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"Les chercheurs scientifiques découvrent encore d’autres erreurs génétiques qui sont dues à l’édition de gènes CRISPR (ou édition génomique) et ils appellent à un meilleur dépistage des effets indésirables car d’importants changements structurels ont été détectés sur les sites ciblés et non ciblés du génome" par GmWatch
Traduction et compléments de Jacques Hallard
lundi 15 novembre 2021, par
ISIAS Génétique CRISPR
Les chercheurs scientifiques découvrent encore d’autres erreurs génétiques qui sont dues à l’édition de gènes CRISPR (ou édition génomique) et ils appellent à un meilleur dépistage des effets indésirables car d’importants changements structurels ont été détectés sur les sites ciblés et non ciblés du génome
Traduction du 13 novembre 2021 par Jacques Hallard d’un article du 06/11/2021 publié par ‘gmwatch.org’ sous le titre « Scientists find yet more genetic errors from CRISPR gene editing » ; accessible sur ce site : https://www.gmwatch.org/en/news/latest-news/19924-scientists-find-yet-more-genetic-errors-from-crispr-gene-editing
Error Button CRISPR gene editing
Des scientifiques de l’université d’Uppsala en Suède ont découvert que l’édition de gènes ou édition génomique par CRISPR-Cas chez le poisson zèbre provoquait d’importants changements structurels sur les sites ciblés et non ciblés (à la fois sur le site d’édition prévu et ailleurs dans le génome).
[On peut aussi consulter :
Prix Nobel de chimie 2020 : à quoi sert la technologie d’édition génomique CRISPR-Cas9 ? Par Irene Lacamp le 07.10.2020 à 12h05 – Source : https://www.sciencesetavenir.fr/fondamental/biologie-cellulaire/a-quoi-sert-la-technologie-d-edition-genomique-crispr-cas9_141256
CRISPR/Cas9 : Définitions et explicationshttps://www.afm-telethon.fr › glossaire › crisprcas9-907... -9 oct. 2020 — Le système CRISPR/Cas9 est un nouveau système simple, rapide et efficace pour couper l’ADN à un endroit précis du génome...].
Suite de l’article traduit
Les sites hors cible peuvent être très similaires au site cible, ce qui signifie que les ’ciseaux génétiques’ peuvent également couper sur ces sites et provoquer des mutations spécifiques non intentionnelles. La publication, qui est actuellement en format pré-impression et n’a pas encore été examinée par des pairs, montre que d’importantes modifications involontaires de l’ADN sont possibles.
Dans l’étude, les scientifiques ont examiné le génome du poisson zèbre après avoir utilisé CRISPR-Cas. Ils ont constaté que d’importantes modifications structurelles (insertions et délétions importantes) s’étaient produites à la fois sur la séquence cible et sur des sites dits ’hors cible’.
Dans le domaine médical, dans lequel les auteurs ont mené leurs recherches, de telles modifications importantes n’avaient été trouvées auparavant que sur le site cible (‘on-target’). Cependant, on a découvert que des modifications importantes hors cible pouvaient se produire dans les plantes. Biswas et al (2020), dans des expériences sur des plantes de riz modifiées par CRISPR, ont trouvé une grande délétion involontaire ’loin en aval du site cible’ - en d’autres termes, hors cible.
[Voir Original research - Investigation of CRISPR/Cas9-induced SD1 rice mutants highlights the importance of molecular characterization in plant molecular breeding Author links open overlay panel
SukumarBiswasa
JiaqiTiana
RongLia
XiaofeiChena
ZhijingLuoa
MingjiaoChena
XiangxiangZhaob
DabingZhangab
StaffanPerssonac
ZhengYuanab
JianxinShia - https://doi.org/10.1016/j.jgg.2020.04.004Get rights and content - Under a Creative Commons license – Source : https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852720300916 ].
Dans l’expérience sur le poisson zèbre, les principaux changements structurels au niveau des régions ‘on-‘ et ‘off-target ‘ont été trouvés à la fois chez les poissons qui se sont développés à partir des œufs injectés et chez leur progéniture.
Ces résultats sont très pertinents pour les applications cliniques de CRISPR-Cas, car de tels effets inattendus pourraient avoir de graves conséquences directes pour les patients.
Dans l’ensemble, il est important que le génome des organismes cibles soit examiné en détail après les expériences CRISPR/Cas, à la fois sur les sites cibles et hors cible, afin de détecter les changements involontaires qui pourraient affecter d’autres sites génétiques.
La plupart des dépistages des effets involontaires de CRISPR sont inadéquats
Les auteurs de l’étude sur le poisson zèbre attirent également l’attention sur l’inadéquation des méthodes généralement utilisées pour dépister les effets non intentionnels dans les organismes modifiés génétiquement ‘OGM)- séquençage à lecture courte et/ou PCR à courte portée. Ils soulignent que le séquençage à long terme doit être utilisé (ce que GMWatch a conseillé à plusieurs reprises dans le contexte des plantes et des animaux d’élevage génétiquement modifiés).
Bien que les chercheurs aient utilisé la PCR à longue portée, ils avertissent que cette méthode seule ’est incapable de capturer les grandes aberrations du génome et les réarrangements génomiques complexes, tels que les ‘chromothripses’ et les délétions de chromosomes entiers’. La détection de tels événements, affirment-ils, nécessite une analyse supplémentaire qui étudie le génome entier de l’organisme modifié.
Ils ont mis au point leur propre méthode de dépistage in vitro, appelée ‘Nano-OTS’, qu’ils suggèrent d’utiliser comme première étape dans l’analyse des effets involontaires, en combinaison avec le séquençage à long terme et d’autres méthodes pour tenter de repérer le plus grand nombre possible d’effets involontaires de l’édition de gènes CRISPR.
Cette dernière étude vient s’ajouter à une longue liste d’études montrant des effets involontaires de l’édition de gènes, telles que recueillies par GMWatch. Cette liste a été récemment mise à jour et le sera encore dans les prochains jours.
[Voir Science supports need to subject gene-edited plants to strict safety assessments - Details - Published : 20 November 2019 – Source : https://www.gmwatch.org/en/news/latest-news/19223 ].
Merci à Testbiotech pour certains éléments de ce commentaire. Analyse supplémentaire par GMWatch.
Le nouveau document publié :
CRISPR-Cas9 induces large structural variants at on-target and off-target sites in vivo that segregate across generations Ida Höijer, Anastasia Emmanouilidou, Rebecka Östlund, Robin van Schendel, Selma Bozorgpana, Lars Feuk, Ulf Gyllensten, Marcel den Hoed, Adam Ameur. bioRxiv. doi : https://doi.org/10.1101/2021.10.05.463186 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.10.05.463186v1
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Sur ISIAS ici > https://isias.lautre.net/spip.php?page=recherche&recherche=%C3%A9dition+g%C3%A9nomique+CRISPR
Sur ‘yonne lautre’ ici > https://yonnelautre.fr/spip.php?page=recherche&recherche=%C3%A9dition+g%C3%A9nomique+CRISPR
Traduction, [compléments] et intégration de liens hypertextes par Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant – 13/11/2021
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Fichier : ISIAS Génétique CRISPR Erreurs génétiques qui sont dues à l’édition de gènes CRISPR ou édition génomique.2.docx
Mis en ligne par le co-rédacteur Pascal Paquin du site inter-associatif, coopératif, gratuit, sans publicité, indépendant de tout parti, géré par Yonne Lautre : https://yonnelautre.fr - Pour s’inscrire à nos lettres d’info > https://yonnelautre.fr/spip.php?breve103
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