (0)2 23 23 44 84

Ailleurs sur le web... https://nanoporetech.com/

CNRS

Inserm

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Annexe sur les INDEL selon Wikipédia

Indel est un mot-valise utilisé en génétique et en bio-informatique pour désigner une insertion ou une délétion dans une séquence biologique (acide nucléique ou protéine) par rapport à une séquence de référence. On peut observer en particulier mettre en évidence des indels lorsqu'on effectue des comparaisons au moyen de programmes d'alignement de séquences. Le terme indel a été introduit parce que la notion d'insertion ou de délétion est relative suivant le choix de la séquence utilisée comme référence : à une insertion dans une séquence correspond une délétion dans la séquence qui lui est comparée. Indel permet ainsi de désigner globalement la variation biologique, sans préjuger de quelle séquence constitue la référence. Le mot indel a été inventé par le mathématicien Joseph Kruskal 1.

Les indels sont la conséquence de mutations génétiques donnant lieu à des variations de séquence, soit au sein de la même espèce (c'est un exemple de variation allélique), soit entre espèces, au cours de l'évolution. On estime par exemple que le génome humain contiendrait environ 500 000 sites polymorphiques correspondant à des indels2…

Source de l'article complet sur ce site : https://fr.wikipedia.org/wiki/Indel

Accès à des sources d'informations concernant les technologies ‘omics'

La métabolomique, étude des métabolites issus de l'organisme ou provenant de l'environnement, se situe en aval de la génomique (étude de l'ensemble des gènes), de la transcriptomique (étude de l'ensemble des ARN messagers) et de la protéomique (étude de l'ensemble des protéines).

NB. Faire ‘copier-coller' pour avoir accès aux références choisies ci-après :

Génomique 1, transcriptomique, protéomique ... – Leem https://www.leem.org › sites › default › files –PDF - Génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique…

Métabolomique – Phylogene https://www.phylogene.com › Technologies -La métabolomique est l'étude de l'ensemble des métabolites (petites molécules) présents dans un organite, une cellule, un tissu, un organe ou un organisme ...

Métabolome : définition et explications – AquaPortail https://www.aquaportail.com › ... › Lexique mots -2 févr. 2022 — Le métabolome interagit et reflète l'activité du génome, du transcriptome et du protéome. Bien que les données d'expression de l'ARNm des gènes ...

Nouvelles approches : analyse du protéome et du transcriptome https://www.edimark.fr › Front › frontpost › getfiles –PDF - de F Pinet — transcriptomique, protéomique et métabolomique … la même stratégie de recherche de biomarqueurs ... Obtenir le profil d'expression des gènes par analyse. 6 pages

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Collecte du document, traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 05/02/2023

Site ISIAS = Introduire les Sciences et les Intégrer dans des Alternatives Sociétales

http://www.isias.lautre.net/

Adresse : 585 Chemin du Malpas 13940 Mollégès France

Courriel : jacques.hallard921@orange.fr

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"L'exposition au glyphosate pendant la grossesse est liée à un poids de naissance plus faible : la source d'exposition la plus probable est la nourriture et les boissons, dont la plupart contiennent du glyphosate" par GMWatch

GMWatch — 2022-11-09T12:33:26Z

ISIAS Pesticides Santé Grossesse

L'exposition au glyphosate pendant la grossesse est liée à un poids de naissance plus faible : la source d'exposition la plus probable est la nourriture et les boissons, dont la plupart contiennent du glyphosate

Traduction par Jacques Hallard d'un article du 03 novembre 2022 publié par ‘gmwatch.org' sous le titre « Glyphosate exposure in pregnancy linked to lower birth weights » ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20124-glyphosate-exposure-in-pregnancy-linked-to-lower-birth-weights

Nina Wcześniak baby in incubator.jpg

Nina Wcześniak : bébé en couveuse.jpg - Image d'un bébé de faible poids de naissance par Aneta Meszko, Marcin Meszko, via Wiki Commons. Sous licence Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-SA 3.0).

L'exposition au glyphosate pendant la grossesse est liée à un poids de naissance inférieur chez les bébés, selon une nouvelle étude menée auprès de femmes enceintes. Un poids de naissance inférieur est lié à de nombreux problèmes de santé plus tard dans la vie, du diabète aux problèmes cardiaques.

Le désherbant Glyphosate est utilisé sur la plupart des cultures de plantes génétiquement modifiées dans le monde, qui sont conçues pour tolérer les pulvérisations de ce produit.

Dans l'étude, publiée en octobre 2022 dans ‘Environmental Health', les chercheurs ont également constaté que les mères dont la grossesse était à haut risque et qui présentaient des taux de glyphosate plus élevés dans leur urine au cours du premier trimestre, étaient également plus susceptibles d'avoir des bébés admis dans des unités de soins intensifs néonatals, ou USIN.

L'exposition prénatale au glyphosate a été liée à des résultats reproductifs indésirables dans des études animales, mais avant la publication de cette étude, on savait peu de choses sur les effets de l'exposition au glyphosate pendant la grossesse chez les êtres humains.

Des niveaux de glyphosate dans l'urine supérieurs à la limite de détection (0,1 ng/mL) ont été trouvés chez 186 des 187 (99%) femmes enceintes de l'étude.

Les auteurs affirment que la source d'exposition la plus probable est la nourriture et les boissons, dont la plupart contiennent des résidus de glyphosate.

Le Dr Paul Winchester, co-auteur de l'étude et professeur de pédiatrie clinique à la faculté de médecine de l'université de l'Indiana aux Etats-Unis, a déclaré à la publication environnementale EHN : 'Pratiquement toutes les grandes maladies chroniques dont on souffre à l'âge adulte peuvent être liées au fait d'être plus petit à la naissance.'

Selon John Meeker, professeur de sciences de la santé environnementale à l'école de santé publique de l'université du Michigan aux Etats-Unis, qui n'a pas participé à l'étude, la nouvelle étude vient s'ajouter à un ensemble de preuves, peu nombreuses mais de plus en plus fréquentes, établissant un lien entre le désherbant le plus couramment utilisé dans le monde et les risques potentiels pour la grossesse, dans une interview accordée à EHN.

Compte tenu de la littérature sur les animaux, montrant les handicaps congénitaux et les effets néfastes du glyphosate sur la reproduction, Meeker a ajouté que la nouvelle étude 'met vraiment en lumière la nécessité de réaliser davantage d'études dans ce domaine'.

La nouvelle étude : Glyphosate exposure in early pregnancy and reduced fetal growth : a prospective observational study of high-risk pregnancies (Exposition au glyphosate en début de grossesse et croissance fœtale réduite : une étude observationnelle prospective de grossesses à haut risque). Auteurs : Roy R. Gerona, Jill L. Reiter, Igor Zakharevich, Cathy Proctor, Jun Ying, Robin Mesnage, Michael Antoniou et Paul D. Winchester. Environmental Health 21, Numéro d'article : 95 (2022)

https://ehjournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12940-022-00906-3

GMWatch Home - Contact Us About Donations - Contenu 1999 - 2022 GMWatch. Développement Web par SCS Web Design – Source : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20124-glyphosate-exposure-in-pregnancy-linked-to-lower-birth-weights

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Traduction par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 09/
11/2022

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"La matière active à effet herbicide glyphosate traverse la barrière hémato-encéphalique dans le cerveau selon une nouvelle étude" par GMWatch

GMWatch — 2022-08-07T05:46:53Z

ISIAS Pesticides Glyphosate

La matière active à effet herbicide glyphosate traverse la barrière hémato-encéphalique dans le cerveau selon une nouvelle étude

Traduction du 05 août 2022 – avec ajout de compléments scientifiques - par Jacques Hallard d'un article publié le 29/07/2022 par ‘gmwatch.org' sous le titre « New study shows glyphosate crosses blood-brain barrier » ; référence : https://www.gmwatch.org/en/106-news/latest-news/20080-new-study-shows-glyphosate-herbicide-crosses-blood-brain-barrier

Voir un schéma explicatif complet (en anglais) de l'article d'origine

Un lien est établi avec une prévalence accrue de la maladie d'Alzheimer dans les communautés agricoles qui utilisent ce produit chimique, la matière active à effet herbicide glyphosate !

Les maladies neurodégénératives, telles que la maladie d'Alzheimer, sont parmi les plus déroutantes de la science médicale. Les causes sous-jacentes de ces maladies vont des facteurs génétiques et de la santé cardiovasculaire globale aux influences alimentaires et aux choix de mode de vie.

Divers contaminants environnementaux ont également été impliqués en tant qu'acteurs possibles dans le développement ou l'avancement des maladies neurodégénératives. Parmi ceux-ci se trouve l'herbicide au glyphosate, qui est utilisé en quantités massives sur les cultures de plantes OGM tolérantes au glyphosate. Chaque année, environ 250 millions de livres [soit 11.339.800 de kilogrammes] de glyphosate sont appliquées sur les cultures agricoles aux États-Unis seulement.

Dans une nouvelle étude, Joanna Winstone, assistante de recherche diplômée de l'Arizona State University (ASU), le professeur adjoint Ramon Velazquez et leurs collègues de l'Institut de recherche en génomique translationnelle ont exploré les effets de l'exposition au glyphosate sur le cerveau des souris.

[Pour plus de détails sur des applications, voir : Epigénomique et recherche translationnelle (EPITRANS) -https://www.ibisa.net › plateformes › epitrans-236 – « Développement et exploitation d'outils de génomique (forward et reverse) et d'épigénomique pour l'exploration et la valorisation de la diversité.. » - Ainsi que :

[Médecine translationnelle d'après Wikipédia - La notion de Médecine translationnelle (ou médecine traductionnelle) est une discipline scientifique émergente qui applique au domaine médical les principes de la science translationelle et de la « recherche translationnelle » (lesquels visent à traduire en applications concrètes (sciences appliquées) les théories scientifiques et les découvertes de laboratoire afin de réduire le nombre des besoins médicaux et pharmaceutiques encore insatisfaits)1,2. Initiée en France dans les années 1960 par le cancérologue Georges Mathé [réf. nécessaire], elle s'appuie aussi sur l'épidémiologie interventionnelle3.

Elle décrit dans les services de santé publique ou individuelle les démarches visant à combler le fossé existant entre la science médicale fondamentale et la pratique médicale clinique réelle. Dans le domaine pharmaceutique, il s'agit de faire le pont entre les découvertes théoriques et la production effective de médicaments, en s'appuyant éventuellement sur la pharmacie virtuelle, c'est-à-dire une banque de médicaments créés ou rassemblés de manière collaborative, transparente et selon les principes de l'open source, par exemple pour le traitement de maladies tropicales ou de maladies rares jugées non rentables par l'industrie pharmaceutique. La médecine translationnelle a donc une composante prospective forte. En France, c'est l'un des quatre thèmes prioritaires retenus par le Pôle de compétitivité Medicen Paris Region.

Article complet sur ce site : https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9decine_translationnelle ].

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Les recherches de ces auteurs démontrent pour la première fois que le glyphosate traverse avec succès la barrière hémato-encéphalique et s'infiltre dans le cerveau, selon un reportage de l'Arizona State University.

[La barrière hémato-encéphalique, découverte en 1885, a pour fonction principale d'isoler le système nerveux central (SNC) de la circulation sanguine, en empêchant que des substances étrangères/molécules potentiellement toxiques/agents pathogènes ne pénètrent dans le cerveau et la moelle épinière. 25 mai 2020].

[Voir un article dédié : https://fr.wikipedia.org/wiki/Barri%C3%A8re_h%C3%A9mato-enc%C3%A9phalique ].

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Une fois-là, il agit pour augmenter les niveaux d'un facteur critique connu sous le nom de TNF-α. Le TNF-α est une molécule à deux faces. Cette cytokine pro-inflammatoire remplit des fonctions vitales dans le système neuro-immunitaire, agissant pour améliorer la réponse immunitaire et protéger le cerveau.

[TNF - Facteur de nécrose tumorale – Ne doit pas être confondu avec Famille du facteur de nécrose tumorale.

Les facteurs de nécrose tumorale, ou TNF (de l'anglais : tumor necrosis factors), forment une superfamille de protéines dite superfamille des TNF, dont le membre type est le TNF α, également appelé cachectine, voire cachexine. Ce sont des protéines transmembranaires présentant un domaine homologue dit TNF. Le terme « facteur de nécrose tumorale » sans autre précision fait généralement référence au seul TNF α, importante cytokine impliquée dans l'inflammation systémique et dans la réaction de phase aiguë, qui sera développé dans cet article ; d'autres membres de la famille des TNF portent également d'autres noms, comme le TNF β, qui n'est autre que la lymphotoxine α.

Le TNF α est produit essentiellement par des macrophages activés, mais il peut également être produit par de nombreux autres types de cellules, comme les lymphocytes T auxiliaires, les lymphocytes NK, les granulocytes neutrophiles, les granulocytes éosinophiles, les mastocytes et les neurones. Il a principalement un rôle régulateur des leucocytes. Son action dans l'organisme déclenche la fièvre, l'apoptose, la cachexie, l'inflammation, en vue de combattre la cancérogenèse et la réplication virale ainsi que de répondre au sepsis en activant les cellules productrices d'interleukine 1 et d'interleukine 6. Le dérèglement de la production du TNF α a été impliqué dans un ensemble de maladies humaines telles que la maladie d'Alzheimer 3, le cancer 4, la dépression 5, le psoriasis 6 et les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin 7 (MICI). Bien que controversées, certaines études relatives à la dépression et aux MICI relient ces conditions à des niveaux élevés de TNF8,9. … - Source : https://fr.wikipedia.org/wiki/Facteur_de_n%C3%A9crose_tumorale ].

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Cependant, lorsque les niveaux de TNF-α sont dérégulés, une foule de maladies liées à une neuro-inflammation peuvent en résulter. Parmi ceux-ci se trouve la maladie d'Alzheimer.

L'étude démontre en outre dans des expériences de culture cellulaire, que l'exposition au glyphosate semble augmenter la production de bêta-amyloïde soluble (Aß) et réduire la viabilité des neurones. L'accumulation de bêta-amyloïde soluble, la protéine collante responsable de la formation de plaques bêta-amyloïdes solubles, est l'une des caractéristiques diagnostiques centrales de la maladie d'Alzheimer.

[Lecture suggérée :

Med Sci (Paris). 2006 May ; 22(5) : 462–463. Published online 2006 May 15. doi : 10.1051/medsci/2006225462. Une liaison intraneuronale de peptide β-amyloïde et de protéine Tau solubles pour résoudre la question insoluble de la cause première de la maladie d'Alzheimer - Jacques Epelbaum* - Inserm UMR 549, IFR Broca-Sainte Anne, Universite Rene Descartes-Paris 5, 2 ter, rue d'Alesia, 75014 Paris, France - Corresponding author. *epelbaum@broca.inserm.fr – Source : https://www.ipubli.inserm.fr/bitstream/handle/10608/5777/MS_2006_5_462.html?sequence=6&isAllowed=y ].

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D'autres preuves suggérant des dangers potentiels pour la santé neurologique ont été observées lorsque les chercheurs ont examiné les changements dans l'expression des gènes via le séquençage de l'ARN dans le cerveau des souris après une exposition au glyphosate.

Ces transcrits d'ARN laissaient entrevoir des perturbations dans l'expression des gènes liés aux maladies neurodégénératives, y compris la dérégulation d'une classe de cellules cérébrales responsables de la production de la gaine de myéline essentielle à une bonne communication neuronale. Ces cellules, appelées oligodendrocytes, sont affectées par des niveaux élevés de TNF-α.

[Lecture suggérée : La transcription de l'ADN en ARN > Dossier - Le gène, de l'ADN aux protéines - Claude Sauter - Publié le 06/12/2021 – « La vie d'un gène, de sa duplication à la fabrication d'une protéine pour laquelle il code, est une succession d'étapes cruciales. Ce dossier récapitule simplement tout ce qu'il faut savoir ! » - Source : https://www.futura-sciences.com/sante/dossiers/genetique-gene-adn-proteines-1130/page/4/ ].

[Selon Wikipédia, « Un oligodendrocyte est une cellule de la névroglie interstitielle. Sa principale fonction est la formation de la gaine de myéline entourant les fibres nerveuses (axones) du système nerveux central (SNC), la formation de la myéline au niveau du système nerveux périphérique étant assurée par les cellules de Schwann. La gaine de myéline permet d'augmenter la vitesse de propagation et la fréquence des influx nerveux. Un seul oligodendrocyte est capable de myéliniser jusqu'à 50 axones1. Un oligodendrocyte ainsi que la cellule de Schwann sont composés de 70 % de lipides au niveau du système nerveux central (SNC) et de 80 % de lipides au niveau du système nerveux périphérique (SNP).[pas clair][réf. souhaitée] …

Voir le schéma : Réseau neural simple avec deux cellules gliales – astrocyte et oligodendrocyte].

Source : https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7a/Neuron_glial_cells_diagram_fr.svg/440px-Neuron_glial_cells_diagram_fr.svg.png ].

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“Nous constatons une augmentation du TNF-α dans le cerveau, à la suite d'une exposition au glyphosate”, a déclaré Velazquez, auteur principal de l'article. “Alors que nous examinions la pathologie (de la maladie d'Alzheimer), cela pourrait avoir des implications pour de nombreuses maladies neurodégénératives, étant donné que la neuro-inflammation est observée dans une grande variété de troubles cérébraux.”

Velazquez et Winstone, le premier auteur de l'étude, sont des chercheurs du Centre de recherche sur les maladies neurodégénératives ASU-Banner et de l'École des sciences de la vie de l'Arizona State University.

La recherche est parue dans le numéro actuel du ‘Journal of Neuroinflammation'.

Effets toxiques

La barrière hémato-encéphalique est une couche de cellules empêchant les substances dissoutes dans la circulation sanguine de passer facilement dans le liquide extracellulaire du système nerveux central, où résident les neurones du cerveau.

Les risques pour la santé du cerveau posés par le glyphosate doivent être évalués de manière critique, en particulier pour les personnes constamment exposées à l'herbicide.

“Le lien avec la maladie d'Alzheimer est qu'il y a une prévalence beaucoup plus élevée de la maladie d'Alzheimer dans les communautés agricoles qui utilisent ce produit chimique”, a déclaré Winstone. “Nous essayons d'établir un lien plus basé sur la science moléculaire entre les deux.”

L'étude a exposé des souris à de fortes doses de glyphosate, puis elle a permis de détecter des niveaux élevés de TNF-α dans leur cerveau. Les chercheurs ont ensuite exposé des neurones de souris extraits dans des boîtes de Pétri aux mêmes niveaux de glyphosate que ceux détectés dans le cerveau des souris, observant une augmentation de la bêta-amyloïde et de la mort cellulaire dans les neurones corticaux. Des transcrits d'ARN oligodendrocytaire dérégulés, qui pourraient indiquer une perturbation de la myélinisation, ont été détectés dans les tissus cérébraux.

Pris ensemble, les résultats démontrent une corrélation entre l'exposition au glyphosate et les symptômes classiques de la maladie d'Alzheimer, bien que les auteurs soulignent que beaucoup plus de travail sera nécessaire avant qu'un lien de causalité puisse être établi.

Néanmoins, l'utilisation généralisée de ce produit chimique et les effets perturbateurs mis en évidence dans la présente étude, soulignent la nécessité d'intensifier les recherches. Parmi les questions urgentes auxquelles il reste à répondre figurent :

* Comment une exposition prolongée à faible dose au glyphosate affecte-t-elle le cerveau ?

* Le glyphosate agit-il en synergie avec d'autres produits chimiques présents dans les herbicides courants ? Et…

* Le glyphosate peut-il être détecté post-mortem chez les patients décédés de la maladie d'Alzheimer ?

Source principale : ASU - https://news.asu.edu/20220728-new-study-shows-commonly-used-agricultural-herbicide-crosses-bloodbrain-barrier - Image des auteurs de la nouvelle étude, téléchargeable via l'URL ci-dessus.

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ISIAS

"Changements drastiques des caractéristiques particulières à l'espèce chez le peuplier génétiquement modifié (OGM) fabriqué par la technique CRISPR et mise à jour des techniques du ‘Nouveau génie génétique'" Par GMWatch

"L'herbicide ‘Roundup' à base de glyphosate est lié à des niveaux épidémiques d'une maladie rénale chronique (CKDu) chez les populations des zones rurales du Sri Lanka" par GMWatch

"Une solution alimentaire et climatique pour l'Afrique : remettre au goût du jour les plantes et les cultures négligées ou oubliées : sorgho, millets (fonio, mil, teff…), amarante, aubergine, chou frisé, quinoa, etc…" par GMWatch

Pays

Production
(million de tonnes)

Monde
(%)

Productions - Principaux pays producteurs en millions de tonnes

"Il faut réduire réellement l'emploi des pesticides en agriculture plutôt que de faire de vaines promesses pour défendre les ‘nouveaux Organismes Génétiquement Modifiés' (OGM) - Nouvelles techniques de sélection des plantes" par GMWatch

"Des effets involontaires ont été trouvés dans le soja génétiquement modifié (OGM) : ils comprennent des niveaux accrus d'allergènes" par GMWatch

"Un nouveau rapport présente des alternatives efficaces au glyphosate" par GMWatch

"Le glyphosate provoque directement des troubles du développement et la mortalité des chrysopes vertes (insectes auxiliaires, ennemis naturels de certains ravageurs des plantes cultivées)" par GMWatch

"Des résultats génomiques inattendus dans les techniques des modifications génétiques actuelles et de la prochaine génération : conclusion résumée d'une nouvelle étude importante de l'organisation ‘Third World Network'" par GMWatch

"L'exposition au glyphosate pendant la grossesse est liée à un poids de naissance plus faible : la source d'exposition la plus probable est la nourriture et les boissons, dont la plupart contiennent du glyphosate" par GMWatch

"La matière active à effet herbicide glyphosate traverse la barrière hémato-encéphalique dans le cerveau selon une nouvelle étude" par GMWatch

ISIAS

"Changements drastiques des caractéristiques particulières à l'espèce chez le peuplier génétiquement modifié (OGM) fabriqué par la technique CRISPR et mise à jour des techniques du ‘Nouveau génie génétique'" Par GMWatch

"L'herbicide ‘Roundup' à base de glyphosate est lié à des niveaux épidémiques d'une maladie rénale chronique (CKDu) chez les populations des zones rurales du Sri Lanka" par GMWatch

"Une solution alimentaire et climatique pour l'Afrique : remettre au goût du jour les plantes et les cultures négligées ou oubliées : sorgho, millets (fonio, mil, teff…), amarante, aubergine, chou frisé, quinoa, etc…" par GMWatch

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Productions - Principaux pays producteurs en millions de tonnes

"Il faut réduire réellement l'emploi des pesticides en agriculture plutôt que de faire de vaines promesses pour défendre les ‘nouveaux Organismes Génétiquement Modifiés' (OGM) - Nouvelles techniques de sélection des plantes" par GMWatch

"Des effets involontaires ont été trouvés dans le soja génétiquement modifié (OGM) : ils comprennent des niveaux accrus d'allergènes" par GMWatch

"Un nouveau rapport présente des alternatives efficaces au glyphosate" par GMWatch

"Le glyphosate provoque directement des troubles du développement et la mortalité des chrysopes vertes (insectes auxiliaires, ennemis naturels de certains ravageurs des plantes cultivées)" par GMWatch

"Des résultats génomiques inattendus dans les techniques des modifications génétiques actuelles et de la prochaine génération : conclusion résumée d'une nouvelle étude importante de l'organisation ‘Third World Network'" par GMWatch

"L'exposition au glyphosate pendant la grossesse est liée à un poids de naissance plus faible : la source d'exposition la plus probable est la nourriture et les boissons, dont la plupart contiennent du glyphosate" par GMWatch

"La matière active à effet herbicide glyphosate traverse la barrière hémato-encéphalique dans le cerveau selon une nouvelle étude" par GMWatch

Production
(million de tonnes)

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